75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2179 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2179  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  333  5e-91  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.780072  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1852  hypothetical protein  65 
 
 
159 aa  194  5.000000000000001e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.943704 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2141  hypothetical protein  62.94 
 
 
178 aa  189  1e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2180  hypothetical protein  42.22 
 
 
144 aa  63.5  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.907346  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2142  hypothetical protein  39.78 
 
 
158 aa  60.8  0.000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1853  hypothetical protein  40.23 
 
 
158 aa  57.4  0.00000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.954454 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3680  hypothetical protein  36.47 
 
 
111 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.440681 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0338  hypothetical protein  35.71 
 
 
105 aa  55.5  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0345405  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1584  protein of unknown function DUF74  39.29 
 
 
104 aa  54.3  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0876  hypothetical protein  38.1 
 
 
106 aa  54.3  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0904  hypothetical protein  35.71 
 
 
111 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.645309  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0715  hypothetical protein  35.71 
 
 
111 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1667  hypothetical protein  35.71 
 
 
111 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1644  hypothetical protein  35.71 
 
 
111 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0446  hypothetical protein  35.71 
 
 
111 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1433  hypothetical protein  35.71 
 
 
111 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2656  domain of unknown function, putative  35.71 
 
 
111 aa  52.4  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1499  hypothetical protein  35.71 
 
 
104 aa  52  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1822  domain of unknown function, putative  35.71 
 
 
111 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1617  hypothetical protein  35.71 
 
 
104 aa  51.6  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.885217  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1828  hypothetical protein  34.78 
 
 
112 aa  51.2  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0420  hypothetical protein  31.13 
 
 
108 aa  50.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.932362  normal  0.0258218 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5068  hypothetical protein  34.52 
 
 
140 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874502  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3300  hypothetical protein  34.52 
 
 
140 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0398932  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1363  hypothetical protein  34.52 
 
 
104 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5002  hypothetical protein  32.22 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618954  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5217  hypothetical protein  33.33 
 
 
120 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2650  protein of unknown function DUF74  35.71 
 
 
106 aa  48.9  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2460  protein of unknown function DUF74  38.1 
 
 
108 aa  48.9  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000201008  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0034  protein of unknown function DUF74  33.33 
 
 
107 aa  48.5  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.347076  normal  0.179218 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0545  protein of unknown function DUF74  33.33 
 
 
106 aa  48.5  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4477  hypothetical protein  34.52 
 
 
122 aa  48.5  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3577  hypothetical protein  34.52 
 
 
122 aa  48.5  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.631965 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02548  hypothetical protein  33.72 
 
 
108 aa  48.5  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1624  hypothetical protein  35.71 
 
 
105 aa  47.8  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000293634  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1021  hypothetical protein  34.57 
 
 
120 aa  47.4  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0559796  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1015  protein of unknown function DUF74  39.29 
 
 
104 aa  47.4  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.512702  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1357  hypothetical protein  34.52 
 
 
110 aa  47.4  0.00009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0206753  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2426  protein of unknown function DUF74  34.74 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0498449  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0595  hypothetical protein  35.82 
 
 
119 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0734  protein of unknown function DUF74  38.55 
 
 
111 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.639133  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1519  protein of unknown function DUF74  35.71 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0239  hypothetical protein  34.52 
 
 
126 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0426  hypothetical protein  38.1 
 
 
108 aa  45.4  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3855  protein of unknown function DUF74  33.7 
 
 
105 aa  45.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3023  hypothetical protein  29.81 
 
 
106 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.476002  normal  0.201979 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0398  hypothetical protein  33.33 
 
 
106 aa  45.4  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000107451  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3901  protein of unknown function DUF74  30.95 
 
 
126 aa  45.1  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0176  hypothetical protein  34.52 
 
 
106 aa  45.1  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.484532  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0837  hypothetical protein  34.52 
 
 
106 aa  45.1  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.475243  normal  0.0169282 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0165  hypothetical protein  38.1 
 
 
106 aa  45.1  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515735  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1281  hypothetical protein  38.46 
 
 
123 aa  45.1  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0163  hypothetical protein  38.1 
 
 
106 aa  45.1  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000405251  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3728  hypothetical protein  33.33 
 
 
106 aa  44.3  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.015177  hitchhiker  0.00988934 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0300  protein of unknown function DUF74  32.14 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3855  protein of unknown function DUF74  31.03 
 
 
106 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  7.7494e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0999  protein of unknown function DUF74  32.14 
 
 
100 aa  43.9  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2231  protein of unknown function DUF74  34.88 
 
 
111 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286972  normal  0.264106 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2275  protein of unknown function DUF74  29.76 
 
 
109 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2375  protein of unknown function DUF74  30.95 
 
 
108 aa  43.9  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.791935  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1703  hypothetical protein  30.95 
 
 
107 aa  43.9  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.073089  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14850  hypothetical protein  29.76 
 
 
108 aa  43.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.271966  normal  0.284352 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0734  hypothetical protein  32.14 
 
 
106 aa  42.4  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.827812  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2194  hypothetical protein  30.95 
 
 
108 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1926  protein of unknown function DUF74  30.23 
 
 
108 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00341675  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1969  hypothetical protein  28.57 
 
 
107 aa  42  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.674161  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0491  hypothetical protein  33.33 
 
 
123 aa  41.6  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.358346 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0997  hypothetical protein  27.91 
 
 
107 aa  41.6  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.797199  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2464  hypothetical protein  32.56 
 
 
104 aa  40.8  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0965  hypothetical protein  27.91 
 
 
107 aa  40.8  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3636  hypothetical protein  31.88 
 
 
105 aa  40.8  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.517218  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1028  hypothetical protein  27.91 
 
 
107 aa  40.8  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0930  hypothetical protein  27.91 
 
 
107 aa  40.8  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1047  hypothetical protein  27.91 
 
 
107 aa  40.8  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3795  hypothetical protein  26.74 
 
 
108 aa  40.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.338239  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>