58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0100 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0100  protein of unknown function DUF883, ElaB  100 
 
 		 107 aa  215  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0085  hypothetical protein  98.13 
 
 		 162 aa  209  7e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144499 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0100  protein of unknown function DUF883 ElaB  93.46 
 
 		 107 aa  174  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000513351 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0103  protein of unknown function DUF883 ElaB  93.46 
 
 		 107 aa  174  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183504 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0156  hypothetical protein  71.7 
 
 		 108 aa  159  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461272  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0036  hypothetical protein  69.81 
 
 		 108 aa  157  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0101  hypothetical protein  79.35 
 
 		 108 aa  149  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00240  hypothetical protein  36.17 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.287877  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0741  protein of unknown function DUF883 ElaB  35.42 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4328  protein of unknown function DUF883 ElaB  31.25 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.133585 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3420  hypothetical protein  36.46 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.971949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3490  hypothetical protein  36.46 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3524  hypothetical protein  36.46 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0255655 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3417  hypothetical protein  36.46 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3586  hypothetical protein  36.46 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.216587 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0523  hypothetical protein  34.38 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3552  protein of unknown function DUF883, ElaB  31.68 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.674047 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3571  hypothetical protein  34.38 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3263  hypothetical protein  34.38 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4413  hypothetical protein  34.38 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.319782 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3396  hypothetical protein  34.38 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0598  protein of unknown function DUF883 ElaB  34.38 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.946971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3390  protein of unknown function DUF883 ElaB  30.53 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02918  hypothetical protein  34.38 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02967  hypothetical protein  34.38 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3286  hypothetical protein  34.38 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.900441  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0603  protein of unknown function DUF883 ElaB  34.38 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1112  hypothetical protein  31 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0218952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0547  protein of unknown function DUF883 ElaB  31 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0483  hypothetical protein  31 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0117535  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3516  protein of unknown function DUF883 ElaB  29.17 
 
 		 101 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.215037  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0692  protein of unknown function DUF883, ElaB  29.47 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143345  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0709  protein of unknown function DUF883 ElaB  29.47 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0991967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0328  protein of unknown function DUF883, ElaB  29.47 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0811  protein of unknown function DUF883, ElaB  29.47 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.865476  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3904  protein of unknown function DUF883, ElaB  29.47 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0780  protein of unknown function DUF883 ElaB  29.47 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.558861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2572  protein of unknown function DUF883 ElaB  28.42 
 
 		 100 aa  47.8  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3240  transmembrane protein  27.37 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1387  hypothetical protein  28.42 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0843  hypothetical protein  27.37 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.892742  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2676  hypothetical protein  27.37 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.470235  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3187  hypothetical protein  27.37 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2067  hypothetical protein  27.37 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.58062  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3225  hypothetical protein  27.37 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363799  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1933  hypothetical protein  27.37 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.650648  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0774  protein of unknown function DUF883 ElaB  28.42 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.256627 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24770  hypothetical protein  25.45 
 
 		 109 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2098  hypothetical protein  25.45 
 
 		 109 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3906  hypothetical protein  28.42 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2440  protein of unknown function DUF883 ElaB  27.37 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0175946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0015  putative transmembrane protein  30 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0870168  normal  0.721209 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2791  protein of unknown function DUF883 ElaB  27.66 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1585  protein of unknown function DUF883 ElaB  27.36 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1788  hypothetical protein  27.36 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.963476  normal  0.212883 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1479  hypothetical protein  27.36 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28490  hypothetical protein  27.47 
 
 		 109 aa  41.2  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161534 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0362  putative membrane protein, ElaB-like  28.42 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0678074  normal  0.0886926 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>