50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0090 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0094  glutamate synthase (ferredoxin)  84.36 
 
 		 4746 bp  1384    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000146352  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0090    100 
 
 		 1909 bp  3784    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.541776  normal  0.134423 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2965  glutamate synthase (large subunit) oxidoreductase protein  81.25 
 
 		 4749 bp  87.7  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1767  glutamate synthase, large subunit  81.76 
 
 		 4704 bp  85.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3690  glutamate synthase, large subunit  81.76 
 
 		 4704 bp  85.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3747  glutamate synthase, large subunit  81.76 
 
 		 4704 bp  85.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2787  glutamate synthase, large subunit  81.76 
 
 		 4704 bp  85.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3216  glutamate synthase, large subunit  81.76 
 
 		 4704 bp  85.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3263  glutamate synthase (NADH) large subunit  78.46 
 
 		 4896 bp  85.7  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2736  glutamate synthase, large subunit  81.76 
 
 		 4746 bp  85.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0217  glutamate synthase (NADH) large subunit  79.42 
 
 		 4635 bp  85.7  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3718  glutamate synthase, large subunit  81.76 
 
 		 4947 bp  85.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2896  Glutamate synthase (ferredoxin)  78.95 
 
 		 4713 bp  83.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.113267 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3014  glutamate synthase, large subunit  82.19 
 
 		 4875 bp  83.8  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0305  glutamate synthase (ferredoxin)  82.19 
 
 		 4890 bp  83.8  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3126  glutamate synthase (NADH) large subunit  86.75 
 
 		 4803 bp  77.8  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3499  glutamate synthase (NADH) large subunit  81.51 
 
 		 4704 bp  75.8  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0381  glutamate synthase (ferredoxin)  81.51 
 
 		 4704 bp  75.8  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0402  glutamate synthase (ferredoxin)  81.51 
 
 		 4704 bp  75.8  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2705  glutamate synthase (ferredoxin)  81.51 
 
 		 4980 bp  75.8  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0791  glutamate synthase (NADH) large subunit  78.15 
 
 		 4743 bp  75.8  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.116614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2933  glutamate synthase (ferredoxin)  87.84 
 
 		 4734 bp  75.8  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.761272  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0321  glutamate synthase (ferredoxin)  80.82 
 
 		 4704 bp  67.9  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.917459  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0330  glutamate synthase (ferredoxin)  80.82 
 
 		 4704 bp  67.9  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.466005 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3591  Glutamate synthase (ferredoxin)  80.82 
 
 		 4704 bp  67.9  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213312  hitchhiker  0.00000278043 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0761  putative glutamate synthase, ferredoxin-dependent  90.57 
 
 		 4608 bp  65.9  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2788  glutamate synthase (ferredoxin)  82.69 
 
 		 4704 bp  63.9  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3243  Glutamate synthase (ferredoxin)  83.7 
 
 		 4800 bp  63.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0842  Glutamate synthase (ferredoxin)  85.14 
 
 		 4683 bp  60  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.237024  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2562  glutamate synthase, large subunit  88.89 
 
 		 4548 bp  60  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5558  glutamate synthase (ferredoxin)  83.72 
 
 		 4731 bp  60  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155469  normal  0.943679 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1008  glutamate synthase (NADH) large subunit  84.62 
 
 		 4701 bp  60  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0365  glutamate synthase (NADH) large subunit  82.08 
 
 		 4704 bp  60  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.512142 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0741  glutamate synthase (NADH) large subunit  92.68 
 
 		 4734 bp  58  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.704994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3734  glutamate synthase large subunit  81.42 
 
 		 4722 bp  58  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2395  glutamate synthase (ferredoxin)  80.3 
 
 		 4761 bp  56  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2805  glutamate synthase (ferredoxin)  89.36 
 
 		 4578 bp  54  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3103  glutamate synthase (NADH) large subunit  83.33 
 
 		 4740 bp  52  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.456903 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1952  glutamate synthase, large subunit  83.78 
 
 		 4593 bp  52  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1604  glutamate synthase (ferredoxin)  89.13 
 
 		 4665 bp  52  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.505347  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1152  Glutamate synthase (ferredoxin)  82.56 
 
 		 4755 bp  52  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.801511  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0709  Glutamate synthase (ferredoxin)  90.24 
 
 		 4734 bp  50.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.849934  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2131  Glutamate synthase (ferredoxin)  100 
 
 		 4509 bp  50.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.150906 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19531  ferredoxin-dependent glutamate synthase  93.94 
 
 		 4428 bp  50.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1007  glutamate synthase (ferredoxin)  86.79 
 
 		 4602 bp  50.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.465703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1078  ferredoxin-dependent glutamate synthase  93.94 
 
 		 4590 bp  50.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0049  glutamate synthase, large subunit  82.5 
 
 		 4752 bp  48.1  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0683  glutamate synthase (ferredoxin)  93.75 
 
 		 4743 bp  48.1  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.146525  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0054  glutamate synthase, large subunit  82.5 
 
 		 4752 bp  48.1  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.673781  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0108    91.67 
 
 		 4496 bp  48.1  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>