11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0713 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0712  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  234  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447892 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0713  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  234  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0470712  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0681  hypothetical protein  98.21 
 
 		 112 aa  233  9e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.421437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4504  hypothetical protein  99.11 
 
 		 112 aa  231  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.855769  normal  0.898368 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4868  hypothetical protein  80 
 
 		 109 aa  183  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60540  hypothetical protein  70.27 
 
 		 113 aa  159  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000195708  normal  0.480408 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1201  hypothetical protein  68.47 
 
 		 117 aa  155  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000218967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4258  hypothetical protein  62.24 
 
 		 109 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5215  hypothetical protein  69.57 
 
 		 93 aa  134  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000212353  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4584  hypothetical protein  63.92 
 
 		 109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.919251  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40840  hypothetical protein  57.27 
 
 		 113 aa  130  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>