26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0773 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0773  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0360313  normal  0.913908 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0779  hypothetical protein  96.89 
 
 		 193 aa  388  1e-107  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.128656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1749  hypothetical protein  64.4 
 
 		 195 aa  266  1e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173592 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0638  hypothetical protein  27.11 
 
 		 175 aa  60.8  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0105694  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1282  FixH family protein  23.56 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3782  hypothetical protein  24.69 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222956  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44430  hypothetical protein  24.07 
 
 		 179 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0337511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2609  hypothetical protein  23.6 
 
 		 172 aa  52  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00411707  normal  0.558054 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3825  hypothetical protein  25.77 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19960  cytochrome c oxidase accessory protein CcoH  22.98 
 
 		 167 aa  50.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1567  hypothetical protein  27.84 
 
 		 161 aa  49.3  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1608  hypothetical protein  24.84 
 
 		 176 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.148481  normal  0.0232786 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4260  hypothetical protein  24.84 
 
 		 176 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3578  hypothetical protein  24.22 
 
 		 175 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2069  hypothetical protein  25.81 
 
 		 169 aa  45.4  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.860685  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0718  hypothetical protein  21.74 
 
 		 173 aa  44.7  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.388417  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2421  hypothetical protein  24.38 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000019522  hitchhiker  0.0000597978 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2360  hypothetical protein  32.1 
 
 		 159 aa  44.3  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1989  hypothetical protein  28.92 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.667905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1817  hypothetical protein  24.54 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1876  hypothetical protein  28.75 
 
 		 185 aa  43.9  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1789  hypothetical protein  22.78 
 
 		 171 aa  42.4  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.200799  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1965  hypothetical protein  30.86 
 
 		 159 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0441287  hitchhiker  0.00747997 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2010  hypothetical protein  30.86 
 
 		 159 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.7151  hitchhiker  0.0000000218476 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2111  hypothetical protein  29.63 
 
 		 159 aa  41.6  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0125675  normal  0.439118 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1955  hypothetical protein  24.12 
 
 		 159 aa  41.2  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>