154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0438 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0438  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  100 
 
 		 255 aa  507  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0407  heat shock protein DnaJ domain protein  95.29 
 
 		 255 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0441  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  94.9 
 
 		 255 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.524438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4795  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  86.27 
 
 		 254 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.424531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5129  heat shock protein DnaJ-like  65.61 
 
 		 255 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.583171  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0557  DnaJ-like protein DjlA, putative  57.81 
 
 		 255 aa  287  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4621  heat shock protein DnaJ, N-terminal  56.76 
 
 		 255 aa  285  5e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418995  normal  0.628986 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4007  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  59.61 
 
 		 253 aa  255  5e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0742  hypothetical protein  51.76 
 
 		 252 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0971129  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07800  hypothetical protein  50.2 
 
 		 252 aa  208  6e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0234725 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46770  heat shock protein DnaJ-like protein  50.89 
 
 		 253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2106  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.35 
 
 		 260 aa  112  7.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1055  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.66 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00001887  normal  0.815768 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0020  Dna-J like membrane chaperone protein  34.11 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1907  Dna-J like membrane chaperone protein  29.43 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0104  Dna-J like membrane chaperone protein  29.45 
 
 		 271 aa  106  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000467525  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0910  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.46 
 
 		 268 aa  105  7e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.2781  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2075  Dna-J like membrane chaperone protein  28.78 
 
 		 270 aa  105  7e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000570933  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3415  Dna-J like membrane chaperone protein  26.57 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.258634  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0100  heat shock protein DnaJ-like protein  32.7 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03410  Dna-J like membrane chaperone protein  28.03 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0059  Dna-J like membrane chaperone protein  29.82 
 
 		 271 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000613097  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1051  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.86 
 
 		 268 aa  97.1  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00059  Dna-J like membrane chaperone protein  29.82 
 
 		 271 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3544  heat shock protein DnaJ domain protein  29.82 
 
 		 271 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  3.15628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00058  hypothetical protein  29.82 
 
 		 271 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000167853  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0061  Dna-J like membrane chaperone protein  29.82 
 
 		 271 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000128159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0059  Dna-J like membrane chaperone protein  29.56 
 
 		 271 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000026636  normal  0.688624 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3600  Dna-J like membrane chaperone protein  29.82 
 
 		 271 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000271898  hitchhiker  0.00000323028 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0892  Dna-J like membrane chaperone protein  30.5 
 
 		 257 aa  95.9  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.448212  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3569  Dna-J like membrane chaperone protein  29.23 
 
 		 277 aa  95.9  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000771944  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0061  Dna-J like membrane chaperone protein  30.36 
 
 		 271 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000204638  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0099  Dna-J like membrane chaperone protein  30.55 
 
 		 270 aa  95.5  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0104  Dna-J like membrane chaperone protein  30.55 
 
 		 270 aa  95.5  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000141328  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0100  Dna-J like membrane chaperone protein  30.55 
 
 		 270 aa  95.5  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000327368  normal  0.0501049 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0101  Dna-J like membrane chaperone protein  30.55 
 
 		 270 aa  95.5  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000130204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0106  Dna-J like membrane chaperone protein  30.55 
 
 		 270 aa  95.5  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000540131  normal  0.839324 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3440  Dna-J like membrane chaperone protein  29.23 
 
 		 277 aa  95.1  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000544251  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0768  Dna-J like membrane chaperone protein  29.23 
 
 		 277 aa  95.5  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128794  normal  0.0201885 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0604  Dna-J like membrane chaperone protein  29.08 
 
 		 273 aa  93.2  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000356276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0049  Dna-J like membrane chaperone protein  29.09 
 
 		 271 aa  92.8  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000477601  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3109  Dna-J like membrane chaperone protein  28.46 
 
 		 262 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0792555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3073  Dna-J like membrane chaperone protein  28.68 
 
 		 257 aa  90.9  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70305  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1747  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.52 
 
 		 251 aa  90.9  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000151297  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3203  Dna-J like membrane chaperone protein  28.08 
 
 		 262 aa  89  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.967283 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0911  Dna-J like membrane chaperone protein  28.08 
 
