177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0804 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0804  cytochrome C biogenesis protein  100 
 
 
210 aa  433  1e-120  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1559  cytochrome C-type biogenesis protein  51.26 
 
 
192 aa  200  9.999999999999999e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000529963  normal  0.148029 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1741  cytochrome C biogenesis protein  55.75 
 
 
188 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0074582  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1350  cytochrome C biogenesis protein  48.96 
 
 
189 aa  163  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.252997  normal  0.16103 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30380  Cytochrome C biogenesis protein  45.89 
 
 
157 aa  130  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.404014  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3386  cytochrome C biogenesis protein  38.89 
 
 
156 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.255579  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45290  cytochrome C-type biogenesis protein CcmH  37.08 
 
 
155 aa  124  9e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2784  cytochrome C biogenesis protein  41.26 
 
 
162 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.951803 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3384  cytochrome C biogenesis protein  47.06 
 
 
157 aa  123  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2274  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH precursor  39.04 
 
 
168 aa  121  9e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.331882  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1877  cytochrome C-type biogenesis protein CcmH  41.1 
 
 
147 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000542623  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3889  cytochrome C biogenesis protein  37.08 
 
 
158 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.200092  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1547  cytochrome C biogenesis protein  38.51 
 
 
158 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.89149  normal  0.744537 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0400  cytochrome c-type biogenesis protein H  47.54 
 
 
156 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3845  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  38.61 
 
 
155 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1037  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  45.05 
 
 
155 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002848  cytochrome c heme lyase subunit CcmL  47.79 
 
 
161 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0184  cytochrome C biogenesis protein  35.71 
 
 
160 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000331136  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0195  cytochrome C biogenesis protein  36.21 
 
 
159 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00319967  normal  0.0437766 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02121  heme lyase, CcmH subunit  41.6 
 
 
350 aa  116  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1465  cytochrome C biogenesis protein  41.6 
 
 
350 aa  116  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141768  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1584  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase, 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino) uracil reductase  35.56 
 
 
156 aa  116  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.550615  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02080  hypothetical protein  41.6 
 
 
350 aa  116  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3331  cytochrome c-type biogenesis family protein  41.6 
 
 
350 aa  116  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1456  cytochrome C biogenesis protein  41.6 
 
 
350 aa  116  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1638  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  42.62 
 
 
158 aa  115  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00720006  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2342  cytochrome c-type biogenesis family protein  41.6 
 
 
350 aa  116  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.397636 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0747  cytochrome c-type biogenesis family protein  41.6 
 
 
350 aa  116  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238814  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2332  cytochrome c-type biogenesis family protein  41.6 
 
 
350 aa  116  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2493  cytochrome c-type biogenesis family protein  41.6 
 
 
350 aa  116  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1953  cytochrome C biogenesis protein  38.93 
 
 
160 aa  115  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.570726  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3646  cytochrome C biogenesis protein  43.33 
 
 
158 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235259  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03128  hypothetical protein  40.82 
 
 
161 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1376  cytochrome C biogenesis protein  43.18 
 
 
157 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3017  cytochrome C biogenesis protein  37.04 
 
 
180 aa  112  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0250  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  39.78 
 
 
167 aa  112  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000345398  normal  0.0777875 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3628  cytochrome c-type biogenesis protein CycL  45.13 
 
 
156 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3249  cytochrome C biogenesis protein  37.97 
 
 
149 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0038  cytochrome C biogenesis protein  40.76 
 
 
155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4202  cytochrome c-type biogenesis protein H2  38.02 
 
 
347 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2590  cytochrome c-type biogenesis protein H2  38.02 
 
 
347 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.124545 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4095  cytochrome c-type biogenesis protein H2  38.02 
 
 
347 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2431  cytochrome c-type biogenesis protein H2  38.02 
 
 
347 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.684186 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1503  cytochrome C biogenesis protein  45.37 
 
 
170 aa  109  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.288329  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2473  cytochrome c-type biogenesis protein H2  38.52 
 
 
347 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.677618  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2487  cytochrome c-type biogenesis protein H2  38.52 
 
 
347 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  hitchhiker  0.00973673 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4040  cytochrome c-type biogenesis protein H1  38.52 
 
 
347 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4144  cytochrome c-type biogenesis protein H2  38.52 
 
 
347 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4023  cytochrome c-type biogenesis protein H2  38.52 
 
 
347 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2382  cytochrome c-type biogenesis protein H1  38.52 
 
 
347 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1394  putative cytochrome c-type biogenesis protein  45.37 
 
 
170 aa  108  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3564  cytochrome C biogenesis protein  39.01 
 
 
159 aa  108  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000181195  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0236  cytochrome C biogenesis protein  40.74 
 
