208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0616 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0616  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 310 aa  650    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1239  coproporphyrinogen III oxidase  87.45 
 
 		 273 aa  486  1e-136  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2192  coproporphyrinogen III oxidase  66.89 
 
 		 302 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0783  coproporphyrinogen III oxidase  67.44 
 
 		 303 aa  451  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00696662  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1990  coproporphyrinogen III oxidase  66.89 
 
 		 302 aa  448  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0815567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2390  coproporphyrinogen III oxidase  66.56 
 
 		 302 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.967494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2524  coproporphyrinogen III oxidase  66.45 
 
 		 303 aa  441  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0025  coproporphyrinogen III oxidase  62.83 
 
 		 303 aa  425  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1684  coproporphyrinogen III oxidase  63.12 
 
 		 323 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2296  coproporphyrinogen III oxidase  63.12 
 
 		 323 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.643346  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5623  coproporphyrinogen III oxidase  63.12 
 
 		 307 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1339  coproporphyrinogen III oxidase  62.91 
 
 		 306 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0982  coproporphyrinogen III oxidase  62.13 
 
 		 307 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0313583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2319  coproporphyrinogen III oxidase  62.46 
 
 		 307 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.936275 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0346  coproporphyrinogen III oxidase  63.39 
 
 		 302 aa  408  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3261  coproporphyrinogen III oxidase  60.86 
 
 		 307 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.77176  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0170  coproporphyrinogen III oxidase, aerobic  62.33 
 
 		 304 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0024  coproporphyrinogen III oxidase  62 
 
 		 304 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1299  coproporphyrinogen III oxidase  61.18 
 
 		 307 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0514179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0022  coproporphyrinogen III oxidase  62 
 
 		 304 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0449808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2461  coproporphyrinogen III oxidase  61.18 
 
 		 303 aa  403  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0025  coproporphyrinogen III oxidase  61.92 
 
 		 305 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0116  coproporphyrinogen III oxidase  60.2 
 
 		 304 aa  402  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.998466  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2334  coproporphyrinogen III oxidase  61.46 
 
 		 306 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193122  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00280  coproporphyrinogen III oxidase  61.92 
 
 		 305 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.477574 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2279  Coproporphyrinogen oxidase  60.77 
 
 		 309 aa  403  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  0.0202052 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2213  coproporphyrinogen III oxidase  61.46 
 
 		 306 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2066  coproporphyrinogen III oxidase  60 
 
 		 310 aa  403  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87254  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1013  coproporphyrinogen III oxidase  59.28 
 
 		 326 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0060  coproporphyrinogen III oxidase  61.67 
 
 		 304 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1730  coproporphyrinogen III oxidase  61.11 
 
 		 307 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.918171 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1951  coproporphyrinogen III oxidase  60.39 
 
 		 315 aa  399  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1229  coproporphyrinogen III oxidase  59.41 
 
 		 307 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1238  coproporphyrinogen III oxidase  59.41 
 
 		 307 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0073  coproporphyrinogen III oxidase  61 
 
 		 303 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.188544  hitchhiker  0.000371882 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1886  coproporphyrinogen III oxidase  59.08 
 
 		 307 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.668105  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1383  coproporphyrinogen III oxidase  59.42 
 
 		 326 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.461453  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0037  coproporphyrinogen III oxidase  59.68 
 
 		 323 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.430398  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0033  coproporphyrinogen III oxidase  59.68 
 
 		 302 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2092  Coproporphyrinogen oxidase  58.5 
 
 		 313 aa  395  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0593493  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1073  coproporphyrinogen III oxidase  59.08 
 
 		 307 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.828058  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0794  coproporphyrinogen III oxidase  59.08 
 
 		 307 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0038  coproporphyrinogen III oxidase  59.68 
 
 		 302 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.893663  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0356  coproporphyrinogen III oxidase  59.08 
 
 		 307 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.791354  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0030  coproporphyrinogen III oxidase  59.35 
 
 		 302 aa  396  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.378098  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0037  coproporphyrinogen III oxidase  59.35 
 
 		 302 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000149114 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3669  coproporphyrinogen III oxidase  59.14 
 
 		 298 aa  394  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0089  coproporphyrinogen III oxidase  60.33 
 
 		 303 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.554189  hitchhiker  0.0000000000135583 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0089  coproporphyrinogen III oxidase  60.67 
 
 		 303 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00220  coproporphyrinogen III oxidase  61.26 
 
 		 309 aa  392  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.333342  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0092  coproporphyrinogen III oxidase  60 
 
 		 303 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.469648  hitchhiker  0.0000233392 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1223  coproporphyrinogen III oxidase  60.13 
 