 		 262 aa  89  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0269993  normal  0.373919 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3633  Dna-J like membrane chaperone protein  27.76 
 
 		 262 aa  88.6  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0728  Dna-J like membrane chaperone protein  29.45 
 
 		 273 aa  88.2  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000304706  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2262  Dna-J like membrane chaperone protein  25.61 
 
 		 296 aa  87  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0885  Dna-J like membrane chaperone protein  28.08 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00720639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1085  Dna-J like membrane chaperone protein  28.08 
 
 		 262 aa  86.3  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0995  Dna-J like membrane chaperone protein  27.13 
 
 		 262 aa  85.9  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.555246  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2813  Dna-J like membrane chaperone protein  27.65 
 
 		 256 aa  85.1  9e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0603068  normal  0.639961 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0868  Dna-J like membrane chaperone protein  28.24 
 
 		 259 aa  85.1  9e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2289  Dna-J like membrane chaperone protein  25.35 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2882  Dna-J like membrane chaperone protein  26.25 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450671  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4522  Dna-J like membrane chaperone protein  26.16 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2989  Dna-J like membrane chaperone protein  31.86 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.787211  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001661  DnaJ-like protein DjlA  28.46 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1020  Dna-J like membrane chaperone protein  27.76 
 
 		 259 aa  82  0.000000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.325317  normal  0.0319615 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2252  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.69 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0983  Dna-J like membrane chaperone protein  28.46 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.193447  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1052  Dna-J like membrane chaperone protein  28.46 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0982922  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1291  Dna-J like membrane chaperone protein  27.34 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000651268  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0970  Dna-J like membrane chaperone protein  26.82 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0207673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3306  Dna-J like membrane chaperone protein  27.46 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.044478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0397  heat shock protein DnaJ-like  28.83 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00812  Dna-J like membrane chaperone protein  27.48 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3631  Dna-J like membrane chaperone protein  26.55 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.181642  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3828  Dna-J like membrane chaperone protein  26.62 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0372  Dna-J like membrane chaperone protein  25.77 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2865  Dna-J like membrane chaperone protein  26.44 
 
 		 284 aa  75.5  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000787957  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0668  DnaJ domain-containing protein  22.7 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.165012  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2408  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  26.94 
 
 		 236 aa  65.1  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.553614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0977  DnaJ domain-containing protein  24.88 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0827  DnaJ domain-containing protein  24.88 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0606  Dna-J like membrane chaperone protein  26.67 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21113  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3513  Fis family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1837  DnaJ domain-containing protein  24.12 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1630  silent information regulator protein Sir2  20.8 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.071584  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1034  DnaJ domain-containing protein  23.88 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0627693  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1897  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  27.23 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.394264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0557  DnaJ domain-containing protein  20.48 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.223519  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0546  DnaJ-like protein  22.77 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3389  heat shock protein DnaJ-like  22.89 
 
 		 235 aa  52.4  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0567  Dna-J like membrane chaperone protein  37.5 
 
 		 318 aa  52.4  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0637761  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0961  hypothetical protein  24.6 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.483965  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2092  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.99 
 
 		 233 aa  51.6  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.764372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0217  heat shock protein DnaJ domain protein  41.67 
 
 		 412 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4375  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  26.42 
 
 		 240 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.283206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2868  protein of unknown function DUF1332  25.13 
 
 		 235 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1148  chaperone protein DnaJ  37.5 
 
 		 359 aa  49.3  0.00006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.697031  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03720  DnaJ domain containing protein  20.78 
 
 		 249 aa  47.4  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.338466  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4909  protein of unknown function DUF1332  25 
 
 		 245 aa  47  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296192  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0971  chaperone protein DnaJ  41.82 
 
 		 359 aa  47  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0905  protein of unknown function DUF1332  25.48 
 
 		 241 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0299728  normal  0.285713 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0880  heat shock protein DnaJ domain protein  25.1 
 
 		 241 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0942  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  25.48 
 
 		 241 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0233536  normal  0.0990554 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0771  DnaJ-like curved DNA-binding protein  37.5 
 
 		 296 aa  46.2  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.63005e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24547  predicted protein  38.81 
 
 		 2272 aa  46.2  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.733966  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>