More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_5229 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_5321  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  99.77 
 
 
435 aa  892    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5478  phosphate regulon sensor protein phoR  82.6 
 
 
440 aa  709    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5033  PAS:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  82.6 
 
 
440 aa  714    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.127031 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5607  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  85.06 
 
 
440 aa  736    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6139  two-component sensor PhoR  82.72 
 
 
439 aa  698    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4407  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  80.23 
 
 
439 aa  684    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.146321 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0153  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  94.48 
 
 
435 aa  828    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.825444 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70760  two-component sensor PhoR  83.06 
 
 
443 aa  688    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5368  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  98.62 
 
 
435 aa  881    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26034  normal  0.358942 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5229  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
435 aa  894    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618516  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48530  phosphate regulon histidine protein kinase; PhoR  67.59 
 
 
440 aa  582  1.0000000000000001e-165  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.771609  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.38 
 
 
440 aa  445  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  53 
 
 
439 aa  424  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4401  histidine kinase  47.47 
 
 
447 aa  395  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2471  Histidine kinase  46.05 
 
 
446 aa  383  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3839  two-component sensor PhoR  47.89 
 
 
434 aa  378  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000175105  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03439  phosphate regulon sensor protein PhoR  44.39 
 
 
433 aa  355  7.999999999999999e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.350506  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.03 
 
 
446 aa  347  3e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2767  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.99 
 
 
431 aa  344  2e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00352447  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2456  phosphate regulon sensor protein  45.3 
 
 
432 aa  342  9e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2980  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.27 
 
 
432 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000022152  hitchhiker  0.00348527 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1365  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.27 
 
 
432 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000304613  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1379  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.27 
 
 
432 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000050186  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1404  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.27 
 
 
432 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000894019  normal  0.0243022 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1054  histidine kinase  44.1 
 
 
436 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.814283  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2776  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.92 
 
 
432 aa  339  5e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000654032  decreased coverage  0.000247019 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1559  phosphate regulon sensor protein PhoR  45.66 
 
 
432 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.45 
 
 
443 aa  338  9.999999999999999e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0254  phosphate regulon sensor protein  45.02 
 
 
433 aa  336  5.999999999999999e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2708  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.66 
 
 
432 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000004963  decreased coverage  0.000000358257 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2878  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.8 
 
 
432 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000200806  hitchhiker  0.00000878354 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2400  Signal transduction histidine kinase, PhoR  44.99 
 
 
437 aa  333  4e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.595791  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0958  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.26 
 
 
440 aa  332  5e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770114  normal  0.0682778 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0217  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  42.96 
 
 
449 aa  330  3e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.217538 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3302  putative PAS/PAC sensor protein  42.52 
 
 
439 aa  330  3e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000529502  decreased coverage  0.00000000230896 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1297  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.26 
 
 
432 aa  329  6e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000005048  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2688  ATP-binding region, ATPase-like protein  42.44 
 
 
432 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000622001  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2968  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.6 
 
 
439 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000115911  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01027  phosphate regulon sensor protein  44.15 
 
 
432 aa  326  6e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2748  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.13 
 
 
430 aa  325  7e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000859237  unclonable  0.00000414607 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004384  phosphate regulon sensor protein phoR  45.65 
 
 
402 aa  323  5e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3451  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.52 
 
 
431 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000711716  decreased coverage  0.0000471047 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2232  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.52 
 
 
433 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1075  phosphate regulon sensor protein PhoR  42.42 
 
 
434 aa  318  1e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000451223  normal  0.527296 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3568  sensor histidine kinase  43.55 
 
 
430 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2092  histidine kinase  44.06 
 
 
555 aa  312  7.999999999999999e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00961022  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2200  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.58 
 
 
448 aa  311  1e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.148395  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2258  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.97 
 
 
451 aa  310  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.42492 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0868  phosphate regulon sensor protein  40.05 
 
 
431 aa  307  2.0000000000000002e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.655854  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0488  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.09 
 
