25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0095 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0095  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000456218 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0080  hypothetical protein  78.05 
 
 		 205 aa  304  6e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000365782 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0098  hypothetical protein  84.24 
 
 		 182 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000660133 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0095  hypothetical protein  76.59 
 
 		 205 aa  295  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0028  hypothetical protein  42.01 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.163788  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3127  hypothetical protein  38.36 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36450  hypothetical protein  38.06 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00361093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.74 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.45 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2018  NAD-binding protein, putative  31.79 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.74 
 
 		 214 aa  52.4  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1882  putative NADH-flavin reductase-like protein  28.67 
 
 		 207 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54690  hypothetical protein  29.48 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347798  hitchhiker  0.00000151278 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2535  hypothetical protein  29.76 
 
 		 217 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.45 
 
 		 217 aa  45.1  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251717 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4779  hypothetical protein  28.32 
 
 		 213 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421738  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2728  hypothetical protein  32.2 
 
 		 213 aa  43.9  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.763149  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0642  NmrA family protein  32.74 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0621  NmrA family protein  32.74 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.837507  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0762  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.98 
 
 		 203 aa  42.4  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.117349  normal  0.30102 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2548  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 		 357 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.211068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.25 
 
 		 200 aa  41.6  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0517555 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0880  hypothetical protein  25.86 
 
 		 223 aa  41.6  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.533635  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0809  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.24 
 
 		 213 aa  41.2  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.01 
 
 		 204 aa  41.2  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>