32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4539 on replicon NC_008758
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008758  Pnap_4539  hypothetical protein  100 
 
 
100 aa  207  6e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4518  hypothetical protein  67.35 
 
 
92 aa  108  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.292766  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1175  hypothetical protein  67.65 
 
 
96 aa  90.5  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5390  hypothetical protein  75.93 
 
 
91 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0426586 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1465  hypothetical protein  60.29 
 
 
94 aa  85.5  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0025  hypothetical protein  77.55 
 
 
91 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.699949 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0027  hypothetical protein  77.55 
 
 
91 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.882898  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0026  hypothetical protein  77.55 
 
 
91 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.834973  hitchhiker  0.00036673 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0420  hypothetical protein  77.08 
 
 
93 aa  83.6  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2194  hypothetical protein  57.97 
 
 
98 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2714  hypothetical protein  60 
 
 
91 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000197127  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2342  hypothetical protein  52.17 
 
 
104 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114019  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0447  hypothetical protein  54.41 
 
 
90 aa  78.2  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.821045  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1254  hypothetical protein  76.47 
 
 
96 aa  75.5  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3869  hypothetical protein  49.32 
 
 
88 aa  72.8  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.651923  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4143  hypothetical protein  56.36 
 
 
93 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.256309 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2230  hypothetical protein  34.44 
 
 
82 aa  62  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.535182  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3971  hypothetical protein  70.73 
 
 
84 aa  61.2  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1656  hypothetical protein  58.82 
 
 
83 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000173023  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5296  hypothetical protein  58.82 
 
 
83 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.468297  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2276  hypothetical protein  59.09 
 
 
86 aa  60.1  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1936  hypothetical protein  54.17 
 
 
95 aa  55.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.578863  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2711  hypothetical protein  50 
 
 
86 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0128367  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4886  hypothetical protein  61.9 
 
 
90 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.894999 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1468  hypothetical protein  51.06 
 
 
82 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6005  hypothetical protein  52.78 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.850513  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3974  hypothetical protein  37.97 
 
 
82 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.891922  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1644  hypothetical protein  41.77 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.129371 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1491  hypothetical protein  47.54 
 
 
104 aa  45.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1383  hypothetical protein  43.48 
 
 
92 aa  44.3  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1073  hypothetical protein  46.81 
 
 
81 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2143  hypothetical protein  47.73 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00000280317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>