98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4330 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0848  hypothetical protein  100 
 
 		 66 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4330  FeS assembly protein IscX  100 
 
 		 66 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000122179 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0891  FeS assembly protein IscX  100 
 
 		 66 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000154478 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0878  hypothetical protein  100 
 
 		 66 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315671 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3505  hypothetical protein  89.06 
 
 		 65 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14810  hypothetical protein  86.36 
 
 		 66 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1305  hypothetical protein  84.85 
 
 		 66 aa  114  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345629  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40340  hypothetical protein  75.76 
 
 		 68 aa  110  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.818915  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1429  hypothetical protein  74.24 
 
 		 68 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0836  FeS assembly protein IscX  65.62 
 
 		 67 aa  95.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.375713 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1170  hypothetical protein  64.52 
 
 		 64 aa  94  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.740176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2199  FeS assembly protein IscX  64.52 
 
 		 64 aa  89.4  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.750509  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1243  hypothetical protein  69.7 
 
 		 66 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.356382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2030  FeS assembly protein IscX  64.06 
 
 		 69 aa  88.2  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1150  FeS assembly protein IscX  64.06 
 
 		 69 aa  88.2  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.589229  normal  0.0892973 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2157  hypothetical protein  64.06 
 
 		 69 aa  88.2  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304835  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0559  hypothetical protein  61.54 
 
 		 69 aa  87  8e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.589657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0547  hypothetical protein  61.54 
 
 		 69 aa  87  8e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.266324 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5426  hypothetical protein  60.94 
 
 		 69 aa  86.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.57081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1452  FeS assembly protein IscX  57.81 
 
 		 65 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.638464 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2120  hypothetical protein  60.94 
 
 		 69 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450379  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5957  hypothetical protein  60.94 
 
 		 69 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0641  hypothetical protein  58.46 
 
 		 69 aa  85.1  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0901952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1956  hypothetical protein  59.68 
 
 		 64 aa  84  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.453681  normal  0.885386 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2271  hypothetical protein  59.38 
 
 		 65 aa  83.6  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1782  FeS assembly protein IscX  64.06 
 
 		 65 aa  83.6  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000715964 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0277  hypothetical protein  59.09 
 
 		 66 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00183968  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0643  hypothetical protein  60.94 
 
 		 65 aa  82  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0239231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3056  hypothetical protein  60.94 
 
 		 64 aa  82.8  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00735803  hitchhiker  0.00000912213 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1968  FeS assembly protein IscX  54.69 
 
 		 65 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221322  hitchhiker  0.000331395 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2379  hypothetical protein  54.69 
 
 		 65 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000668303  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2495  hypothetical protein  54.69 
 
 		 65 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000113694  hitchhiker  0.00873883 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2390  hypothetical protein  54.69 
 
 		 65 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000989669  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1881  hypothetical protein  57.81 
 
 		 69 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.443812  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0723  iron-sulfur cluster assembly protein  59.09 
 
 		 66 aa  80.5  0.000000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2573  FeS assembly protein IscX  54.69 
 
 		 65 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.259531  normal  0.014993 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1559  hypothetical protein  56.25 
 
 		 65 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0560474  normal  0.22118 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0633  FeS assembly protein IscX  59.38 
 
 		 64 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0624  FeS assembly protein IscX  59.38 
 
 		 64 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.230885  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0599  hypothetical protein  59.38 
 
 		 64 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2863  hypothetical protein  53.85 
 
 		 81 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.992036  hitchhiker  0.0000000169908 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2053  hypothetical protein  56.45 
 
 		 64 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0926019  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2273  hypothetical protein  54.69 
 
 		 65 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000561979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1826  hypothetical protein  54.69 
 
 		 65 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000390738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004354  hypothetical protein  51.56 
 
 		 64 aa  78.2  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1746  hypothetical protein  54.69 
 
 		 65 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2311  hypothetical protein  53.23 
 
 		 63 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0157087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0956  FeS assembly protein IscX  57.81 
 
 		 64 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.148069  normal  0.0549352 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1026  hypothetical protein  58.73 
 
 		 65 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1031  hypothetical protein  58.73 
 
 		 64 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.370325 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0283  hypothetical protein  50 
 
 		 64 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000330897  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01061  hypothetical protein  48.44 
 
 		 64 aa  75.5  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4606  hypothetical protein  56.06 
 
 		 66 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.522637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2142  hypothetical protein  50 
 
 		 65 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000760105  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1496  hypothetical protein  54.69 
 
 		 65 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.51475  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0891  FeS assembly protein IscX  56.25 
 
 		 64 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.651068  normal  0.0428371 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1065  hypothetical protein  55.56 
 
 		 64 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2676  hypothetical protein  48.48 
 
 		 66 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.570306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3021  hypothetical protein  48.48 
 
 		 66 aa  72.8  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.248883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2736  hypothetical protein  50 
 
 		 66 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2799  hypothetical protein  50 
 
 		 66 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2777  hypothetical protein  50 
 
 		 66 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.148493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2692  hypothetical protein  50 
 
 		 66 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2911  hypothetical protein  50 
 
 		 66 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2825  hypothetical protein  54.84 
 
 		 64 aa  72.4  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1174  hypothetical protein  53.12 
 
 		 66 aa  72  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1282  hypothetical protein  53.12 
 
 		 66 aa  72  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0429  hypothetical protein  53.12 
 
 		 66 aa  72  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0138645 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1920  hypothetical protein  50 
 
 		 64 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.936789  normal  0.847622 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1330  hypothetical protein  48.44 
 
 		 65 aa  72.4  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1110  FeS assembly protein IscX  50 
 
 		 66 aa  71.2  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0679  hypothetical protein  46.88 
 
 		 64 aa  70.9  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.487958  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0828  FeS assembly protein IscX  46.88 
 
 		 64 aa  70.9  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0346941  normal  0.584333 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2745  FeS assembly protein IscX  50.77 
 
 		 66 aa  70.9  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02416  hypothetical protein  46.97 
 
 		 66 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.598213  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1153  hypothetical protein  46.97 
 
 		 66 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.3694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02380  hypothetical protein  46.97 
 
 		 66 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.74792  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1144  FeS assembly protein IscX  46.97 
 
 		 66 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.901858  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3755  hypothetical protein  46.97 
 
 		 66 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0141702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2675  hypothetical protein  46.97 
 
 		 66 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2899  hypothetical protein  46.97 
 
 		 66 aa  70.5  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.90827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2808  hypothetical protein  46.97 
 
 		 66 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.516264  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4263  hypothetical protein  53.85 
 
 		 68 aa  70.1  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3621  hypothetical protein  45.45 
 
 		 66 aa  69.7  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.318394 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3109  hypothetical protein  57.81 
 
 		 69 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.81961  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2593  hypothetical protein  57.81 
 
 		 69 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1702  hypothetical protein  57.81 
 
 		 69 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0790813  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2649  hypothetical protein  57.81 
 
 		 69 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1483  hypothetical protein  57.81 
 
 		 69 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191368  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2211  hypothetical protein  57.81 
 
 		 69 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2726  hypothetical protein  57.81 
 
 		 69 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3025  hypothetical protein  46.97 
 
 		 66 aa  67.8  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1250  hypothetical protein  46.97 
 
 		 66 aa  67.4  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0478  hypothetical protein  45.16 
 
 		 72 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0389  hypothetical protein  46.77 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0581  hypothetical protein  41.94 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0197  hypothetical protein  40.32 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.516503  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0908  hypothetical protein  41.94 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>