 
442 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1209  phosphate regulon sensor protein PhoR  37.85 
 
 
434 aa  302  7.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00348  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with PhoB  39.86 
 
 
431 aa  297  2e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00352  hypothetical protein  39.86 
 
 
431 aa  297  2e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1492  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
465 aa  296  3e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0468  phosphate regulon sensor protein  39.86 
 
 
431 aa  297  3e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0428  phosphate regulon sensor protein  39.86 
 
 
431 aa  297  3e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
465 aa  297  3e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0455  phosphate regulon sensor protein  39.42 
 
 
431 aa  296  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0436  phosphate regulon sensor protein  39.42 
 
 
431 aa  296  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0497  phosphate regulon sensor protein  39.42 
 
 
431 aa  296  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0442  phosphate regulon sensor protein  39.42 
 
 
431 aa  296  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0228  histidine kinase  43.32 
 
 
438 aa  295  8e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0430  phosphate regulon sensor protein  40.2 
 
 
431 aa  294  3e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157336  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3233  phosphate regulon sensor protein  39.95 
 
 
431 aa  293  5e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62554  unclonable  0.0000000115446 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.41 
 
 
437 aa  293  5e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0308892 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0319  phosphate regulon sensor protein  39.95 
 
 
431 aa  293  6e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397262  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0436  phosphate regulon sensor protein  38.94 
 
 
431 aa  293  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3209  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.95 
 
 
431 aa  292  7e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1042  phosphate regulon sensor protein  41.32 
 
 
438 aa  291  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.230284 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3301  phosphate regulon sensor protein  40.49 
 
 
440 aa  291  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.790712  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3275  phosphate regulon sensor protein  39.95 
 
 
438 aa  291  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0476  phosphate regulon sensor protein  39.7 
 
 
431 aa  291  2e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3285  phosphate regulon sensor protein  40.58 
 
 
438 aa  291  2e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0522706 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1009  phosphate regulon sensor protein  40.29 
 
 
440 aa  290  4e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2267  histidine kinase  42.21 
 
 
472 aa  289  8e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3135  phosphate regulon sensor protein  39.71 
 
 
438 aa  289  8e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1278  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.7 
 
 
460 aa  288  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00211916  normal  0.292462 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.4 
 
 
464 aa  288  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0542  histidine kinase  37.38 
 
 
435 aa  288  2e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2317  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.98 
 
 
431 aa  287  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.837858  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3104  histidine protein kinase PhoR  38.43 
 
 
438 aa  286  4e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0547463  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2632  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.16 
 
 
454 aa  286  5.999999999999999e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.434659  normal  0.0783763 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1272  phosphate sensor signal transduction histidine kinase, PhoR  43.49 
 
 
437 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.54553  normal  0.265376 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2914  phosphate regulon sensor protein  42.34 
 
 
440 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.31 
 
 
476 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.763592  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0786  histidine protein kinase PhoR  40.24 
 
 
436 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0580  histidine protein kinase PhoR  40.24 
 
 
436 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211794  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0571  histidine protein kinase PhoR  40.24 
 
 
448 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0483305  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1297  histidine protein kinase PhoR  40.24 
 
 
436 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1491  phosphate regulon sensor protein PhoR  42.94 
 
 
436 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.690525  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
437 aa  281  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1625  phosphate regulon sensor protein phoR  42.94 
 
 
436 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1522  phosphate regulon sensor protein PhoR  42.94 
 
 
436 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1596  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.68 
 
 
432 aa  281  2e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3105  phosphate regulon sensor protein  41.48 
 
 
440 aa  280  3e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1712  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.87 
 
 
442 aa  280  3e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000310244  normal  0.666466 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2767  histidine protein kinase PhoR  40 
 
 
436 aa  280  4e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0684991  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1195  histidine kinase  42.01 
 
 
439 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.843993  normal  0.58507 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1183  histidine kinase  42.01 
 
 
439 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.965515  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.52 
 
 
442 aa  277  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.531342  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>