More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0058 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0058  DNA repair protein  100 
 
 		 559 aa  1137    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0145  DNA repair protein RecN  63.95 
 
 		 603 aa  731    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0063  DNA repair protein RecN  96.24 
 
 		 559 aa  1071    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.352457 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3966  DNA repair protein RecN  38.48 
 
 		 556 aa  351  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  37.03 
 
 		 554 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  35.6 
 
 		 552 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  36.14 
 
 		 553 aa  334  3e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  35.6 
 
 		 552 aa  334  3e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  35.96 
 
 		 553 aa  331  2e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  36.14 
 
 		 553 aa  331  2e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  35.6 
 
 		 552 aa  329  7e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  35.96 
 
 		 552 aa  329  8e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  35.78 
 
 		 552 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1151  recombination and repair protein  36.67 
 
 		 554 aa  327  3e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.901201  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  35.42 
 
 		 552 aa  327  3e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  34.7 
 
 		 552 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  34.7 
 
 		 552 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  34.7 
 
 		 552 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  34.7 
 
 		 552 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2877  DNA repair protein recN  35.71 
 
 		 555 aa  320  5e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2739  DNA repair protein recN  35.89 
 
 		 555 aa  318  2e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  36.09 
 
 		 559 aa  315  9.999999999999999e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3359  recombination and repair protein  35.6 
 
 		 553 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0341558 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0761  DNA repair protein RecN  35.52 
 
 		 557 aa  311  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345087  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  35.83 
 
 		 558 aa  312  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2889  recombination and repair protein  36.06 
 
 		 553 aa  312  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000988342  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2976  recombination and repair protein  36.06 
 
 		 553 aa  311  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0819489  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  35.35 
 
 		 553 aa  311  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1376  recombination and repair protein  36.06 
 
 		 553 aa  311  2e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100313  normal  0.0248594 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3096  DNA repair protein RecN  36.61 
 
 		 557 aa  311  2.9999999999999997e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3626  DNA repair protein RecN  35.69 
 
 		 558 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3686  recombination and repair protein  36.59 
 
 		 553 aa  310  5e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00128842  normal  0.127979 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  36.16 
 
 		 567 aa  310  5e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  36.06 
 
 		 554 aa  310  5e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  37.08 
 
 		 568 aa  310  5e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  35.82 
 
 		 553 aa  310  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  35.82 
 
 		 553 aa  310  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  35.82 
 
 		 553 aa  310  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  35.82 
 
 		 553 aa  309  8e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  35.82 
 
 		 553 aa  309  8e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  35.35 
 
 		 554 aa  309  9e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  35.82 
 
 		 553 aa  309  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2482  DNA repair protein RecN  36.9 
 
 		 568 aa  309  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3856  recombination and repair protein  35.82 
 
 		 553 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00344363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  35.82 
 
 		 553 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  36.25 
 
 		 556 aa  307  3e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  35.65 
 
 		 558 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3005  recombination and repair protein  35.82 
 
 		 553 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658292  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1714  DNA repair protein RecN  34.35 
 
 		 557 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  34.28 
 
 		 557 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  36.33 
 
 		 554 aa  302  8.000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0703  DNA repair protein RecN  36.14 
 
 		 557 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.926549  hitchhiker  0.000359109 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0651  DNA repair protein  35.35 
 
 		 559 aa  301  1e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42990  DNA repair protein RecN  35.15 
 
 		 557 aa  301  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  35.4 
 
 		 553 aa  300  5e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  35.4 
 
 		 553 aa  299  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  35.4 
 
 		 553 aa  299  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2651  DNA repair protein  36.79 
 
 		 569 aa  299  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  33.75 
 
 		 557 aa  299  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3096  recombination and repair protein  35.1 
 
 		 553 aa  298  1e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.316238  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  35.4 
 
 		 553 aa  299  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.158329 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  35.4 
 
 		 553 aa  299  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  35.4 
 
 		 553 aa  299  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4729  DNA repair protein RecN  35.79 
 
 		 557 aa  297  4e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366375 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  34.76 
 
 		 552 aa  296  6e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4595  DNA repair protein RecN  35.39 
 
 		 557 aa  296  9e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.202375 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  33.75 
 
 		 565 aa  296  9e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0728  recombination and repair protein  35.04 
 
 		 553 aa  295  1e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118324  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3286  DNA repair protein RecN  33.69 
 
 		 549 aa  295  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539815  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2333  DNA repair protein RecN  33.69 
 
 		 549 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0914  DNA repair protein RecN  34.16 
 
 		 558 aa  295  2e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.473015  normal  0.408005 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0492  DNA repair protein RecN  33.69 
 
 		 549 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2214  DNA repair protein RecN  33.69 
 
 		 549 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725261  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3319  DNA repair protein RecN  33.69 
 
 		 549 aa  295  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  33.69 
 
 		 549 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1475  DNA repair protein RecN  34.5 
 
 		 554 aa  294  2e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.460183  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  35.89 
 
 		 555 aa  294  3e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3329  DNA repair protein RecN  33.51 
 
 		 549 aa  293  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4730  DNA repair protein RecN  35.44 
 
 		 557 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2641  DNA repair protein RecN  35.23 
 
 		 549 aa  293  5e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0963  recombination and repair protein  34.22 
 
 		 553 aa  292  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0199907  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0903  DNA repair protein RecN  35.23 
 
 		 554 aa  290  4e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0832  DNA repair protein RecN  35.23 
 
 		 554 aa  290  4e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.013795  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1300  DNA repair protein RecN  33.51 
 
 		 549 aa  290  6e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00383913  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2421  DNA repair protein RecN  33.57 
 
 		 563 aa  289  1e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.955613  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3602  DNA repair protein RecN  33.04 
 
 		 557 aa  286  5e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779581 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0637  DNA repair protein RecN  34.05 
 
 		 549 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1860  DNA repair protein RecN  35.12 
 
 		 558 aa  286  7e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.457848  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0713  DNA repair protein RecN  34.7 
 
 		 549 aa  286  7e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0259  DNA repair protein RecN  34.7 
 
 		 549 aa  286  9e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  34.7 
 
 		 549 aa  286  9e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0661  DNA repair protein RecN  34.05 
 
 		 549 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5421  DNA repair protein RecN  34.47 
 
 		 591 aa  284  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  34.34 
 
 		 608 aa  282  1e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  33.27 
 
 		 559 aa  281  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3831  DNA repair protein RecN  34.16 
 
 		 549 aa  281  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0907  DNA repair protein RecN  33.69 
 
 		 549 aa  280  5e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.933799  normal  0.849345 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  33.86 
 
 		 556 aa  280  7e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1052  DNA repair protein RecN  34.16 
 
 		 565 aa  279  8e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0932  DNA repair protein RecN  34.81 
 
 		 557 aa  278  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.613915 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>