20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0189 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0189  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  228  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.948948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0187  hypothetical protein  98.23 
 
 		 113 aa  224  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.704355  normal  0.309268 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5059  hypothetical protein  83.19 
 
 		 133 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.210325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0132  hypothetical protein  67.26 
 
 		 112 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.633937  normal  0.655967 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3059  hypothetical protein  49.55 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1216  hypothetical protein  48.65 
 
 		 114 aa  103  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.934469  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1807  hypothetical protein  44.55 
 
 		 113 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.250952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1078  hypothetical protein  44.95 
 
 		 113 aa  95.1  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2776  hypothetical protein  45.87 
 
 		 113 aa  95.1  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1312  hypothetical protein  39.62 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00893975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0435  hypothetical protein  39.66 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3109  hypothetical protein  33.01 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0052  hypothetical protein  33.33 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0303  hypothetical protein  35.71 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0934  hypothetical protein  37.37 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0964  hypothetical protein  37.37 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3767  hypothetical protein  48.28 
 
 		 73 aa  57.4  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1290  hypothetical protein  36.27 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0395  hypothetical protein  35.11 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0802537 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2825  hypothetical protein  35.05 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.712693  normal  0.211414 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>