113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1725 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1725  transmembrane pair domain-containing protein  100 
 
 		 142 aa  290  5e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3487  transmembrane pair domain-containing protein  92.96 
 
 		 142 aa  277  4e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125843  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1882  transmembrane pair domain-containing protein  92.96 
 
 		 142 aa  277  4e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.285177  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2251  transmembrane pair domain protein  92.25 
 
 		 142 aa  274  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.389341  normal  0.485214 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2480  hypothetical protein  74.82 
 
 		 147 aa  221  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28430  hypothetical protein  72.66 
 
 		 147 aa  219  9e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318843 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1348  transmembrane pair domain-containing protein  70.5 
 
 		 145 aa  216  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000078602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4339  transmembrane pair  69.78 
 
 		 146 aa  212  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4292  transmembrane pair domain protein  61.87 
 
 		 154 aa  163  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.657806 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0196  transmembrane pair domain-containing protein  50 
 
 		 154 aa  157  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1694  transmembrane pair domain-containing protein  56.34 
 
 		 169 aa  155  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.845155 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5226  transmembrane pair domain-containing protein  51.41 
 
 		 146 aa  155  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0403  transmembrane pair  53.9 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4923  transmembrane pair domain-containing protein  51.41 
 
 		 146 aa  154  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4695  transmembrane pair domain-containing protein  49.3 
 
 		 146 aa  152  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.262095 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3019  transmembrane pair  50.7 
 
 		 146 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5347  transmembrane pair domain-containing protein  50.7 
 
 		 146 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0209953  normal  0.410913 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0301  transmembrane protein  48.59 
 
 		 149 aa  150  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3382  transmembrane pair domain-containing protein  50.37 
 
 		 146 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0170  transmembrane pair domain protein  52.9 
 
 		 153 aa  144  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0217  transmembrane pair domain-containing protein  48.15 
 
 		 164 aa  143  9e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0138  transmembrane pair domain-containing protein  48.89 
 
 		 162 aa  137  6e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2031  hypothetical protein  53.24 
 
 		 148 aa  135  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.595461  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0739  hypothetical protein  53.24 
 
 		 148 aa  135  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.624879  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0647  hypothetical protein  53.24 
 
 		 148 aa  135  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.13427  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1937  hypothetical protein  54.35 
 
 		 185 aa  135  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0156  transmembrane pair domain protein  47.76 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0461  membrane protein  39.13 
 
 		 169 aa  124  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.406706 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3200  transmembrane pair  38.69 
 
 		 141 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5167  transmembrane pair domain-containing protein  38.69 
 
 		 141 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.120702  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5112  transmembrane pair domain-containing protein  38.69 
 
 		 141 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0749  transmembrane pair  39.26 
 
 		 196 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.266324 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3447  transmembrane pair domain protein  42.03 
 
 		 143 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2392  transmembrane pair domain-containing protein  42.19 
 
 		 145 aa  107  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2317  transmembrane pair domain-containing protein  42.03 
 
 		 143 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2489  transmembrane pair domain-containing protein  42.03 
 
 		 143 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00588447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0923  transmembrane pair domain-containing protein  39.84 
 
 		 148 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.147874 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2274  transmembrane pair domain-containing protein  41.41 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1744  transmembrane pair  40.62 
 
 		 152 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808651  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2356  transmembrane pair domain-containing protein  40.62 
 
 		 148 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2377  transmembrane pair domain-containing protein  40.62 
 
 		 148 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26850  hypothetical protein  38.28 
 
 		 171 aa  103  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2930  transmembrane pair domain-containing protein  39.86 
 
 		 143 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.47404  normal  0.248627 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5695  hypothetical protein  39.84 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.516693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2274  hypothetical protein  37.5 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316534  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15630  predicted membrane protein  40.74 
 
 		 179 aa  102  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00366593  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3587  transmembrane pair domain-containing protein  36.36 
 
 		 144 aa  100  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3358  transmembrane pair  37.5 
 
 		 159 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0242065  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3587  hypothetical protein  33.85 
 
 		 169 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2263  transmembrane pair domain-containing protein  36.8 
 
 		 146 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3512  transmembrane pair domain protein  36.8 
 
 		 146 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2416  transmembrane pair domain-containing protein  39.68 
 
 		 142 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3037  transmembrane pair domain-containing protein  37.3 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3488  transmembrane pair domain-containing protein  35.16 
 
 		 155 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1025  transmembrane pair domain protein  35.66 
 
 		 156 aa  90.9  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2213  hypothetical protein  34.62 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1304  hypothetical protein  34.62 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0698  hypothetical protein  34.62 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2532  hypothetical protein  34.62 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1143  hypothetical protein  34.62 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2082  hypothetical protein  34.62 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.120286  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1151  hypothetical protein  33.85 
 
 		 151 aa  88.2  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.171517  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4117  transmembrane pair domain protein  34.92 
 
 		 145 aa  87.8  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4004  transmembrane pair domain protein  34.92 
 
 		 145 aa  87.8  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.502959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0944  hypothetical protein  34.62 
 
 		 151 aa  87.8  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.244377  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2711  transmembrane pair  33.85 
 
 		 177 aa  87.8  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.033662  normal  0.02743 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0789  transmembrane pair domain protein  34.11 
 
 		 177 aa  87.4  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.149154  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4434  transmembrane pair domain-containing protein  33.33 
 
 		 146 aa  86.3  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.521452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0076  transmembrane pair domain protein  33.1 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  hitchhiker  0.00285306 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2542  transmembrane pair domain-containing protein  36.44 
 
 		 149 aa  84  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.4668 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5841  transmembrane pair domain-containing protein  37.68 
 
 		 147 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000571539 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3354  transmembrane pair domain-containing protein  33.33 
 
 		 151 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04790  hypothetical protein  35.48 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791947  normal  0.0241492 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3190  transmembrane pair domain protein  32.56 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3253  transmembrane pair domain protein  32.56 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0302797 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3239  transmembrane pair domain-containing protein  32.56 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.722595  hitchhiker  0.00127863 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3173  transmembrane pair domain protein  32.56 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5096  transmembrane pair domain protein  36.96 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4391  transmembrane pair domain-containing protein  28.78 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.52144 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3256  transmembrane pair domain protein  33.33 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0010771  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1165  transmembrane pair domain protein  37.23 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1331  putative transmembrane protein  33.33 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2729  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1443  transmembrane pair domain-containing protein  33.33 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0621  hypothetical protein  31.16 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0303  transmembrane pair domain-containing protein  31.62 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1038  transmembrane pair domain-containing protein  35 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0348543 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1959  transmembrane pair  40.59 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.147892 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0636  transmembrane pair domain protein  32.43 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3338  transmembrane pair domain-containing protein  28.47 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2673  transmembrane pair domain-containing protein  31.43 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3410  transmembrane pair domain-containing protein  36 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4322  transmembrane pair  30.53 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3301  transmembrane pair domain-containing protein  30.53 
 
 		 152 aa  73.6  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0509  hypothetical protein  32.61 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0285417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0566  transmembrane pair  29.2 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0422  hypothetical protein  27.97 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1406  membrane protein  29.55 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003832  hypothetical protein  26.67 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0348  hypothetical protein  36 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>