220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1438 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1438  DNA replication initiation ATPase-like protein  100 
 
 		 270 aa  556  1e-157  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000684116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1854  putative DnaA family protein  71.37 
 
 		 270 aa  384  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00022151  normal  0.136094 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1622  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  70.56 
 
 		 270 aa  381  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000450483  normal  0.228379 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2110  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  32.42 
 
 		 232 aa  110  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.519557  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0707  chromosomal replication initiator, DnaA  33.33 
 
 		 241 aa  108  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1636  DNA replication initiation factor  31.07 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.118213  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0556  DnaA regulatory inactivator Hda  35.9 
 
 		 243 aa  106  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.842862  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1703  DnaA family protein  31.73 
 
 		 234 aa  105  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822266  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3686  DNA replication initiation factor  31.25 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.504254  decreased coverage  0.00028544 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36850  DNA replication initiation factor  32.85 
 
 		 234 aa  103  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1226  DNA replication initiation factor  30.1 
 
 		 235 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1266  DNA replication initiation factor  30.1 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210974 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1668  DNA replication initiation factor  30.1 
 
 		 235 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4050  DNA replication initiation factor  30.1 
 
 		 235 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2993  DNA replication initiation factor  28.64 
 
 		 234 aa  99  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.553291  hitchhiker  0.00574523 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52010  DNA replication initiation factor  28.37 
 
 		 234 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183499 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4562  DNA replication initiation factor  27.88 
 
 		 234 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.588442  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0949  chromosomal replication initiator, DnaA  31.66 
 
 		 232 aa  96.3  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0267  DnaA-related protein  29.33 
 
 		 260 aa  95.9  6e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1926  DnaA-homolog protein Hda  29.33 
 
 		 237 aa  95.9  7e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0518  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  30.43 
 
 		 245 aa  94.4  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670919 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3194  hypothetical protein  32.12 
 
 		 235 aa  91.3  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158271  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1916  DNA replication initiation factor  31.58 
 
 		 241 aa  89.4  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.139395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1643  DNA replication initiation factor  31.58 
 
 		 236 aa  88.2  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.112989  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2522  DnaA domain-containing protein  35.04 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1343  DNA replication initiation factor  30.05 
 
 		 231 aa  85.9  6e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000127246  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1751  DNA replication initiation factor  30.14 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.712768  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2487  chromosomal replication initiator, DnaA  29.59 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0896  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  27.53 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000881745 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2717  hypothetical protein  27.75 
 
 		 230 aa  81.6  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1838  DNA replication initiation factor  30.62 
 
 		 236 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0197732  normal  0.185347 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2164  DNA replication initiation factor  30.62 
 
 		 236 aa  82  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1967  DNA replication initiation factor  29.67 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0187389  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2877  DNA replication initiation factor  29.95 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1691  DNA replication initiation factor  30.43 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482582  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1576  DNA replication initiation factor  29.95 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.840172  normal  0.181958 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1651  DNA replication initiation factor  29.95 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0364353  hitchhiker  0.000305013 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1643  DNA replication initiation factor  29.95 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.135541  normal  0.709105 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2249  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  29.69 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2848  hypothetical protein  27.49 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1779  DNA replication initiation factor  29.47 
 
 		 236 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000277265  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2499  DNA replication initiation factor  29.47 
 
 		 236 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1823  DNA replication initiation factor  29.47 
 
 		 236 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000711754  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1786  DNA replication initiation factor  29.47 
 
 		 236 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000114863  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3184  DNA replication initiation factor  28.87 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.338412  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2441  DNA replication initiation factor  29.19 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.689375  normal  0.0202229 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1132  DNA replication initiation factor  27.75 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0972  hypothetical protein  32.68 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0672625 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1187  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.72 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0729  DnaA regulatory inactivator Hda  27.75 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.778074  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02388  DNA replication initiation factor  29.9 
 
 		 248 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1173  DnaA regulatory inactivator Hda  29.9 
 
 		 248 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00363629  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2631  DNA replication initiation factor  29.9 
 
 		 248 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.127472  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1180  DNA replication initiation factor  29.9 
 
 		 248 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0260346 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2779  DNA replication initiation factor  29.9 
 
 		 248 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00316092  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2755  DNA replication initiation factor  29.23 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2733  DNA replication initiation factor  29.23 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.176133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2643  DNA replication initiation factor  29.9 
 
 		 248 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.029874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2643  DNA replication initiation factor  29.23 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000240374  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2864  DNA replication initiation factor  29.23 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3718  DNA replication initiation factor  29.9 
 
 		 248 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.287428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02350  hypothetical protein  29.9 
 
 		 248 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0140211  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2870  DNA replication initiation factor  29.9 
 
 		 248 aa  72  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2691  DNA replication initiation factor  29.23 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.994439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02244  hypothetical protein  30.49 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.523249  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2989  DNA replication initiation factor  28.72 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.94989  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2984  DNA replication initiation factor  28.41 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.130001  normal  0.0618284 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1354  DNA replication initiation factor  28.72 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249163  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3125  DNA replication initiation factor  28.72 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000265071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1237  DNA replication initiation factor  28.72 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000322124  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1067  DNA replication initiation factor  27.69 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3519  DNA replication initiation factor  30 
 
 		 203 aa  68.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222662  normal  0.661006 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02146  Chromosomal replication initiator, DnaA like protein to DnaA protein Hda  24.66 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0119761  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1071  chromosomal replication initiator, DnaA  25.36 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.163045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1717  hypothetical protein  31.1 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.308602  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1647  hypothetical protein  31.1 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.227108  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0234  Chromosomal replication initiator DnaA  30.89 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.328528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  22.22 
 
 		 450 aa  56.2  0.0000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0222  hypothetical protein  28.33 
 
 		 217 aa  55.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0660424 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1048  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.11 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0001  chromosomal replication initiation protein  27.36 
 
 		 436 aa  55.1  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.76217  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0399  chromosomal replication initiator, DnaA  30.23 
 
 		 226 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2616  DnaA regulatory inactivator Hda  26.04 
 
 		 224 aa  54.7  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2313  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  27.15 
 
 		 247 aa  53.5  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593318 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2436  chromosomal replication initiator, DnaA  30.23 
 
 		 226 aa  53.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192857  normal  0.0248561 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2133  chromosomal replication initiation protein  25.9 
 
 		 489 aa  52.8  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000845727  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  23.26 
 
 		 446 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0001  chromosomal replication initiation protein  27.35 
 
 		 440 aa  52.4  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  23.26 
 
 		 446 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  23.26 
 
 		 446 aa  52.4  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  23.26 
 
 		 446 aa  52.4  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  23.26 
 
 		 446 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  23.26 
 
 		 446 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  23.26 
 
 		 446 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  23.26 
 
 		 446 aa  52.4  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2511  chromosomal replication initiator, DnaA  27.23 
 
 		 228 aa  52.8  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05681  chromosomal replication initiation protein  29.17 
 
 		 454 aa  52.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.263255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  23.26 
 
 		 446 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0027  chromosomal replication initiation protein  27.35 
 
 		 440 aa  52.4  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.984359  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0001  chromosomal replication initiation protein  27.35 
 
 		 440 aa  52.4  0.000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.879571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>