12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3114 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3114  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  616  1e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3617  hypothetical protein  84.18 
 
 		 298 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00595661  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3618  hypothetical protein  84.8 
 
 		 297 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00152122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2114  hypothetical protein  82.82 
 
 		 292 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2298  hypothetical protein  80.81 
 
 		 296 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3237  hypothetical protein  81.14 
 
 		 296 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.141519  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2611  hypothetical protein  74.5 
 
 		 319 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0183477  normal  0.0388843 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3619  hypothetical protein  69.07 
 
 		 298 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00105207  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01955  hypothetical protein  22.91 
 
 		 368 aa  45.8  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.409206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2244  hypothetical protein  25.34 
 
 		 308 aa  43.9  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3668  hypothetical protein  26.51 
 
 		 376 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.249577 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2075  hypothetical protein  26.12 
 
 		 377 aa  42.4  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63181  normal  0.802537 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>