251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0081 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_0081  DNA-3-methyladenine glycosylase I  100 
 
 
183 aa  384  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.462301  hitchhiker  0.000000000590719 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0062  DNA-3-methyladenine glycosylase I  93.44 
 
 
183 aa  363  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000318334 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0078  DNA-3-methyladenine glycosylase I  93.44 
 
 
183 aa  364  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0674727  hitchhiker  0.0000000000856753 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0078  DNA-3-methyladenine glycosylase I  92.35 
 
 
183 aa  360  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0348853  normal  0.0800012 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  80.11 
 
 
188 aa  312  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00110  DNA-3-methyladenine glycosidase I  78.02 
 
 
183 aa  288  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0010  DNA-3-methyladenine glycosidase I  78.45 
 
 
183 aa  286  8e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0013  DNA-3-methyladenine glycosylase I  75.96 
 
 
183 aa  277  7e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0011  DNA-3-methyladenine glycosylase I  76.24 
 
 
185 aa  274  5e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00120789  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0183  DNA-3-methyladenine glycosidase I  74.32 
 
 
183 aa  269  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00120  DNA-3-methyladenine glycosylase I  70.72 
 
 
194 aa  256  9e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.63 
 
 
187 aa  226  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00154604  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0040  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.24 
 
 
186 aa  222  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.5 
 
 
187 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0555  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.01 
 
 
214 aa  216  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870987  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0016  DNA-3-methyladenine glycosidase I  53.85 
 
 
191 aa  214  4e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4170  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.75 
 
 
187 aa  214  7e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3785  DNA-3-methyladenine glycosylase  56.98 
 
 
190 aa  213  9e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0018  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.4 
 
 
191 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000168083 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0027  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.11 
 
 
189 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0112451 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.72 
 
 
200 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000164435 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.4 
 
 
190 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000602981 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.4 
 
 
191 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.72 
 
 
200 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0102454 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.72 
 
 
200 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0021  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.42 
 
 
190 aa  211  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.092391  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.3 
 
 
194 aa  210  7e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000247076 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0016  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.85 
 
 
196 aa  210  7e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000166004 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.33 
 
 
186 aa  210  9e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0011  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.07 
 
 
189 aa  210  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00532682 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.17 
 
 
198 aa  209  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4132  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.87 
 
 
190 aa  209  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3964  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  53.63 
 
 
193 aa  208  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.58086  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3837  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  53.63 
 
 
193 aa  207  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.363143  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.63 
 
 
204 aa  207  5e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3977  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  53.3 
 
 
187 aa  207  7e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0163  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.3 
 
 
187 aa  207  8e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3477  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.8 
 
 
188 aa  207  9e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.112409 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4044  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  53.3 
 
 
187 aa  207  9e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3749  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  53.3 
 
 
187 aa  207  9e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4549  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.8 
 
 
188 aa  207  9e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0167  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  53.3 
 
 
187 aa  207  9e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3856  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  53.07 
 
 
193 aa  207  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0666  DNA-3-methyladenine glycosylase I protein  56.42 
 
 
190 aa  206  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3921  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  53.07 
 
 
193 aa  206  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.696634 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4025  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  53.07 
 
 
193 aa  206  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.612137  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.85 
 
 
190 aa  206  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0064  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.44 
 
 
187 aa  206  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4452  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.07 
 
 
187 aa  206  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.748727  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3870  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  53.3 
 
 
187 aa  205  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03399  3-methyl-adenine DNA glycosylase I, constitutive  53.3 
 
 
187 aa  205  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1887  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.4 
 
 
196 aa  205  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03350  hypothetical protein  53.3 
 
 
187 aa  205  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2619  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.49 
 
 
191 aa  205  4e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4925  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  52.75 
 
 
187 aa  203  9e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.571955  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0175  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  53.63 
 
 
193 aa  203  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0153  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.8 
 
 
194 aa  199  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.96 
 
 
212 aa  199  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00010  constitutive 3-methyl-adenine DNA glycosylase I  50.28 
 
 
202 aa  197  7.999999999999999e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3064  DNA-3-methyladenine glycosylase 1  51.63 
 
 
189 aa  197  9e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1237  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.91 
 
 
217 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1255  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.93 
 
 
218 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.454095  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1176  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.83 
 
 
207 aa  196  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.734996  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4822  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.73 
 
 
213 aa  195  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.724787 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1101  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.74 
 
 
198 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0493  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.18 
 
 
204 aa  194  8.000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000244091  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1686  DNA-3-methyladenine glycosylase  49.18 
 
 
212 aa  194  8.000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00244866  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2374  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.4 
 
 
208 aa  194  9e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4305  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.35 
 
 
209 aa  193  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04565  DNA-3-methyladenine glycosidase I  51.67 
 
 
189 aa  192  3e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.902141  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4674  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.8 
 
 
209 aa  192  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.818815  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.82 
 
 
194 aa  192  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3581  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.89 
 
 
191 aa  192  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3094  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.89 
 
 
198 aa  191  5e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1116  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 
217 aa  191  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.182535 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0747  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.83 
 
 
198 aa  191  6e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.829388 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.84 
 
 
208 aa  191  6e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.176992  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0567  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.2 
 
 
191 aa  190  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3518  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.35 
 
 
202 aa  190  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104093  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1417  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.28 
 
 
223 aa  189  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53524  normal  0.801121 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0810  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 
192 aa  190  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0581984  hitchhiker  0.00269095 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0570  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.16 
 
 
183 aa  189  2e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.890211 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2024  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.89 
 
 
194 aa  189  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.488047  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4332  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.28 
 
 
208 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.239227 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1473  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.09 
 
 
190 aa  188  4e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333166  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1605  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.72 
 
 
186 aa  187  5.999999999999999e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4020  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.85 
 
 
208 aa  187  7e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1181  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.89 
 
 
198 aa  187  7e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2464  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.27 
 
 
192 aa  187  8e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2514  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.18 
 
 
196 aa  187  9e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.84 
 
 
199 aa  186  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.62127  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1991  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.88 
 
 
220 aa  185  2e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0957402  normal  0.0568343 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3559  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.15 
 
 
187 aa  184  6e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0678  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 
189 aa  184  7e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000050702 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0495  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.49 
 
 
195 aa  182  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0491  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.17 
 
 
202 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.902381  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4216  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.56 
 
 
186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.779924  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3245  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.44 
 
 
191 aa  182  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3988  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.7 
 
 
221 aa  182  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.138626  decreased coverage  0.000983487 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1277  DNA-3-methyladenine glycosidase I  48.33 
 
 
193 aa  180  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>