17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0867 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0867  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  627  1e-179  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0890858  normal  0.747224 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2357  hypothetical protein  88.45 
 
 
302 aa  560  1e-158  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0335886  normal  0.0299035 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1619  hypothetical protein  87.46 
 
 
314 aa  556  1e-157  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.175531  normal  0.0226832 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4744  hypothetical protein  57.76 
 
 
304 aa  374  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.111943  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1658  hypothetical protein  60.76 
 
 
305 aa  372  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1182  hypothetical protein  58.72 
 
 
298 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.6386  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2494  hypothetical protein  62.26 
 
 
333 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0109  hypothetical protein  63.4 
 
 
305 aa  364  1e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2728  hypothetical protein  56.86 
 
 
304 aa  345  7e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0756893  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0203  hypothetical protein  60.75 
 
 
316 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3686  hypothetical protein  60.59 
 
 
310 aa  324  9e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.439169  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2447  hypothetical protein  52.4 
 
 
363 aa  227  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.938237 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5360  hypothetical protein  37.34 
 
 
344 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0641445 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4314  hypothetical protein  33.84 
 
 
427 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5090  hypothetical protein  29.43 
 
 
423 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.948231  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5048  hypothetical protein  27.57 
 
 
337 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0131682  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1538  hypothetical protein  26.14 
 
 
337 aa  72  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.292569  normal  0.943893 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>