203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4060 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4553  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  91.87 
 
 		 406 aa  700    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1336  RNA polymerase ECF-subfamily sigma factor  92.48 
 
 		 412 aa  717    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.341377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4060  RNA polymerase ECF-subfamily sigma factor  100 
 
 		 412 aa  812    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3848  RNA polymerase ECF-subfamily sigma factor  87.86 
 
 		 412 aa  691    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4326  hypothetical protein  70.42 
 
 		 414 aa  520  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.91814  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4032  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  68.81 
 
 		 414 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.268064  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46810  RNA polymerase ECF-subfamily sigma-70 factor  69.06 
 
 		 407 aa  475  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.325328  decreased coverage  0.000000102241 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1484  RNA polymerase ECF-subfamily sigma factor  67.08 
 
 		 411 aa  462  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.159854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4453  RNA polymerase ECF-subfamily sigma factor  56.8 
 
 		 415 aa  430  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3322  RNA polymerase ECF-subfamily sigma-70 factor  53.37 
 
 		 420 aa  421  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000453852 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1109  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  59.25 
 
 		 413 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107204 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0958  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  58.75 
 
 		 413 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2177  RNA polymerase ECF-subfamily sigma factor  56.48 
 
 		 410 aa  404  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6184  putative RNA polymerase sigma factor  52.46 
 
 		 418 aa  354  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.805414  normal  0.819785 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4650  RNA polymerase ECF-subfamily sigma factor  52.33 
 
 		 409 aa  349  5e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.267181  normal  0.578872 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1753  putative RNA polymerase sigma-24 subunit, ECF subfamily  51.13 
 
 		 406 aa  347  2e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620196  normal  0.802735 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3349  RNA polymerase ECF-subfamily sigma factor  49.76 
 
 		 436 aa  346  5e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.220451  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3417  putative RNA polymerase sigma-24 subunit, ECF subfamily  50.84 
 
 		 429 aa  337  2.9999999999999997e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.133297  normal  0.0141412 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4226  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  51.37 
 
 		 410 aa  335  9e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.094038 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2465  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  51.59 
 
 		 408 aa  333  5e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00327105  hitchhiker  0.00432991 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4217  sigma-70 region 2 domain-containing protein  52.63 
 
 		 413 aa  331  1e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1556  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  49.14 
 
 		 429 aa  330  3e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00576969  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4614  sigma-70 region 2 domain-containing protein  50.24 
 
 		 413 aa  329  6e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3058  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  51.25 
 
 		 407 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00390728  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5266  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  48.18 
 
 		 433 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0282  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  50.25 
 
 		 431 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2313  sigma-70 region 2 domain-containing protein  52.11 
 
 		 437 aa  314  9.999999999999999e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.326435 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1460  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  45.7 
 
 		 437 aa  312  7.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.498259  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0381  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  47.12 
 
 		 401 aa  310  4e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0518343  decreased coverage  0.00694319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4578  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  51.17 
 
 		 419 aa  306  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.638987  normal  0.470788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3137  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  46.91 
 
 		 416 aa  306  4.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0562  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  44.68 
 
 		 431 aa  306  4.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112757 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2508  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  49.26 
 
 		 390 aa  305  7e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4027  putative sigma factor  45.72 
 
 		 436 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3921  putative sigma factor  46.25 
 
 		 435 aa  303  4.0000000000000003e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.67535  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8875  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  48.48 
 
 		 432 aa  303  4.0000000000000003e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4226  RNA polymerase sigma factor containing a TPR repeat domain-like protein  44.8 
 
 		 680 aa  303  5.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338891  normal  0.0144943 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1701  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  45.72 
 
 		 418 aa  301  1e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2832  RNA polymerase ECF-subfamily sigma factor  47.03 
 
 		 429 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.72369  normal  0.923005 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3537  putative RNA polymerase sigma-24 subunit, ECF subfamily  49.12 
 
 		 413 aa  301  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5825  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  46.7 
 
 		 435 aa  300  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4085  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  51.13 
 
 		 429 aa  298  9e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.535273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4397  putative sigma-70 factor, ECF subfamily  49.88 
 
 		 428 aa  298  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0260182  normal  0.0263489 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3653  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  48.48 
 
 		 427 aa  297  2e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0828573  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5550  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  46.81 
 
 		 420 aa  297  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5201  putative RNA polymerase sigma-24 subunit, ECF subfamily  46.93 
 
 		 393 aa  297  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603065  normal  0.598241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0738  RNA polymerase ECF-subfamily sigma factor  46.25 
 
 		 416 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.481415  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0752  RNA polymerase ECF-subfamily sigma factor  46.25 
 
 		 416 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.197672 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5463  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  47.56 
 
