31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2892 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2892  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  100 
 
 
267 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0118033  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2500  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  52.85 
 
 
297 aa  271  1e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2718  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  48.11 
 
 
294 aa  253  3e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0057  FtsQ protein, putative  47.44 
 
 
291 aa  236  2e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00293686  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2107  FtsQ protein, putative  45.11 
 
 
281 aa  217  1e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.23865  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2519  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  41.6 
 
 
287 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.655608 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2260  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  41.52 
 
 
286 aa  188  5.999999999999999e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00197696  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3324  hypothetical protein  23.02 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200003  normal  0.682963 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2699  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  25.3 
 
 
273 aa  69.7  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0582  cell division protein FtsQ, putative  22.26 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3472  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.02 
 
 
274 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0350716  normal  0.0407189 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09110  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  26.96 
 
 
235 aa  54.3  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0301119  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0946  cell division protein FtsQ  29.67 
 
 
331 aa  53.1  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0427417  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4754  hypothetical protein  21.67 
 
 
257 aa  53.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2737  cell division protein  22.99 
 
 
269 aa  51.6  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1059  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  25.27 
 
 
245 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0415  D-alanine--D-alanine ligase  25 
 
 
627 aa  50.1  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3970  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.41 
 
 
275 aa  49.3  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.035895  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1112  cell division protein FtsQ  26.32 
 
 
244 aa  48.5  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.962822  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2873  cell division protein FtsQ  30.23 
 
 
222 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.57227 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1432  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.76 
 
 
236 aa  47  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7385  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1409  polypeptide-transport-associated domain-containing protein FtsQ-type  30.61 
 
 
221 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.571573  normal  0.075742 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2408  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  29.76 
 
 
328 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.165705 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2425  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.19 
 
 
334 aa  44.3  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00120327  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0744  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.52 
 
 
278 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0312415  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3453  cell division septal protein-like  29.27 
 
 
347 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.133207 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0442  cell division protein FtsQ  38.6 
 
 
286 aa  43.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.462721  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5761  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  31.25 
 
 
240 aa  42.7  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.258575  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2784  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.28 
 
 
298 aa  42.4  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.397711  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0749  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.65 
 
 
232 aa  42.7  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.116694  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1602  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  27.45 
 
 
256 aa  42.4  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>