17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4744 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4744  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.111943  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2494  hypothetical protein  78.19 
 
 		 333 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1182  hypothetical protein  74.59 
 
 		 298 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.6386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1658  hypothetical protein  74.14 
 
 		 305 aa  449  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0109  hypothetical protein  64.43 
 
 		 305 aa  409  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2728  hypothetical protein  63.61 
 
 		 304 aa  385  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0756893  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2357  hypothetical protein  58.61 
 
 		 302 aa  379  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0335886  normal  0.0299035 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0203  hypothetical protein  67.42 
 
 		 316 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0867  hypothetical protein  57.76 
 
 		 303 aa  374  1e-103  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0890858  normal  0.747224 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1619  hypothetical protein  62.78 
 
 		 314 aa  372  1e-102  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.175531  normal  0.0226832 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3686  hypothetical protein  62.88 
 
 		 310 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.439169  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2447  hypothetical protein  52.38 
 
 		 363 aa  233  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.938237 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5360  hypothetical protein  37.41 
 
 		 344 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0641445 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4314  hypothetical protein  34.52 
 
 		 427 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5090  hypothetical protein  30.18 
 
 		 423 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.948231  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5048  hypothetical protein  29.87 
 
 		 337 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0131682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1538  hypothetical protein  25.7 
 
 		 337 aa  75.9  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.292569  normal  0.943893 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>