31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0893 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0893  hypothetical protein  100 
 
 		 442 aa  902    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.218351  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2424  hypothetical protein  54.36 
 
 		 420 aa  455  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3575  hypothetical protein  55.66 
 
 		 414 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.145678  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1287  hypothetical protein  47.39 
 
 		 420 aa  349  5e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.46065e-21 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2512  hypothetical protein  36.53 
 
 		 413 aa  249  9e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000231134  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1395  hypothetical protein  36.98 
 
 		 422 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000260266  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3009  hypothetical protein  32.73 
 
 		 418 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0425000000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2601  hypothetical protein  34.04 
 
 		 443 aa  205  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000556017  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0689  hypothetical protein  31.08 
 
 		 459 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0866657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2725  hypothetical protein  28.69 
 
 		 414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1931  hypothetical protein  29.33 
 
 		 393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.930432  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1868  hypothetical protein  29.26 
 
 		 385 aa  107  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1982  hypothetical protein  30.35 
 
 		 394 aa  102  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000915947 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2244  hypothetical protein  26.44 
 
 		 387 aa  100  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00780983  normal  0.0297405 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1045  hypothetical protein  29.91 
 
 		 416 aa  99.8  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39000  hypothetical protein  25.76 
 
 		 399 aa  94  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00275655  normal  0.388299 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3321  hypothetical protein  25.87 
 
 		 399 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.242267  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2873  hypothetical protein  29.25 
 
 		 399 aa  91.3  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0118  hypothetical protein  27.53 
 
 		 496 aa  89.4  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.157698 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2343  hypothetical protein  28.32 
 
 		 513 aa  87  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.902991 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3141  hypothetical protein  24.44 
 
 		 395 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2662  hypothetical protein  24.44 
 
 		 395 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.723474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2170  hypothetical protein  24.44 
 
 		 395 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3256  hypothetical protein  29.77 
 
 		 495 aa  84.3  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1367  hypothetical protein  28.09 
 
 		 536 aa  82.8  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3661  hypothetical protein  29.2 
 
 		 503 aa  80.1  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.159613  normal  0.176734 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1938  hypothetical protein  25.56 
 
 		 394 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.915381 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2937  hypothetical protein  25.54 
 
 		 399 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.336844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1652  hypothetical protein  26.35 
 
 		 505 aa  67  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.651721 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2453  hypothetical protein  25.46 
 
 		 401 aa  63.9  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000146926  normal  0.807051 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3046  hypothetical protein  24.38 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>