256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0685 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0685  7-cyano-7-deazaguanine reductase  100 
 
 
116 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0514  7-cyano-7-deazaguanine reductase  80.7 
 
 
118 aa  202  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1627  7-cyano-7-deazaguanine reductase  77.39 
 
 
116 aa  200  7e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.206183 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0561  7-cyano-7-deazaguanine reductase  79.82 
 
 
116 aa  199  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0579  7-cyano-7-deazaguanine reductase  80.53 
 
 
118 aa  196  6e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.254846 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1759  7-cyano-7-deazaguanine reductase  78.76 
 
 
116 aa  196  7e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0608  7-cyano-7-deazaguanine reductase  77.88 
 
 
142 aa  193  6e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0282  7-cyano-7-deazaguanine reductase  59.09 
 
 
119 aa  142  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.290856  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2723  7-cyano-7-deazaguanine reductase  58.18 
 
 
118 aa  141  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.819382  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0160  7-cyano-7-deazaguanine reductase  55.96 
 
 
129 aa  130  6e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1696  7-cyano-7-deazaguanine reductase  52.29 
 
 
129 aa  128  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.510769  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2441  7-cyano-7-deazaguanine reductase  59.22 
 
 
129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00534909  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1140  7-cyano-7-deazaguanine reductase  52.29 
 
 
132 aa  124  5e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.972823  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1832  7-cyano-7-deazaguanine reductase  55.96 
 
 
132 aa  122  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.220331  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2120  7-cyano-7-deazaguanine reductase  48.21 
 
 
133 aa  121  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000269518  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1773  7-cyano-7-deazaguanine reductase  48.65 
 
 
165 aa  120  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0678  GTP cyclohydrolase I  51.38 
 
 
129 aa  120  8e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2643  7-cyano-7-deazaguanine reductase  47.75 
 
 
131 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3421  GTP cyclohydrolase I  47.79 
 
 
128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0847539  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0644  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 
139 aa  118  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.486051  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4244  7-cyano-7-deazaguanine reductase  49.54 
 
 
122 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0237434  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4219  7-cyano-7-deazaguanine reductase  49.54 
 
 
122 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1881  GTP cyclohydrolase I  48.15 
 
 
118 aa  118  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0331  7-cyano-7-deazaguanine reductase  48.62 
 
 
122 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0279234  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4094  7-cyano-7-deazaguanine reductase  48.62 
 
 
159 aa  117  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0823325  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0752  7-cyano-7-deazaguanine reductase  46.79 
 
 
141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.384081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0899  7-cyano-7-deazaguanine reductase  46.79 
 
 
141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.826218  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1067  7-cyano-7-deazaguanine reductase  47.75 
 
 
165 aa  114  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.179848  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1397  7-cyano-7-deazaguanine reductase  46.85 
 
 
165 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0185646  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1227  7-cyano-7-deazaguanine reductase  46.79 
 
 
139 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0657865  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3946  7-cyano-7-deazaguanine reductase  46.85 
 
 
165 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105864  normal  0.027298 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1461  7-cyano-7-deazaguanine reductase  46.85 
 
 
165 aa  114  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.256472  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1260  7-cyano-7-deazaguanine reductase  46.85 
 
 
165 aa  114  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1235  7-cyano-7-deazaguanine reductase  46.85 
 
 
165 aa  114  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1259  7-cyano-7-deazaguanine reductase  46.85 
 
 
165 aa  114  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.223967  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1500  7-cyano-7-deazaguanine reductase  46.85 
 
 
165 aa  114  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000420055  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1362  7-cyano-7-deazaguanine reductase  46.85 
 
 
165 aa  114  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0220025  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1433  7-cyano-7-deazaguanine reductase  46.85 
 
 
165 aa  114  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000199367 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1233  7-cyano-7-deazaguanine reductase  47.27 
 
 
165 aa  114  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2027  7-cyano-7-deazaguanine reductase  48.62 
 
 
129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1400  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45.87 
 
 
139 aa  111  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2198  GTP cyclohydrolase I  55.79 
 
 
134 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.116232  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0840  7-cyano-7-deazaguanine reductase  46.23 
 
 
123 aa  110  6e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000632254  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2025  7-cyano-7-deazaguanine reductase  53 
 
 
165 aa  110  9e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0305179  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0872  7-cyano-7-deazaguanine reductase  50 
 
 
163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.697802  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1578  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45.87 
 
 
140 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.807484  normal  0.921264 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2063  7-cyano-7-deazaguanine reductase  46.15 
 
 
117 aa  107  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1347  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45.05 
 
 
154 aa  105  3e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0653  7-cyano-7-deazaguanine reductase  52.53 
 
 
167 aa  104  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0769  7-cyano-7-deazaguanine reductase  44.25 
 
 
166 aa  103  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0751  7-cyano-7-deazaguanine reductase  44.25 
 
