92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3120 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3120  recombinase  100 
 
 		 173 aa  355  1.9999999999999998e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.964732  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  49.62 
 
 		 561 aa  131  5e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  44.06 
 
 		 547 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  46.62 
 
 		 540 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  46.32 
 
 		 565 aa  121  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  37.67 
 
 		 537 aa  116  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  47.69 
 
 		 590 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  40 
 
 		 561 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  47.69 
 
 		 551 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  37.69 
 
 		 579 aa  94.4  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7321  putative resolvase  36.09 
 
 		 518 aa  92.8  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  35.21 
 
 		 555 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  33.06 
 
 		 548 aa  81.3  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  33.07 
 
 		 554 aa  79  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  33.07 
 
 		 542 aa  79.3  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0630  resolvase  41.51 
 
 		 247 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  33.61 
 
 		 563 aa  73.2  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0096  hypothetical protein  31.53 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  32.21 
 
 		 506 aa  68.6  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  33.94 
 
 		 510 aa  67.4  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  33.67 
 
 		 484 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  33.67 
 
 		 484 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  32.28 
 
 		 534 aa  59.7  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  32.48 
 
 		 509 aa  58.2  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  31.41 
 
 		 496 aa  58.2  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  38.32 
 
 		 441 aa  55.5  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2577  Resolvase domain protein  41.79 
 
 		 603 aa  55.5  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.551292 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  38.32 
 
 		 441 aa  55.1  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5028  hypothetical protein  48.44 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.284216  normal  0.520699 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  28.19 
 
 		 537 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  26.72 
 
 		 517 aa  53.5  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0440  Resolvase domain protein  30.94 
 
 		 552 aa  50.8  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  28.67 
 
 		 532 aa  50.8  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  37.37 
 
 		 613 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  31.78 
 
 		 527 aa  49.3  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  31.4 
 
 		 539 aa  48.9  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3143  resolvase-like:recombinase  34.09 
 
 		 622 aa  48.9  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  32.31 
 
 		 516 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2714  putative cassette chromosome recombinase resolvase, CcrB like  30.94 
 
 		 641 aa  48.5  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173703  normal  0.344103 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  32.31 
 
 		 516 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  27.34 
 
 		 525 aa  48.1  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  28.8 
 
 		 546 aa  48.1  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  26.39 
 
 		 528 aa  48.1  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  31.3 
 
 		 485 aa  47.8  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  25.17 
 
 		 528 aa  47.8  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4417  recombinase  30.43 
 
 		 517 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  29.6 
 
 		 460 aa  47.8  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  32.53 
 
 		 540 aa  47.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  29.17 
 
 		 525 aa  47  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  22.14 
 
 		 535 aa  46.2  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0320  resolvase domain-containing protein  30.23 
 
 		 531 aa  46.6  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.140685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  32.08 
 
 		 445 aa  46.2  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4607  resolvase-like protein  30 
 
 		 476 aa  46.6  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1125  recombinase  32.04 
 
 		 322 aa  46.6  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0324535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  26.04 
 
 		 494 aa  45.4  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4586  DNA recombinase, putative  34.94 
 
 		 532 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4607  DNA recombinase, putative  34.94 
 
 		 526 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17167  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  28.33 
 
 		 525 aa  45.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0567  Resolvase domain protein  32.43 
 
 		 577 aa  45.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  27.45 
 
 		 562 aa  45.4  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  30.2 
 
 		 546 aa  45.4  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5207  Resolvase domain protein  30.67 
 
 		 598 aa  45.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.914138 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  34.41 
 
 		 550 aa  45.1  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  34.41 
 
 		 555 aa  44.7  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  32.29 
 
 		 489 aa  44.7  0.0006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  30.36 
 
 		 447 aa  44.7  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  29.25 
 
 		 445 aa  44.7  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  25.41 
 
 		 597 aa  44.3  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  36.36 
 
 		 498 aa  44.3  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1368  recombinase  27.59 
 
 		 453 aa  43.9  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.118986  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  29.81 
 
 		 542 aa  43.9  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  25.31 
 
 		 541 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  29.25 
 
 		 445 aa  44.3  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  29.81 
 
 		 542 aa  43.9  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  29.81 
 
 		 542 aa  43.9  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  27.61 
 
 		 586 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1345  recombinase  30.77 
 
 		 515 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.667193 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  27.68 
 
 		 441 aa  42.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  30.21 
 
 		 534 aa  42.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  29.17 
 
 		 537 aa  42.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  38.33 
 
 		 475 aa  42.4  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  30.97 
 
 		 482 aa  42.7  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  30.21 
 
 		 534 aa  42  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0336  Resolvase domain  31.29 
 
 		 500 aa  41.6  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.484454  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3623  recombinase  37.7 
 
 		 515 aa  41.6  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  30.1 
 
 		 665 aa  41.6  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1541  recombinase  36.05 
 
 		 414 aa  41.6  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.343961  normal  0.0432678 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0394  Recombinase  43.75 
 
 		 541 aa  41.2  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.018734 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7609  resolvase domain-containing protein  30.67 
 
 		 690 aa  41.2  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.918322 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  29.17 
 
 		 534 aa  41.2  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  29.17 
 
 		 534 aa  40.8  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0143  recombinase  27.74 
 
 		 565 aa  40.8  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>