100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1079 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1079  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  209  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.313952  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1038  hypothetical protein  97.09 
 
 		 103 aa  204  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.718701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1000  hypothetical protein  86.41 
 
 		 103 aa  184  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1270  hypothetical protein  84.47 
 
 		 103 aa  180  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1035  hypothetical protein  93.2 
 
 		 103 aa  171  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4188  hypothetical protein  92.23 
 
 		 103 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1460  hypothetical protein  78.64 
 
 		 103 aa  169  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15770  hypothetical protein  76.7 
 
 		 105 aa  166  9e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170868 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1356  hypothetical protein  75.73 
 
 		 105 aa  165  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.39818  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39650  hypothetical protein  70.87 
 
 		 105 aa  157  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3412  hypothetical protein  68.93 
 
 		 105 aa  155  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.823966 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2483  hypothetical protein  62.14 
 
 		 103 aa  142  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000152567  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2640  hypothetical protein  64.71 
 
 		 103 aa  135  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2127  hypothetical protein  58.25 
 
 		 103 aa  134  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1197  hypothetical protein  58.25 
 
 		 105 aa  132  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0009  hypothetical protein  57 
 
 		 105 aa  130  7.999999999999999e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.149188  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2437  hypothetical protein  60 
 
 		 104 aa  130  7.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2172  hypothetical protein  57 
 
 		 105 aa  130  9e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0163  hypothetical protein  59.22 
 
 		 103 aa  126  9.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.278235  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2583  hypothetical protein  58 
 
 		 104 aa  126  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0761  hypothetical protein  53.92 
 
 		 107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0153  hypothetical protein  56.31 
 
 		 103 aa  124  5e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000296834  hitchhiker  0.0000244541 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0085  hypothetical protein  53 
 
 		 103 aa  124  5e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0205991  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0681  structural toxin protein RtxA  54 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.280515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2994  hypothetical protein  46 
 
 		 108 aa  114  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00193289  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0646  hypothetical protein  48 
 
 		 371 aa  107  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000133352  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3034  protein of unknown function DUF34  49.02 
 
 		 373 aa  107  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3775  hypothetical protein  53.68 
 
 		 109 aa  107  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.33032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1841  protein of unknown function DUF34  50 
 
 		 381 aa  103  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11154  conserved hypothetical protein  48.11 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.221049 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0892  hypothetical protein  43 
 
 		 368 aa  100  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0194369  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6059  hypothetical protein  42.27 
 
 		 106 aa  98.6  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2410  protein of unknown function DUF34  41 
 
 		 373 aa  97.8  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0245658  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4369  hypothetical protein  43 
 
 		 373 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00198592  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4029  NIF3-like protein  43 
 
 		 373 aa  97.1  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00007027  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12259  hypothetical protein  45 
 
 		 379 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4423  conserved hypothetical protein TIGR00486  43 
 
 		 373 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4191  hypothetical protein  43 
 
 		 373 aa  96.7  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000743156  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4512  hypothetical protein  43 
 
 		 373 aa  96.7  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000424182  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4406  conserved hypothetical protein TIGR00486  43 
 
 		 373 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0830  hypothetical protein TIGR00486  43 
 
 		 373 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000172023  hitchhiker  1.68837e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4039  NIF3-like protein  42 
 
 		 373 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149626  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2890  hypothetical protein  45 
 
 		 373 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.111198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1317  hypothetical protein  43.88 
 
 		 371 aa  95.1  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00297001  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4311  conserved hypothetical protein TIGR00486  42 
 
 		 373 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3364399999999999e-45 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3620  hypothetical protein  44 
 
 		 374 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2677  hypothetical protein  41.18 
 
 		 374 aa  94.4  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4141  hypothetical protein  43 
 
 		 373 aa  93.2  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2143  protein of unknown function DUF34  44.66 
 
 		 395 aa  93.6  9e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3355  hypothetical protein  38.83 
 
 		 379 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.900045  normal  0.361114 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3406  hypothetical protein  38.83 
 
 		 379 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172214 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3344  hypothetical protein  38.83 
 