 
166 aa  103  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.172139  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0394  7-cyano-7-deazaguanine reductase  43.36 
 
 
166 aa  102  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1347  7-cyano-7-deazaguanine reductase  47 
 
 
188 aa  100  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12670  7-cyano-7-deazaguanine reductase  44.55 
 
 
180 aa  100  6e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.883565  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1809  GTP cyclohydrolase I-related enzyme  43.12 
 
 
161 aa  100  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22450  7-cyano-7-deazaguanine reductase  42.73 
 
 
166 aa  99.4  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.914422 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1644  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45.54 
 
 
155 aa  98.2  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1886  7-cyano-7-deazaguanine reductase  47.62 
 
 
136 aa  97.4  5e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1844  7-cyano-7-deazaguanine reductase  46 
 
 
174 aa  96.3  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4288  7-cyano-7-deazaguanine reductase  46.6 
 
 
150 aa  95.9  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.542741 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1181  7-cyano-7-deazaguanine reductase  41.82 
 
 
128 aa  95.1  3e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0653  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45.3 
 
 
144 aa  95.1  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6510  7-cyano-7-deazaguanine reductase  48.48 
 
 
150 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2783  7-cyano-7-deazaguanine reductase  48.48 
 
 
153 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3011  7-cyano-7-deazaguanine reductase  48.48 
 
 
153 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0138  7-cyano-7-deazaguanine reductase  44.64 
 
 
137 aa  94  7e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0230  7-cyano-7-deazaguanine reductase  39.13 
 
 
142 aa  93.6  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.477034  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0136  7-cyano-7-deazaguanine reductase  44.64 
 
 
137 aa  94  7e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1463  7-cyano-7-deazaguanine reductase  48.48 
 
 
152 aa  92  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.797851  normal  0.679368 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2906  7-cyano-7-deazaguanine reductase  47.47 
 
 
153 aa  92  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.61276  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0601  7-cyano-7-deazaguanine reductase  41.28 
 
 
135 aa  92  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0512  7-cyano-7-deazaguanine reductase  46.46 
 
 
153 aa  90.1  9e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.642782 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3151  7-cyano-7-deazaguanine reductase  46.46 
 
 
154 aa  89.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0333619  normal  0.222915 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5893  7-cyano-7-deazaguanine reductase  43.69 
 
 
150 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3304  GTP cyclohydrolase I  43.59 
 
 
143 aa  89  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0577571  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2293  7-cyano-7-deazaguanine reductase  41.75 
 
 
154 aa  87.8  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.156672  normal  0.158019 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1341  7-cyano-7-deazaguanine reductase  47.19 
 
 
154 aa  87.4  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.488667  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3074  7-cyano-7-deazaguanine reductase  40.78 
 
 
154 aa  87  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1311  7-cyano-7-deazaguanine reductase  42.42 
 
 
159 aa  86.7  9e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.188099  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1983  7-cyano-7-deazaguanine reductase  41.58 
 
 
155 aa  86.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1183  7-cyano-7-deazaguanine reductase  42.72 
 
 
155 aa  85.5  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3670  7-cyano-7-deazaguanine reductase  38.74 
 
 
140 aa  85.9  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0983  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45.45 
 
 
162 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1144  7-cyano-7-deazaguanine reductase  42.72 
 
 
155 aa  85.5  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.594767  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2808  7-cyano-7-deazaguanine reductase  39.81 
 
 
154 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.146173  decreased coverage  0.00905915 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0991  7-cyano-7-deazaguanine reductase  37.74 
 
 
140 aa  84.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.279771  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3262  7-cyano-7-deazaguanine reductase  43 
 
 
154 aa  85.1  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.390134  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3061  7-cyano-7-deazaguanine reductase  36.52 
 
 
138 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149415 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2007  7-cyano-7-deazaguanine reductase  43 
 
 
155 aa  84.7  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04701  7-cyano-7-deazaguanine reductase  39.05 
 
 
135 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18601  7-cyano-7-deazaguanine reductase  37.74 
 
 
128 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.780472  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2205  7-cyano-7-deazaguanine reductase  38.1 
 
 
129 aa  84  6e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.709249  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3756  7-cyano-7-deazaguanine reductase  43.14 
 
 
151 aa  84  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.638142  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3383  GTP cyclohydrolase I  44.76 
 
 
125 aa  84  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.295645 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4182  7-cyano-7-deazaguanine reductase  43.14 
 
 
154 aa  84  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.0000104861  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15801  GTP cyclohydrolase I-like protein  35.24 
 
 
139 aa  83.6  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4472  7-cyano-7-deazaguanine reductase  43.43 
 
 
158 aa  82.8  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.51352  normal  0.783738 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4416  7-cyano-7-deazaguanine reductase  40.57 
 
 
136 aa  82  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0471  7-cyano-7-deazaguanine reductase  37.14 
 
 
137 aa  82  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0321  7-cyano-7-deazaguanine reductase  46.59 
 
 
168 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>