44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1439 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1439  protein of unknown function DUF307  100 
 
 		 146 aa  292  1e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00732681  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5323  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000585  hypothetical protein  35.61 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.87989  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05283  hypothetical protein  34.85 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0191  hypothetical protein  31.51 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1392  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.526699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2681  hypothetical protein  31.25 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.95193  normal  0.733231 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1940  hypothetical protein  31.25 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00153231  normal  0.0153994 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1374  hypothetical protein  28.08 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.422006  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2641  hypothetical protein  32.03 
 
 		 135 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2352  hypothetical protein  29.69 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.363648  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1744  hypothetical protein  31.25 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.810312  hitchhiker  0.00220396 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2470  hypothetical protein  29.69 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.503038  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1977  hypothetical protein  29.69 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2716  hypothetical protein  31.25 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0680  hypothetical protein  31.01 
 
 		 120 aa  48.9  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1838  protein of unknown function DUF307  30.71 
 
 		 154 aa  47.8  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.554714  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0764  protein of unknown function DUF307  31.78 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1575  hypothetical protein  28.24 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00720647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2280  hypothetical protein  28.91 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2602  hypothetical protein  32.11 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2330  hypothetical protein  29.69 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0680  hypothetical protein  30.23 
 
 		 120 aa  47  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.945663  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2322  hypothetical protein  26.92 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.389876  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1881  hypothetical protein  30.47 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6516  protein of unknown function DUF307  27.19 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1758  hypothetical protein  30.41 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0330869  hitchhiker  0.000134673 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2148  hypothetical protein  28.8 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.508072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2147  hypothetical protein  26.92 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1180  protein of unknown function DUF307  31.5 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00716366  normal  0.222129 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0662  protein of unknown function DUF307  30.77 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1822  hypothetical protein  35.34 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204433  normal  0.65949 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1698  protein of unknown function DUF307  32.58 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.888972  hitchhiker  0.00956065 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1032  hypothetical protein  31.25 
 
 		 148 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00321525  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2694  protein of unknown function DUF307  28.12 
 
 		 121 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1115  hypothetical protein  31.25 
 
 		 148 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.270927  hitchhiker  0.00000000396693 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1183  hypothetical protein  31.25 
 
 		 148 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1149  hypothetical protein  31.25 
 
 		 148 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1137  hypothetical protein  31.25 
 
 		 147 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.460412  normal  0.971647 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0514  protein of unknown function DUF307  31.01 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00567512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2626  hypothetical protein  27.21 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.421081  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2537  hypothetical protein  27.21 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000184645  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10870  predicted membrane protein  29.92 
 
 		 130 aa  40  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3487  hypothetical protein  29.41 
 
 		 133 aa  40  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>