16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1538 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1538  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  358  3e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1476  hypothetical protein  40.24 
 
 
181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000165902 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4085  hypothetical protein  38.29 
 
 
178 aa  112  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0097  hypothetical protein  35.29 
 
 
181 aa  111  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0134  hypothetical protein  34.71 
 
 
181 aa  110  9e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2394  major facilitator superfamily permease  38.76 
 
 
184 aa  108  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3673  hypothetical protein  37.06 
 
 
179 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0092  hypothetical protein  33.93 
 
 
180 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4447  hypothetical protein  33.93 
 
 
180 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4307  hypothetical protein  33.93 
 
 
180 aa  99.8  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4252  hypothetical protein  33.93 
 
 
180 aa  98.2  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3864  hypothetical protein  33.93 
 
 
180 aa  95.5  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3957  hypothetical protein  33.93 
 
 
180 aa  95.5  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0134  hypothetical protein  33.52 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1705  hypothetical protein  27.84 
 
 
195 aa  72.4  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1802  hypothetical protein  24.55 
 
 
182 aa  56.2  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>