135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1263 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1263  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  186  9e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.339369  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0687  hypothetical protein  95.4 
 
 		 91 aa  175  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.166712  normal  0.641044 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2071  hypothetical protein  83.91 
 
 		 114 aa  157  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152399  normal  0.926717 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1235  hypothetical protein  83.91 
 
 		 91 aa  155  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2067  hypothetical protein  86.21 
 
 		 90 aa  155  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.436295  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1169  hypothetical protein  82.76 
 
 		 91 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0980986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1077  hypothetical protein  82.76 
 
 		 91 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5466  hypothetical protein  78.89 
 
 		 91 aa  152  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1511  hypothetical protein  78.65 
 
 		 90 aa  151  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.309754 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5920  hypothetical protein  78.89 
 
 		 91 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2157  hypothetical protein  78.89 
 
 		 91 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2175  hypothetical protein  78.89 
 
 		 91 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1114  hypothetical protein  78.89 
 
 		 91 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.158096  normal  0.927439 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2067  hypothetical protein  77.78 
 
 		 91 aa  150  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2624  hypothetical protein  78.65 
 
 		 91 aa  150  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.804415 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1836  hypothetical protein  76.67 
 
 		 91 aa  149  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.703285  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1490  hypothetical protein  76.67 
 
 		 91 aa  149  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0380307  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2982  hypothetical protein  77.53 
 
 		 90 aa  148  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2194  hypothetical protein  76.67 
 
 		 91 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.609831  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1752  hypothetical protein  75.56 
 
 		 91 aa  147  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2778  hypothetical protein  75.56 
 
 		 91 aa  147  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2261  hypothetical protein  75.56 
 
 		 91 aa  147  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3058  hypothetical protein  75.56 
 
 		 91 aa  147  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.141568  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2644  hypothetical protein  75.56 
 
 		 91 aa  147  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2700  hypothetical protein  75.56 
 
 		 91 aa  147  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0938348  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1533  hypothetical protein  75.56 
 
 		 91 aa  147  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.795875  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2102  hypothetical protein  73.03 
 
 		 90 aa  143  9e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.183711  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2344  hypothetical protein  70.79 
 
 		 90 aa  140  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1222  hypothetical protein  70.79 
 
 		 90 aa  139  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2423  hypothetical protein  71.26 
 
 		 93 aa  138  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1798  hypothetical protein  70.11 
 
 		 90 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.716542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1924  hypothetical protein  70.11 
 
 		 90 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.441849  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2229  hypothetical protein  70.11 
 
 		 90 aa  135  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0133  hypothetical protein  68.97 
 
 		 109 aa  135  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1524  hypothetical protein  67.82 
 
 		 90 aa  130  6e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.384209  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0024  hypothetical protein  67.05 
 
 		 91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.828588  normal  0.104747 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1372  hypothetical protein  66.67 
 
 		 91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3047  hypothetical protein  73.03 
 
 		 90 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45877  normal  0.0178408 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3583  hypothetical protein  64.04 
 
 		 90 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.507536 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4642  hypothetical protein  70.11 
 
 		 90 aa  119  9e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.451223  hitchhiker  0.0000118597 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0381  hypothetical protein  57.78 
 
 		 90 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2944  hypothetical protein  61.63 
 
 		 90 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.807996  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2268  hypothetical protein  57.47 
 
 		 90 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2572  hypothetical protein  60.67 
 
 		 93 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2959  hypothetical protein  60.67 
 
 		 93 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.269424  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2485  Fe(II) trafficking protein YggX  58.14 
 
 		 91 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0570791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2696  hypothetical protein  56.82 
 
 		 88 aa  111  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62763 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0075  hypothetical protein  57.47 
 
 		 90 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.206235  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1891  hypothetical protein  56.47 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1902  hypothetical protein  55.29 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1142  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3369  hypothetical protein  51.11 
 
 		 92 aa  103  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1324  hypothetical protein  51.11 
 
 		 92 aa  103  9e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000513126  normal  0.0116062 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3040  hypothetical protein  51.11 
 
 		 92 aa  103  9e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000474974  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2701  hypothetical protein  51.11 
 
 		 92 aa  103  9e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0665477  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3054  hypothetical protein  51.11 
 
 		 92 aa  103  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00037558  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3197  hypothetical protein  51.11 
 
 		 92 aa  103  9e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000564871  normal  0.56493 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1668  hypothetical protein  52.22 
 
 		 91 aa  102  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1179  hypothetical protein  53.41 
 
 		 92 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000882261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1250  hypothetical protein  53.41 
 
 		 92 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00387926  normal  0.782101 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1180  hypothetical protein  53.41 
 
 		 92 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000191738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2491  hypothetical protein  55.17 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.427029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00283  hypothetical protein  54.02 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0533  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000920147  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1132  hypothetical protein  47.78 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1002  hypothetical protein  47.78 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0880728  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2874  hypothetical protein  52.22 
 
 		 92 aa  100  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429816  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1107  hypothetical protein  52.22 
 
 		 92 aa  100  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149514  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03592  hypothetical protein  51.11 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0121  hypothetical protein  54.32 
 
 		 90 aa  100  8e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000208752  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0002  hypothetical protein  51.11 
 
 		 90 aa  100  8e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000338126  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002445  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  100  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000631832  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2699  hypothetical protein  52.22 
 
 		 91 aa  100  9e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000360658  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1544  hypothetical protein  50.56 
 
 		 89 aa  99.8  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.251513  normal  0.581544 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0856  hypothetical protein  52.87 
 
 		 90 aa  98.6  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1218  hypothetical protein  51.11 
 
 		 92 aa  98.2  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000284712  normal  0.540197 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4044  hypothetical protein  48.89 
 
 		 90 aa  97.4  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.846372  normal  0.136015 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02792  hypothetical protein  50 
 
 		 91 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.112634  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0733  Protein-tyrosine-phosphatase  50 
 
 		 91 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4266  hypothetical protein  50 
 
 		 91 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.91003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3308  hypothetical protein  50 
 
 		 91 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0752  hypothetical protein  50 
 
 		 91 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.493276  normal  0.0113195 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3105  hypothetical protein  50 
 
 		 91 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252238 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02755  hypothetical protein  50 
 
 		 91 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.115186  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3395  hypothetical protein  50 
 
 		 91 aa  97.1  7e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3351  hypothetical protein  47.73 
 
 		 91 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.496198 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3359  hypothetical protein  47.73 
 
 		 91 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0970298 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3454  hypothetical protein  47.73 
 
 		 91 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.811336 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3285  hypothetical protein  47.73 
 
 		 91 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.200191  normal  0.033805 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1443  hypothetical protein  48.28 
 
 		 92 aa  94.7  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3275  hypothetical protein  47.73 
 
 		 91 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3207  Fe(II) trafficking protein YggX  48.28 
 
 		 90 aa  94.4  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.261297  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3367  hypothetical protein  48.28 
 
 		 90 aa  93.6  9e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0165991 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1318  hypothetical protein  50 
 
 		 92 aa  93.6  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.959327  normal  0.498401 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01429  hypothetical protein  51.25 
 
 		 88 aa  93.2  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.25922  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4149  hypothetical protein  48.89 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.786111  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1850  Fe(II) trafficking protein YggX  50 
 
 		 93 aa  92.4  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.302914  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1122  hypothetical protein  47.78 
 
 		 92 aa  92  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000145882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2250  hypothetical protein  44.83 
 
 		 100 aa  92  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000276973 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0336  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.11522 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>