34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2126 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2856  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  313  7e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2272  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  313  7e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2126  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  313  7e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1329  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  313  7e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000101397  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1323  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  313  7e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0941  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  313  7e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0457  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  313  7e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0831  hypothetical protein  38.26 
 
 
182 aa  87  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0505  hypothetical protein  38.26 
 
 
182 aa  87  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0665  hypothetical protein  38.26 
 
 
182 aa  87  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0330  hypothetical protein  38.26 
 
 
182 aa  87  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.197697 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2033  hypothetical protein  38.46 
 
 
182 aa  85.5  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2401  hypothetical protein  38.46 
 
 
182 aa  84.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1123  hypothetical protein  38.64 
 
 
192 aa  84  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0711  hypothetical protein  38.64 
 
 
192 aa  84  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.149819 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6467  hypothetical protein  38.64 
 
 
192 aa  83.6  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106702 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0131  hypothetical protein  38.64 
 
 
192 aa  83.6  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0100  hypothetical protein  38.64 
 
 
192 aa  83.6  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7261  hypothetical protein  38.64 
 
 
192 aa  83.6  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6583  hypothetical protein  38.64 
 
 
192 aa  83.6  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0521516 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5180  hypothetical protein  38.64 
 
 
192 aa  83.6  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7428  hypothetical protein  37.88 
 
 
192 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.620538 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2007  hypothetical protein  40.17 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699687  normal  0.0916492 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5481  Tn6049 mobility protein  40.17 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.149189  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2404  hypothetical protein  40.17 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000263432  decreased coverage  0.00000320816 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2553  hypothetical protein  40.17 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.273061  normal  0.545866 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2838  hypothetical protein  40.17 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3143  hypothetical protein  40.17 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2001  hypothetical protein  40.17 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0792422 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0322  hypothetical protein  40.17 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.498296 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6334  protein involved in mobility of Tn6049  40.17 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000564545  hitchhiker  0.000732588 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6181  Tn6049 mobility protein  40.17 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14752  normal  0.961677 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3932  Tn6049 mobility protein  40.17 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123254  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4425  Tn6049 mobility protein  40.17 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000754166  normal  0.287587 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>