19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1883 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1883  phage recombination protein Bet  100 
 
 		 322 aa  667    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0851  putative prophage LambdaCh01, recombination protein Bet  47.72 
 
 		 292 aa  203  3e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000847263  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0056  phage recombination protein Bet  48.85 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00827419  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1235  phage recombination protein Bet  27.22 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2416  phage recombination protein Bet  43.94 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.110715  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0590  phage recombination protein Bet  26.56 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0805  phage recombination protein Bet  28.57 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.501424  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2931  phage recombination protein Bet  28.57 
 
 		 261 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.321205  decreased coverage  3.3595200000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3241  phage recombination protein Bet  28.57 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0062068  hitchhiker  0.00000845343 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3564  phage recombination protein Bet  28.57 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0102109  hitchhiker  5.30303e-19 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2876  phage recombination protein Bet  28.57 
 
 		 261 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00954022  normal  0.0589709 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00713  hypothetical protein  28.57 
 
 		 261 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10013  bet  28.57 
 
 		 261 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1112  recombination protein bet  28 
 
 		 261 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.104209  normal  0.366414 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0884  recombination protein bet  30.46 
 
 		 215 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0109  phage recombination protein Bet  24.85 
 
 		 329 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.237618 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2377  phage recombination protein Bet, putative  28.57 
 
 		 347 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00019596  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02960  phage recombination protein Bet  28.38 
 
 		 224 aa  44.7  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000371623  hitchhiker  1.14884e-46 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1077  phage recombination protein Bet  24.27 
 
 		 308 aa  42.7  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000938962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>