 
159 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000417062  normal  0.56744 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0233  cytochrome C biogenesis protein  40.74 
 
 
159 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000146648  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1511  cytochrome C biogenesis protein  39.04 
 
 
160 aa  107  9.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4019  cytochrome c nitrite reductase, accessory protein NrfF  40.74 
 
 
159 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000231176  hitchhiker  0.00651067 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0233  cytochrome C biogenesis protein  40.74 
 
 
159 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000012356  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4654  cytochrome c nitrite reductase, accessory protein NrfF  34.64 
 
 
160 aa  107  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532931  normal  0.0226241 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0925  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  43.64 
 
 
133 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0894  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  43.64 
 
 
133 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00220  C-type cytochrome biogenesis protein  46.39 
 
 
164 aa  105  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3722  cytochrome C biogenesis protein  42.19 
 
 
159 aa  105  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000413859  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0941  cytochrome C biogenesis protein  40.37 
 
 
153 aa  105  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0853433  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0376  putative cytochrome C biogenesis protein CcmH  48.48 
 
 
164 aa  105  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0115761 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03067  Cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  39.52 
 
 
176 aa  102  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0220  cytochrome C biogenesis protein  34.86 
 
 
155 aa  102  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000296906  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2706  cytochrome C biogenesis protein  38.84 
 
 
149 aa  100  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.572968  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00858  C-type cytochrome biogenesis protein  48.81 
 
 
143 aa  99  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00749926  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06069  C-type cytochrome biogenesis protein  48.81 
 
 
143 aa  99  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000842806  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1689  cytochrome C biogenesis protein  46.43 
 
 
167 aa  99  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.320288  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3408  cytochrome C biogenesis protein  46.88 
 
 
136 aa  99  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.572276  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2721  cytochrome C biogenesis protein  41.67 
 
 
152 aa  98.6  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4282  cytochrome c biogenesis protein  33.14 
 
 
160 aa  98.6  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100149  normal  0.0369592 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2448  cytochrome C biogenesis protein  44.32 
 
 
156 aa  98.2  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.629035  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2417  cytochrome C biogenesis protein  41.67 
 
 
152 aa  97.8  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.62461  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0583  cytochrome C biogenesis protein  49.38 
 
 
133 aa  96.7  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.176741  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2854  cytochrome C biogenesis protein  43.16 
 
 
156 aa  96.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0236  cytochrome C biogenesis protein  42.34 
 
 
159 aa  95.5  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000158363  unclonable  0.00000000004354 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0236  cytochrome C biogenesis protein  43.75 
 
 
159 aa  95.1  7e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000279584  hitchhiker  0.00000000902528 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0231  cytochrome C biogenesis protein  43.75 
 
 
159 aa  94.7  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000238711  normal  0.102863 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0942  cytochrome C biogenesis protein  38.98 
 
 
157 aa  93.2  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0762441  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0268  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  39.09 
 
 
159 aa  92  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3998  cytochrome C biogenesis protein  31.29 
 
 
162 aa  92  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.678852  normal  0.946907 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003120  cytochrome c-type heme lyase subunit nrfF nitrite reductase complex assembly  39.82 
 
 
136 aa  92  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0416  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  39.39 
 
 
153 aa  90.5  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2392  cytochrome c biogenesis protein  38.46 
 
 
151 aa  91.3  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00556293  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1209  C-type cytochrome biogenesis protein  46.99 
 
 
154 aa  90.9  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.258631  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2003  cytochrome c biogenesis protein  41.18 
 
 
151 aa  90.1  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.190501  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4675  heme lyase subunit NrfE  34.65 
 
 
740 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.224311  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3777  cytochrome C biogenesis protein  35.16 
 
 
157 aa  88.6  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4054  cytochrome c biogenesis protein  39.35 
 
 
344 aa  88.2  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4053  cytochrome C biogenesis protein  35.16 
 
 
157 aa  88.6  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.448271  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4626  heme lyase subunit NrfE  34.65 
 
 
740 aa  88.6  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.447699  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3447  cytochrome C biogenesis protein  35.4 
 
 
166 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.345462  normal  0.0741818 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4540  heme lyase subunit NrfE  33.66 
 
 
740 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.815854  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4534  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfF  36 
 
 
169 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4625  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfF  36 
 
 
169 aa  86.3  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.773525  normal  0.804326 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4772  cytochrome C biogenesis protein  40.57 
 
 
163 aa  85.9  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3997  transcriptional regulator, XRE family  32.92 
 
 
201 aa  85.9  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1413  cytochrome C biogenesis protein  33.6 
 
 
162 aa  85.1  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.638624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>