 		 420 aa  297  3e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.37967 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3587  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  48.41 
 
 		 426 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6195  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  50.87 
 
 		 420 aa  294  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.694059  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4314  RNA polymerase ECF-subfamily sigma factor  41.06 
 
 		 425 aa  293  3e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.241702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2146  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  44.98 
 
 		 434 aa  293  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0732  RNA polymerase ECF-subfamily sigma factor  45.48 
 
 		 416 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.290174  normal  0.524632 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18240  RNA polymerase, sigma subunit, ECF family  44.98 
 
 		 428 aa  293  3e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.542706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3462  ECF subfamily RNA polymerase sigma-70 factor  41.91 
 
 		 413 aa  292  7e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  hitchhiker  0.000910596 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7116  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  46.54 
 
 		 424 aa  292  9e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3324  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  45.07 
 
 		 412 aa  291  1e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025109  normal  0.227856 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5547  ECF subfamily RNA polymerase sigma-70 factor  43.28 
 
 		 425 aa  291  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151151  normal  0.328912 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0814  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  46.23 
 
 		 403 aa  291  1e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.839992  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8236  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  44.63 
 
 		 461 aa  289  5.0000000000000004e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3656  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  46.88 
 
 		 426 aa  289  7e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2628  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  49.62 
 
 		 421 aa  288  8e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101109  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2337  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  46.83 
 
 		 419 aa  288  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000298794  hitchhiker  0.000148317 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2091  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  47.42 
 
 		 408 aa  288  1e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.319212  normal  0.876924 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0869  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  42.79 
 
 		 651 aa  286  5e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456252  normal  0.192635 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0019  putative RNA polymerase sigma factor  46.21 
 
 		 428 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.962895  normal  0.592717 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4075  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  44.69 
 
 		 419 aa  285  7e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0382  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  45.21 
 
 		 420 aa  285  1.0000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4097  RNA polymerase ECF-subfamily sigma factor  44.89 
 
 		 434 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3499  putative sigma factor  47.19 
 
 		 427 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.371795  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0348  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  46.28 
 
 		 420 aa  284  2.0000000000000002e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.155895 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2135  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  46.65 
 
 		 428 aa  284  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.387852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5744  putative RNA polymerase sigma-24 subunit, ECF subfamily  47.97 
 
 		 438 aa  282  6.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.643719  normal  0.514642 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0536  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  46.94 
 
 		 422 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.726292  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4345  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  43.26 
 
 		 415 aa  282  8.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.756748 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2234  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  44.39 
 
 		 436 aa  281  1e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.532877  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2494  sigma-70 family RNA polymerase sigma factor  47.43 
 
 		 422 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.500327  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0263  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  47.43 
 
 		 421 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0927  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  47.43 
 
 		 421 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1444  sigma-70 family RNA polymerase sigma factor  47.43 
 
 		 422 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1641  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  47.43 
 
 		 422 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2632  sigma-70 family RNA polymerase sigma factor  47.43 
 
 		 422 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0296  sigma-70 family RNA polymerase sigma factor  47.43 
 
 		 422 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0825  RNA polymerase ECF-subfamily sigma factor  43.95 
 
 		 422 aa  281  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1483  RNA polymerase ECF-subfamily sigma factor  45.08 
 
 		 433 aa  280  3e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8666  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  43.78 
 
 		 404 aa  279  8e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2117  sigma-70 region 2 domain-containing protein  44.36 
 
 		 422 aa  278  1e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1109  RNA polymerase ECF-subfamily sigma factor  47.72 
 
 		 414 aa  278  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4759  putative RNA polymerase sigma-24 subunit, ECF subfamily  43.62 
 
 		 413 aa  277  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00302536  hitchhiker  0.000266269 
 
 
-
 
NC_003296  RS03731  hypothetical protein  47.41 
 
 		 424 aa  276  4e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.847937  normal  0.653103 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4762  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  41.84 
 
 		 419 aa  276  6e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931274  normal  0.952904 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3641  RNA polymerase ECF-subfamily sigma factor  45.72 
 
 		 434 aa  274  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.679852 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3347  RNA polymerase ECF-subfamily sigma factor  41.28 
 
 		 446 aa  274  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.691039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1473  RNA polymerase ECF-subfamily sigma factor  46.8 
 
 		 421 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.378859  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0234  hypothetical protein  46.34 
 
 		 424 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0004  RNA polymerase ECF-subfamily sigma factor  47.73 
 
 		 427 aa  272  9e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  hitchhiker  0.000113113 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2282  putative sigma factor  45.85 
 
 		 422 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2857  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  45.18 
 
 		 419 aa  270  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3355  RNA polymerase ECF-subfamily sigma factor  43.18 
 
 		 406 aa  269  7e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.717574  normal  0.451695 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>