77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2876 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2876  deoxyhypusine synthase-like protein  100 
 
 
349 aa  724    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2699  deoxyhypusine synthase-like protein  90.52 
 
 
349 aa  661    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2480  deoxyhypusine synthase-like protein  87.93 
 
 
349 aa  654    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2089  deoxyhypusine synthase-like protein  86.21 
 
 
349 aa  637    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0073  deoxyhypusine synthase-like protein  89.37 
 
 
349 aa  655    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2235  deoxyhypusine synthase-like protein  82.95 
 
 
352 aa  615  1e-175  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0578159  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2484  deoxyhypusine synthase-like protein  80.69 
 
 
352 aa  607  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0166  deoxyhypusine synthase-like protein  66.18 
 
 
347 aa  466  9.999999999999999e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1464  deoxyhypusine synthase-like protein  62.73 
 
 
375 aa  439  9.999999999999999e-123  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.781396  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0732  deoxyhypusine synthase-like protein  59.35 
 
 
353 aa  409  1e-113  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0839  deoxyhypusine synthase-like protein  59.35 
 
 
352 aa  409  1e-113  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0376  deoxyhypusine synthase-like protein  58.24 
 
 
348 aa  387  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0257  deoxyhypusine synthase-like protein  55.1 
 
 
350 aa  379  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4663  deoxyhypusine synthase-like protein  53.82 
 
 
350 aa  366  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2038  putative deoxyhypusine synthase  39.47 
 
 
345 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.1291  normal  0.264826 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1799  putative deoxyhypusine synthase  40.67 
 
 
321 aa  212  9e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.470031  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2389  putative deoxyhypusine synthase  39.27 
 
 
323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.74286 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1180  putative deoxyhypusine synthase  37.82 
 
 
339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.390749  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2903  putative deoxyhypusine synthase  37.76 
 
 
322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0061  putative deoxyhypusine synthase  34.19 
 
 
317 aa  172  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1200  putative deoxyhypusine synthase  36.54 
 
 
308 aa  171  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1329  putative deoxyhypusine synthase  31.44 
 
 
335 aa  160  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.644418 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3109  deoxyhypusine synthase  31.2 
 
 
357 aa  158  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2574  putative deoxyhypusine synthase  31.02 
 
 
336 aa  155  7e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.116993  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0184  putative deoxyhypusine synthase  33.12 
 
 
312 aa  154  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2546  putative deoxyhypusine synthase  33.33 
 
 
306 aa  153  5e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.482649 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0029  putative deoxyhypusine synthase  34.72 
 
 
311 aa  150  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1997  putative deoxyhypusine synthase  31.02 
 
 
345 aa  149  8e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.428923  normal  0.191458 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1312  deoxyhypusine synthase  31.01 
 
 
367 aa  145  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0118819 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1942  deoxyhypusine synthase  30.72 
 
 
357 aa  142  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168438  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0928  deoxyhypusine synthase-like protein  31.87 
 
 
354 aa  138  2e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.646253 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0154  putative deoxyhypusine synthase  29.07 
 
 
312 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.124877  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2349  putative deoxyhypusine synthase  31.13 
 
 
311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0976  putative deoxyhypusine synthase  30.52 
 
 
328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1485  deoxyhypusine synthase  30.92 
 
 
383 aa  124  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0390114  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1946  Deoxyhypusine synthase  31.4 
 
 
312 aa  124  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0305286  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4976  deoxyhypusine synthase-like protein  32.43 
 
 
400 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0041  deoxyhypusine synthase  32.61 
 
 
311 aa  122  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3738  Deoxyhypusine synthase  27.22 
 
 
323 aa  120  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02480  deoxyhypusine synthase, putative  29.34 
 
 
341 aa  120  3e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1142  putative deoxyhypusine synthase  29.54 
 
 
335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.280864  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1896  deoxyhypusine synthase-like protein  30.94 
 
 
383 aa  119  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0708136 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1136  putative deoxyhypusine synthase  28.62 
 
 
335 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1539  putative deoxyhypusine synthase  27.55 
 
 
335 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1473  putative deoxyhypusine synthase  29.45 
 
 
342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.333563  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0815  putative deoxyhypusine synthase  28.31 
 
 
335 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1753  putative deoxyhypusine synthase  29.81 
 
 
310 aa  115  8.999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000310195  normal  0.0979592 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0648  putative deoxyhypusine synthase  31.01 
 
 
313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1276  deoxyhypusine synthase-like protein  31.35 
 
 
390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1868  deoxyhypusine synthase  27.92 
 
 
324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0413  putative deoxyhypusine synthase  28.05 
 
 
328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1970  putative deoxyhypusine synthase  27.76 
 
 
292 aa  104  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35514  predicted protein  30.65 
 
 
342 aa  100  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0201246  normal  0.36566 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88952  predicted protein  24.04 
 
 
379 aa  95.5  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.64572  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0783  putative deoxyhypusine synthase  27.33 
 
 
292 aa  94.4  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.363261  normal  0.028647 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1171  putative deoxyhypusine synthase  26.09 
 
 
295 aa  92  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46999  predicted protein  26.67 
 
 
420 aa  92.4  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.970399  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3460  deoxyhypusine synthase  27.92 
 
 
324 aa  90.9  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0388485  normal  0.010011 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1873  deoxyhypusine synthase  27.37 
 
 
324 aa  88.6  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0861  putative deoxyhypusine synthase  25.91 
 
 
292 aa  87.8  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1939  deoxyhypusine synthase  27.27 
 
 
324 aa  87.4  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.952214  normal  0.0341387 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08075  deoxyhypusine synthase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01740)  26.06 
 
 
390 aa  85.9  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.70919  normal  0.453021 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2448  deoxyhypusine synthase  27.36 
 
 
325 aa  83.2  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.914534  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3346  deoxyhypusine synthase  28.17 
 
 
325 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2079  deoxyhypusine synthase  27.36 
 
 
325 aa  82  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.362575 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1218  deoxyhypusine synthase  28.08 
 
 
326 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.28828  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3135  deoxyhypusine synthase  25.35 
 
 
345 aa  80.1  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3399  deoxyhypusine synthase  27.49 
 
 
326 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0490  deoxyhypusine synthase  26.92 
 
 
324 aa  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1628  deoxyhypusine synthase  26.23 
 
 
348 aa  77.4  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0287  deoxyhypusine synthase  26.17 
 
 
326 aa  70.1  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.321277  normal  0.0769858 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00515  hypothetical protein  23.47 
 
 
324 aa  63.2  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0143  hypothetical protein  60 
 
 
102 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2810  deoxyhypusine synthase  23.71 
 
 
322 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3097  deoxyhypusine synthase  23.3 
 
 
340 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0229205  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3292  deoxyhypusine synthase  22.3 
 
 
340 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0554122  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3197  deoxyhypusine synthase  21.94 
 
 
340 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>