More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1056 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1056  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 299 aa  622  1e-177  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000324577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1406  LysR family transcriptional regulator  98.33 
 
 		 299 aa  613  1e-175  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.475015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1453  LysR family transcriptional regulator  79.53 
 
 		 301 aa  507  1e-143  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000245506  normal  0.0938109 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0702  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 307 aa  229  5e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0727527 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2206  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 303 aa  205  8e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000518708  hitchhiker  0.000125224 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0198  putative transcriptional regulator  35.25 
 
 		 296 aa  195  7e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115145  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01500  putative transcriptional regulator  35.59 
 
 		 302 aa  195  7e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.621412 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0810  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 295 aa  195  9e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4121  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 337 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000919638  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0216  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 337 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000393101  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0218  transcriptional regulator, LysR family  35.81 
 
 		 337 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000934146  normal  0.114496 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4242  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 333 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000271565  hitchhiker  0.00200651 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1317  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 301 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00079533 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4524  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 325 aa  178  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3930  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 320 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0309903  normal  0.96448 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2198  LysR family transcriptional regulator  34 
 
 		 311 aa  169  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599935 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.2 
 
 		 299 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3502  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 342 aa  162  7e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000578298  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5653  LysR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 307 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 299 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4580  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 315 aa  159  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.490701 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  31.29 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 298 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3086  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 289 aa  155  9e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0934  LysR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 298 aa  154  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.886955  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0123  transcriptional regulator  31.88 
 
 		 302 aa  154  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0363  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 298 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2693  LysR, substrate-binding  31.65 
 
 		 313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.426832  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 295 aa  152  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2292  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 299 aa  152  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2666  LysR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 299 aa  152  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1199  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  31.19 
 
 		 300 aa  152  7e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1330  transcriptional regulator, LysR family  31.65 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00626709  hitchhiker  0.000619665 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  29.77 
 
 		 299 aa  151  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3191  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0504852  normal  0.2192 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3048  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0118588  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3034  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1434  LysR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 301 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325668  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0388  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 304 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 296 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  29.93 
 
 		 307 aa  149  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3906  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 307 aa  149  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0371  transcriptional regulator, LysR family  29.9 
 
 		 298 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0434666  hitchhiker  0.0000318758 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31220  Transcriptional regulator, LysR family  32.3 
 
 		 308 aa  149  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3187  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 307 aa  149  6e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1015  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 311 aa  149  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0622202 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2868  transcriptional regulator, LysR family protein  31.31 
 
 		 313 aa  149  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0376307  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2663  transcriptional regulator, LysR family  32.76 
 
 		 301 aa  149  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0779415  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2452  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 300 aa  149  7e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3117  LysR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 303 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.396466  normal  0.0204094 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3062  transcriptional regulator, LysR family  31.86 
 
 		 303 aa  148  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1186  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177283  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3363  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0596  LysR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1839  LysR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4204  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3351  transcriptional regulator, substrate-binding, LysR family protein  29.15 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.545822  normal  0.303622 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0872  LysR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1256  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00128178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0953  transcriptional regulator, LysR family  29.83 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255638  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01682  transcription regulator protein  28.01 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2393  transcriptional regulator, LysR family  31.5 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340015 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39900  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3059  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1324  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.230209 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1113  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.800719  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1128  LysR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1185  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0305189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1224  carbonate dehydratase  30.3 
 
 		 313 aa  147  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000421173  normal  0.31799 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2329  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 354 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1646  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 354 aa  146  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1560  LysR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 307 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.987371  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3332  transcription regulator protein  34.22 
 
 		 298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02329  transcription regulator protein  31.19 
 
 		 306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0102283 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3009  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1025  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 336 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.951762  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0178  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0839  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0260  LysR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.026779 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1112  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 336 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358465  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  29.58 
 
 		 302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3221  LysR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.078712  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1296  LysR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 301 aa  146  5e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3953  transcriptional regulator, LysR family  31.08 
 
 		 300 aa  146  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1344  transcriptional regulator, LysR family  30.63 
 
 		 296 aa  146  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00247694  normal  0.0669225 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1470  LysR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 302 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0988  LysR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 302 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29091  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1448  LysR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 302 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0364851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2358  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 321 aa  145  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.985354  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1850  transcriptional regulator, LysR family  29.73 
 
 		 331 aa  145  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0195634 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1833  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 294 aa  145  7.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3101  LysR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 303 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2963  LysR, substrate-binding  30.74 
 
 		 303 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2485  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 313 aa  145  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.434999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0157  LysR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 305 aa  144  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000785598  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2695  LysR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 313 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>