 		 379 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.547099  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2459  hypothetical protein  44.9 
 
 		 371 aa  92  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1805  hypothetical protein  39.18 
 
 		 367 aa  90.9  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0668481  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0161  protein of unknown function DUF34  41 
 
 		 373 aa  90.5  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1974  protein of unknown function DUF34  40.59 
 
 		 369 aa  90.5  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.13936  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3096  protein of unknown function DUF34  42.72 
 
 		 379 aa  90.1  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0247011  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12390  conserved hypothetical protein TIGR00486  40.4 
 
 		 372 aa  90.5  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0226405  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2150  hypothetical protein  46.46 
 
 		 373 aa  90.5  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0626  hypothetical protein  40.59 
 
 		 370 aa  89.7  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.743702  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3085  hypothetical protein  42 
 
 		 375 aa  88.6  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0399  hypothetical protein  42 
 
 		 372 aa  88.2  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.399804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1217  protein of unknown function DUF34  37.76 
 
 		 373 aa  88.2  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000145347  hitchhiker  0.00320087 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5147  protein of unknown function DUF34  42.11 
 
 		 366 aa  88.6  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.660499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3988  hypothetical protein  44 
 
 		 372 aa  88.2  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3302  hypothetical protein  37 
 
 		 377 aa  84  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.53977  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4214  protein of unknown function DUF34  37.38 
 
 		 388 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117062  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6896  protein of unknown function DUF34  43 
 
 		 364 aa  80.9  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0175851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1619  protein of unknown function DUF34  38.82 
 
 		 366 aa  80.9  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3016  hypothetical protein  41.38 
 
 		 373 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.097716  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0900  hypothetical protein  48 
 
 		 393 aa  79.3  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00277153  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1125  hypothetical protein  31.31 
 
 		 366 aa  78.2  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00107465  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0879  protein of unknown function DUF34  39 
 
 		 380 aa  77.8  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2013  hypothetical protein  46.08 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.124677  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1542  protein of unknown function DUF34  33.67 
 
 		 365 aa  75.5  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0986735  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3123  protein of unknown function DUF34  36.84 
 
 		 366 aa  75.9  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2423  hypothetical protein  31.87 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.36164  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0683  protein of unknown function DUF34  34 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2741  CutA1 divalent ion tolerance protein  31.87 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000239405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2713  divalent cations, tolerance CutA family protein  30.77 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0209571  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2452  cutA1 divalent ion tolerance protein  30.77 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00490395  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2690  CutA1 divalent ion tolerance protein  30.77 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000001361 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2612  CutA1 divalent ion tolerance protein  32.97 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.849435  hitchhiker  0.00000461322 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2698  CutA1 divalent ion tolerance protein  32.97 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0556  hypothetical protein  48.98 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.71454  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1651  hypothetical protein  32.63 
 
 		 366 aa  70.9  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212562  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2043  hypothetical protein  34.31 
 
 		 364 aa  70.9  0.000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126917 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1617  hypothetical protein  32.63 
 
 		 366 aa  70.9  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00640299  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07841  hypothetical protein  34.69 
 
 		 364 aa  69.7  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.438332  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1828  protein of unknown function DUF34  45.05 
 
 		 384 aa  69.7  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00918722  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0495  protein of unknown function DUF34  45.07 
 
 		 372 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0420348 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2674  protein of unknown function DUF34  33.68 
 
 		 369 aa  68.6  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0478  protein of unknown function DUF34  37.76 
 
 		 372 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.763164  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0025  protein of unknown function DUF34  33 
 
 		 365 aa  67.8  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459063  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02240  hypothetical protein  45.65 
 
 		 110 aa  67  0.00000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0233  hypothetical protein  33.67 
 
 		 364 aa  67  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2712  protein of unknown function DUF34  42 
 
 		 373 aa  63.5  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.163591  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2593  hypothetical protein  39.8 
 
 		 361 aa  61.6  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0545  nitrogen regulatory protein PII  26.53 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  8.30947e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5270  protein of unknown function DUF34  27.1 
 
 		 386 aa  47.8  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>