219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0144 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0144  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  388  1e-107  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0062  hypothetical protein  68.09 
 
 
187 aa  278  4e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.492271 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0057  putative transcriptional regulator  67.55 
 
 
187 aa  276  1e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2472  putative transcriptional regulator  42.71 
 
 
189 aa  158  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.888778  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3712  hypothetical protein  42.25 
 
 
187 aa  156  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.081023  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0747  protein of unknown function DUF179  41.71 
 
 
211 aa  155  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0766  hypothetical protein  41.71 
 
 
211 aa  155  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.155835  hitchhiker  0.000020893 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02778  hypothetical protein  41.71 
 
 
187 aa  155  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.551052  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3090  hypothetical protein  41.71 
 
 
187 aa  155  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132976  decreased coverage  0.00000221223 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3106  hypothetical protein  41.71 
 
 
187 aa  155  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3291  hypothetical protein  41.71 
 
 
187 aa  155  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.481314  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4251  hypothetical protein  41.71 
 
 
187 aa  155  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.390045  normal  0.313475 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02741  hypothetical protein  41.71 
 
 
187 aa  155  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3380  hypothetical protein  41.71 
 
 
187 aa  155  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.966977  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3439  hypothetical protein  41.71 
 
 
187 aa  154  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.623694  hitchhiker  0.00691193 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3259  hypothetical protein  41.71 
 
 
187 aa  154  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0107487  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3270  hypothetical protein  41.18 
 
 
187 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.552102  normal  0.0744312 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0940  hypothetical protein  41.94 
 
 
188 aa  152  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.335136  normal  0.481513 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3335  hypothetical protein  40.64 
 
 
187 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.288189 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3343  hypothetical protein  40.64 
 
 
187 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.171118  normal  0.329323 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  41.85 
 
 
186 aa  151  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2478  hypothetical protein  45.11 
 
 
186 aa  150  8e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3893  hypothetical protein  43.01 
 
 
186 aa  150  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0837  hypothetical protein  41.18 
 
 
187 aa  149  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.01957  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0835  hypothetical protein  41.18 
 
 
187 aa  149  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  40.22 
 
 
216 aa  149  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0544  hypothetical protein  41.05 
 
 
197 aa  148  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0299176  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0501  hypothetical protein  40.11 
 
 
187 aa  148  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.232417  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  40.54 
 
 
192 aa  147  7e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1361  hypothetical protein  41.3 
 
 
188 aa  147  8e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3341  hypothetical protein  40.64 
 
 
187 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2406  protein of unknown function DUF179  43.48 
 
 
192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.802635  normal  0.951535 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1428  hypothetical protein  40.96 
 
 
188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1252  hypothetical protein  35.38 
 
 
234 aa  145  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252452  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3346  hypothetical protein  38.62 
 
 
187 aa  145  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02000  hypothetical protein  40.98 
 
 
188 aa  145  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1199  hypothetical protein  38.1 
 
 
187 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1270  hypothetical protein  38.1 
 
 
187 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1200  hypothetical protein  38.1 
 
 
187 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0314769  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3352  hypothetical protein  39.04 
 
 
212 aa  145  5e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0115365  decreased coverage  0.00224252 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0619  hypothetical protein  41.18 
 
 
190 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  41.85 
 
 
193 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  41.85 
 
 
193 aa  144  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1132  hypothetical protein  41.8 
 
 
190 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1237  hypothetical protein  38.83 
 
 
186 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.198149 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  38.5 
 
 
187 aa  144  9e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  40.76 
 
 
190 aa  143  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1142  hypothetical protein  40.31 
 
 
195 aa  143  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.873097  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3910  hypothetical protein  41.71 
 
 
187 aa  143  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0230557  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0636  hypothetical protein  39.78 
 
 
187 aa  143  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3695  protein of unknown function DUF179  40.22 
 
 
191 aa  142  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0567  hypothetical protein  40.64 
 
 
190 aa  142  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7379  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2336  hypothetical protein  38.46 
 
 
188 aa  141  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0620  hypothetical protein  39.25 
 
 
187 aa  141  7e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0058  hypothetical protein  38.5 
 
 
185 aa  140  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0868  hypothetical protein  40.86 
 
 
192 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0761346 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  38.3 
 
 
200 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3811  hypothetical protein  40.86 
 
 
221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1337  hypothetical protein  38.83 
 
 
186 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0174957  hitchhiker  0.000402511 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1144  hypothetical protein  38.5 
 
 
185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.496045  normal  0.0336297 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  40.96 
 
 
208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2850  hypothetical protein  39.89 
 
 
186 aa  139  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1517  hypothetical protein  38.66 
 
 
200 aa  139  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3764  hypothetical protein  37.97 
 
 
188 aa  138  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1462  hypothetical protein  40.96 
 
 
207 aa  137  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0547  hypothetical protein  38.3 
 
 
187 aa  137  7e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2327  hypothetical protein  40 
 
 
191 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0686759 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1997  hypothetical protein  40.96 
 
 
192 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.938009  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1344  protein of unknown function DUF179  38.1 
 
 
187 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0111665  hitchhiker  0.000000000584431 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3170  hypothetical protein  40.96 
 
 
192 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3962  hypothetical protein  40.86 
 
 
192 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.554384 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3034  hypothetical protein  38.1 
 
 
200 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000468613  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3637  argininosuccinate lyase  39.67 
 
 
203 aa  137  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755097  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3177  hypothetical protein  38.1 
 
 
187 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000779638  hitchhiker  0.00595197 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0916  hypothetical protein  40.96 
 
 
192 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2746  hypothetical protein  40.96 
 
 
192 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.770221  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3019  hypothetical protein  38.1 
 
 
200 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00383877  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3112  hypothetical protein  40.96 
 
 
192 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3148  hypothetical protein  40.96 
 
 
192 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1859  hypothetical protein  40.96 
 
 
192 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2524  hypothetical protein  40.86 
 
 
192 aa  136  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.811534  normal  0.166085 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0400  hypothetical protein  39.46 
 
 
201 aa  137  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1578  hypothetical protein  38.86 
 
 
199 aa  136  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.663829 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1153  hypothetical protein  36.36 
 
 
198 aa  135  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0349  hypothetical protein  40.31 
 
 
191 aa  135  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242257  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0737  hypothetical protein  40.86 
 
 
192 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2219  hypothetical protein  37.16 
 
 
181 aa  136  2e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277771  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2193  transcriptional regulator  37.16 
 
 
194 aa  136  2e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.996839  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0754  hypothetical protein  40.86 
 
 
192 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.173115  normal  0.270249 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0907  hypothetical protein  36.71 
 
 
213 aa  136  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572934  normal  0.591231 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2579  hypothetical protein  41.18 
 
 
185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0876832 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0382  hypothetical protein  40.32 
 
 
192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0864  hypothetical protein  40.32 
 
 
192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0835  hypothetical protein  40.32 
 
 
192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186487  hitchhiker  0.000370502 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2681  hypothetical protein  37.04 
 
 
187 aa  135  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0732107  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  35.64 
 
 
189 aa  135  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2896  protein of unknown function DUF179  38.34 
 
 
199 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3573  hypothetical protein  38.34 
 
 
199 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.425942 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0705  hypothetical protein  39.29 
 
 
200 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0368  hypothetical protein  35.83 
 
 
187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>