23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0098 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0098  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000660133 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0095  hypothetical protein  84.24 
 
 		 184 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000456218 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0080  hypothetical protein  75.61 
 
 		 205 aa  298  3e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000365782 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0095  hypothetical protein  73.66 
 
 		 205 aa  289  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0028  hypothetical protein  43.98 
 
 		 219 aa  158  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.163788  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36450  hypothetical protein  35.48 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00361093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3127  hypothetical protein  34.19 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.95 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.75 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2018  NAD-binding protein, putative  30.19 
 
 		 206 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54690  hypothetical protein  34.19 
 
 		 213 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347798  hitchhiker  0.00000151278 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.81 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4779  hypothetical protein  33.62 
 
 		 213 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421738  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1607  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.9 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2862  putative NADH-flavin reductase protein  32.7 
 
 		 215 aa  45.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0762  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 		 203 aa  45.4  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.117349  normal  0.30102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2535  hypothetical protein  29.7 
 
 		 217 aa  45.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0642  NmrA family protein  24.52 
 
 		 211 aa  42.4  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1882  putative NADH-flavin reductase-like protein  32.04 
 
 		 207 aa  42  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.3 
 
 		 217 aa  42  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251717 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0621  NmrA family protein  27.1 
 
 		 211 aa  42  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.837507  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.33 
 
 		 200 aa  41.6  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0517555 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0824  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.43 
 
 		 213 aa  41.2  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>