More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1490 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1490  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 267 aa  535  1e-151  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  81.89 
 
 		 556 aa  429  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2333  DNA repair protein RecN  59.69 
 
 		 549 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0492  DNA repair protein RecN  59.69 
 
 		 549 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3329  DNA repair protein RecN  59.69 
 
 		 549 aa  286  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  59.69 
 
 		 549 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3319  DNA repair protein RecN  59.69 
 
 		 549 aa  286  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2214  DNA repair protein RecN  59.69 
 
 		 549 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3286  DNA repair protein RecN  59.69 
 
 		 549 aa  286  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539815  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  58.85 
 
 		 568 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2482  DNA repair protein RecN  58.85 
 
 		 568 aa  285  5.999999999999999e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1300  DNA repair protein RecN  60.08 
 
 		 549 aa  276  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00383913  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2651  DNA repair protein  59.62 
 
 		 569 aa  274  9e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3831  DNA repair protein RecN  57.85 
 
 		 549 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2641  DNA repair protein RecN  60.08 
 
 		 549 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  56.3 
 
 		 589 aa  268  5e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0259  DNA repair protein RecN  59.46 
 
 		 549 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  59.46 
 
 		 549 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0713  DNA repair protein RecN  59.46 
 
 		 549 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0730  DNA repair protein RecN  59 
 
 		 556 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.937093 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1034  DNA repair protein RecN  56.7 
 
 		 576 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0637  DNA repair protein RecN  58.53 
 
 		 549 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0661  DNA repair protein RecN  58.53 
 
 		 549 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3968  DNA repair protein RecN  57.47 
 
 		 556 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.039947 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0932  DNA repair protein RecN  52.33 
 
 		 557 aa  251  7e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.613915 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2505  DNA repair protein RecN  59.3 
 
 		 555 aa  250  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1726  DNA repair protein RecN  51.54 
 
 		 551 aa  245  6.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.995264  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2421  DNA repair protein RecN  53.23 
 
 		 563 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.955613  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  49.24 
 
 		 552 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3602  DNA repair protein RecN  48.64 
 
 		 557 aa  241  7e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779581 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1652  DNA repair protein RecN  50 
 
 		 558 aa  239  4e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0903  DNA repair protein RecN  48.05 
 
 		 554 aa  229  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0832  DNA repair protein RecN  48.05 
 
 		 554 aa  228  7e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.013795  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3335  putative DNA repair protein  48.43 
 
 		 573 aa  227  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0907  DNA repair protein RecN  46.69 
 
 		 549 aa  225  5.0000000000000005e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.933799  normal  0.849345 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4337  DNA repair protein RecN  49.43 
 
 		 559 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0513473  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5421  DNA repair protein RecN  46.97 
 
 		 591 aa  223  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2030  DNA repair protein RecN  47.08 
 
 		 551 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  46.15 
 
 		 567 aa  221  7e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1301  DNA repair protein RecN  46.72 
 
 		 547 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1052  DNA repair protein RecN  46.04 
 
 		 565 aa  217  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3489  DNA repair protein RecN  46.44 
 
 		 567 aa  216  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000536624 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0456  DNA repair protein RecN  45.74 
 
 		 553 aa  204  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2739  DNA repair protein recN  40.75 
 
 		 555 aa  203  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2877  DNA repair protein recN  40.75 
 
 		 555 aa  203  3e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3966  DNA repair protein RecN  43.4 
 
 		 556 aa  201  9e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4730  DNA repair protein RecN  47.31 
 
 		 557 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46357  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  44.02 
 
 		 557 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4595  DNA repair protein RecN  47.1 
 
 		 557 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.202375 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  43.24 
 
 		 559 aa  199  5e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4729  DNA repair protein RecN  46.92 
 
 		 557 aa  198  6e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366375 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  44.23 
 
 		 558 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  45.21 
 
 		 556 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0703  DNA repair protein RecN  46.72 
 
 		 557 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.926549  hitchhiker  0.000359109 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  43.24 
 
 		 557 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  45.42 
 
 		 564 aa  194  9e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42990  DNA repair protein RecN  44.62 
 
 		 557 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  43.73 
 
 		 559 aa  193  3e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  42.8 
 
 		 552 aa  192  6e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  42.8 
 
 		 552 aa  192  7e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  42.8 
 
 		 552 aa  191  8e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3626  DNA repair protein RecN  44.02 
 
 		 558 aa  191  9e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0761  DNA repair protein RecN  43.68 
 
 		 557 aa  190  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345087  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  41.67 
 
 		 552 aa  189  5e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  42.42 
 
 		 554 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  43.85 
 
 		 558 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  41.67 
 
 		 552 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  41.67 
 
 		 552 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  41.67 
 
 		 552 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  41.67 
 
 		 552 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  41.57 
 
 		 553 aa  186  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  40.15 
 
 		 552 aa  185  6e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  41.67 
 
 		 552 aa  185  8e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  41.15 
 
 		 553 aa  185  8e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1475  DNA repair protein RecN  41.13 
 
 		 554 aa  184  9e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.460183  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.31 
 
 		 557 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0271976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3096  DNA repair protein RecN  39.92 
 
 		 557 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  40.54 
 
 		 554 aa  183  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  41.47 
 
 		 555 aa  182  3e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  40.38 
 
 		 554 aa  183  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3359  recombination and repair protein  41.61 
 
 		 553 aa  181  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0341558 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3497  DNA repair protein RecN  41.47 
 
 		 553 aa  181  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185224 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01182  DNA repair protein RecN  40.81 
 
 		 554 aa  180  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.239665  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  35.25 
 
 		 558 aa  180  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1151  recombination and repair protein  41.38 
 
 		 554 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.901201  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  42.21 
 
 		 553 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  42.21 
 
 		 553 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  42.21 
 
 		 553 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  42.21 
 
 		 553 aa  178  7e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1860  DNA repair protein RecN  42.08 
 
 		 558 aa  178  7e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.457848  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  42.21 
 
 		 553 aa  178  7e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  41.83 
 
 		 553 aa  177  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3856  recombination and repair protein  42.21 
 
 		 553 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00344363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3005  recombination and repair protein  41.83 
 
 		 553 aa  177  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658292  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3686  recombination and repair protein  41.92 
 
 		 553 aa  176  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00128842  normal  0.127979 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  41.98 
 
 		 553 aa  175  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  41.98 
 
 		 553 aa  175  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  41.98 
 
 		 553 aa  175  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.158329 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  41.98 
 
 		 553 aa  175  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  41.98 
 
 		 553 aa  175  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>