67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1432 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1432  FxsA cytoplasmic membrane protein  100 
 
 		 202 aa  397  9.999999999999999e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0700  inner membrane protein FxsA  76.19 
 
 		 205 aa  295  4e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.175481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0672  FxsA cytoplasmic membrane protein  70.32 
 
 		 210 aa  286  2e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0585  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.7 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.743828  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0540  FxsA cytoplasmic membrane protein  26.94 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0336938  decreased coverage  0.00333151 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0726  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.94 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2268  FxsA  26.95 
 
 		 161 aa  62  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0507  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.6 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.198266  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002215  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  31.03 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3664  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.03 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0363971  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0724  FxsA  29.69 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00153  FxsA  29.89 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0638  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.11 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0665  FxsA cytoplasmic membrane protein  27.65 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0661  FxsA cytoplasmic membrane protein  27.65 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0882  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.19 
 
 		 158 aa  57.8  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000346375  hitchhiker  0.000146857 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2805  FxsA  30.26 
 
 		 167 aa  57.8  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4013  FxsA cytoplasmic membrane protein  27.32 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3724  FxsA cytoplasmic membrane protein  27.65 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3824  FxsA  29.9 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0407  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.63 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000598629 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3677  FxsA  29.9 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3531  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.18 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.170077  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3405  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.69 
 
 		 157 aa  52.4  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0418  FxsA cytoplasmic membrane protein  25.29 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000190293  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4156  FxsA cytoplasmic membrane protein  25.28 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306524  normal  0.505374 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2705  FxsA cytoplasmic membrane protein  24.36 
 
 		 173 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.03406  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0030  FxsA cytoplasmic membrane protein  27.5 
 
 		 142 aa  50.1  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5815  FxsA-like protein  25 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03920  fxsA protein  26.4 
 
 		 178 aa  50.1  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4688  FxsA  37.61 
 
 		 158 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4745  FxsA  37.61 
 
 		 158 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.689365 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4597  FxsA  37.61 
 
 		 158 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4605  FxsA  37.61 
 
 		 158 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4724  FxsA  37.61 
 
 		 158 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0698  fxsA protein  22.95 
 
 		 187 aa  49.3  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1891  FxsA cytoplasmic membrane protein  27.27 
 
 		 183 aa  48.9  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.277651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4669  FxsA  38.53 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3872  FxsA  38.53 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03972  hypothetical protein  38.53 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3852  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.53 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4695  FxsA  38.53 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4381  FxsA  38.53 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.235935  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0841  FxsA cytoplasmic membrane protein  24.35 
 
 		 161 aa  47.4  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0842342  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04010  inner membrane protein  38.53 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3574  FxsA cytoplasmic membrane protein  26.97 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.965876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3404  FxsA cytoplasmic membrane protein  26.97 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.50678  hitchhiker  0.00954058 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3264  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.95 
 
 		 197 aa  46.6  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113686  hitchhiker  0.00449743 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2668  FxsA cytoplasmic membrane protein  24.78 
 
 		 154 aa  46.2  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.414082  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0548  FxsA cytoplasmic membrane protein  26.97 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0925421  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4609  FxsA  37.74 
 
 		 158 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.432194  normal  0.600048 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1534  FxsA cytoplasmic membrane protein  25.2 
 
 		 186 aa  45.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1806  FxsA cytoplasmic membrane protein  26.32 
 
 		 170 aa  45.8  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3609  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.7 
 
 		 187 aa  45.4  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.540395  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0955  fxsA protein  26.53 
 
 		 172 aa  45.4  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.951475  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3245  FxsA cytoplasmic membrane protein  25.84 
 
 		 197 aa  44.7  0.0009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0083  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.17 
 
 		 161 aa  44.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3941  FxsA  25.23 
 
 		 168 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.762293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2923  FxsA cytoplasmic membrane protein  31 
 
 		 154 aa  43.5  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000984187  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1830  FxsA cytoplasmic membrane protein  25.78 
 
 		 161 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57030  FxsA  26.53 
 
 		 155 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0792  FxsA cytoplasmic membrane protein  25.4 
 
 		 200 aa  42.4  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4958  FxsA  26.53 
 
 		 155 aa  42.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.276785  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0530  FxsA  26.26 
 
 		 129 aa  42  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2158  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.77 
 
 		 170 aa  42  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.900116  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1761  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  27.78 
 
 		 224 aa  41.6  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0813114  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0447  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.38 
 
 		 194 aa  41.2  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>