13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2749 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2749  hypothetical protein  100 
 
 		 73 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.737925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2835  hypothetical protein  70.37 
 
 		 54 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0848169  normal  0.131444 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  64.41 
 
 		 396 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2937  integrase, putative  68.09 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.456202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  45.83 
 
 		 375 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  43.75 
 
 		 356 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2523  Bbp50  50 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2325  phage integrase family protein  43.48 
 
 		 403 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.633234  hitchhiker  0.0000214757 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  41.86 
 
 		 426 aa  41.2  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  41.86 
 
 		 398 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  36.36 
 
 		 357 aa  41.2  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  41.86 
 
 		 431 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  47.06 
 
 		 428 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>