26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1498 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1498  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  148  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.743357  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2961  hypothetical protein  57.97 
 
 		 93 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0295  hypothetical protein  55.07 
 
 		 93 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0311  hypothetical protein  55.07 
 
 		 93 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.34678  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0352  hypothetical protein  51.47 
 
 		 93 aa  70.5  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1311  hypothetical protein  48.53 
 
 		 94 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.328492  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7032  hypothetical protein  40 
 
 		 93 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00925543  normal  0.081206 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0040  hypothetical protein  49.21 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1002  hypothetical protein  44.12 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0256071 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0482  hypothetical protein  43.94 
 
 		 116 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000043148  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2964  Fis family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3974  Fis family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.984172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3471  hypothetical protein  50.72 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4454  transcriptional regulator, Fis family  38.98 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.121305  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0156  hypothetical protein  48.53 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1854  hypothetical protein  51.47 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.703432  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4064  hypothetical protein  51.47 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3340  hypothetical protein  51.47 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.652813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4177  hypothetical protein  51.47 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.84562  normal  0.0519457 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3584  hypothetical protein  51.47 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4190  hypothetical protein  51.47 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3662  protein of unknown function UPF0150  34.48 
 
 		 146 aa  47.8  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0655  hypothetical protein  47.06 
 
 		 94 aa  47  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236003  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1578  hypothetical protein  50 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206064  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0390  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.116941  normal  0.945426 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0607  hypothetical protein  46.38 
 
 		 94 aa  41.2  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>