 		 311 aa  390  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1223  coproporphyrinogen III oxidase  59.47 
 
 		 309 aa  389  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0135  coproporphyrinogen III oxidase  59.8 
 
 		 299 aa  388  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2077  coproporphyrinogen III oxidase  58.9 
 
 		 310 aa  389  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.727472  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0757  coproporphyrinogen III oxidase  60.4 
 
 		 310 aa  385  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1970  coproporphyrinogen III oxidase  58.63 
 
 		 308 aa  387  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0993  coproporphyrinogen III oxidase  60.2 
 
 		 310 aa  386  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0029  coproporphyrinogen III oxidase  58.39 
 
 		 307 aa  387  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0035  coproporphyrinogen III oxidase  58.39 
 
 		 302 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132201  hitchhiker  0.00964681 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0033  coproporphyrinogen III oxidase  58.39 
 
 		 302 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.011595 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0041  coproporphyrinogen III oxidase  58.39 
 
 		 302 aa  385  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0219573  hitchhiker  0.00000553459 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0047  coproporphyrinogen III oxidase  59.54 
 
 		 308 aa  385  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0038  coproporphyrinogen III oxidase  58.06 
 
 		 302 aa  382  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2645  coproporphyrinogen III oxidase  59.14 
 
 		 299 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0017  coproporphyrinogen III oxidase  58.54 
 
 		 323 aa  383  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.208175  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0061  coproporphyrinogen III oxidase  59.28 
 
 		 314 aa  383  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0038  coproporphyrinogen III oxidase  58.71 
 
 		 304 aa  382  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2817  coproporphyrinogen III oxidase  59.14 
 
 		 299 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.56731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0030  coproporphyrinogen III oxidase  59.29 
 
 		 310 aa  384  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210418  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2596  coproporphyrinogen III oxidase  59.14 
 
 		 299 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3729  coproporphyrinogen III oxidase  58.61 
 
 		 303 aa  382  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.186137  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2824  coproporphyrinogen III oxidase  56.59 
 
 		 317 aa  378  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2696  coproporphyrinogen III oxidase  56.13 
 
 		 333 aa  378  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0480626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2687  coproporphyrinogen III oxidase  58.47 
 
 		 299 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.143173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3464  coproporphyrinogen III oxidase  58.14 
 
 		 306 aa  378  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2863  coproporphyrinogen III oxidase  57.74 
 
 		 307 aa  379  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1243  coproporphyrinogen III oxidase  57.81 
 
 		 299 aa  375  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1225  Coproporphyrinogen oxidase  57.81 
 
 		 299 aa  375  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2791  coproporphyrinogen III oxidase  57.95 
 
 		 304 aa  377  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2465  coproporphyrinogen III oxidase  57.95 
 
 		 305 aa  374  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00683566  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2711  coproporphyrinogen III oxidase  58.14 
 
 		 299 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2591  coproporphyrinogen III oxidase  58.47 
 
 		 299 aa  377  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2722  coproporphyrinogen III oxidase  57.81 
 
 		 299 aa  374  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2573  coproporphyrinogen III oxidase  57.81 
 
 		 299 aa  375  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0030  coproporphyrinogen III oxidase  58.28 
 
 		 305 aa  375  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000103554  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3290  Coproporphyrinogen oxidase  58.2 
 
 		 312 aa  375  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3201  coproporphyrinogen III oxidase  59.67 
 
 		 323 aa  376  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.182007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00028  coproporphyrinogen III oxidase  59.33 
 
 		 310 aa  377  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14394  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00383  coproporphyrinogen III oxidase  56.25 
 
 		 305 aa  377  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02336  coproporphyrinogen III oxidase  57.48 
 
 		 299 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3996  coproporphyrinogen III oxidase  56.39 
 
 		 312 aa  372  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.218154  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2784  coproporphyrinogen III oxidase  56.59 
 
 		 309 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390735 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2808  coproporphyrinogen III oxidase  57.48 
 
 		 299 aa  372  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1280  coproporphyrinogen III oxidase  56.59 
 
 		 309 aa  373  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1393  coproporphyrinogen III oxidase  56.59 
 
 		 309 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.586678  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2685  Coproporphyrinogen oxidase  57.76 
 
 		 305 aa  373  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0507108  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02298  hypothetical protein  57.48 
 
 		 299 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2957  coproporphyrinogen III oxidase  56.81 
 
 		 299 aa  372  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.929595 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0045  coproporphyrinogen III oxidase  55.95 
 
 		 306 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178865  normal  0.253632 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>