101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4529 on replicon NC_008758
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008758  Pnap_4529  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
47 aa  94.4  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0742545  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1469  heavy metal translocating P-type ATPase  64.44 
 
 
777 aa  57  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2604  heavy metal translocating P-type ATPase  64.44 
 
 
735 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.335287 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1645  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  62.22 
 
 
744 aa  54.3  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.321264 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1144  heavy metal translocating P-type ATPase  60 
 
 
851 aa  53.9  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0307276  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1110  heavy metal translocating P-type ATPase  55.81 
 
 
938 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0214095  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1178  heavy metal translocating P-type ATPase  62.79 
 
 
796 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2345  heavy metal translocating P-type ATPase  57.78 
 
 
831 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.541257 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6119  copper efflux ATPase CopF  65.91 
 
 
805 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.161419  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0030  copper-translocating P-type ATPase  65.12 
 
 
791 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000836932 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  53.49 
 
 
837 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0031  copper-translocating P-type ATPase  65.12 
 
 
838 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0029  copper-translocating P-type ATPase  65.12 
 
 
795 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.747408  normal  0.269109 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2191  heavy metal translocating P-type ATPase  60 
 
 
780 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1258  heavy metal translocating P-type ATPase  57.78 
 
 
778 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123345  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1804  heavy metal translocating P-type ATPase  64.29 
 
 
806 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.75515 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5360  heavy metal translocating P-type ATPase  64.29 
 
 
797 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.647165  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  56.1 
 
 
885 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0418  heavy metal translocating P-type ATPase  55.56 
 
 
816 aa  50.8  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  57.5 
 
 
849 aa  50.8  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0243  heavy metal translocating P-type ATPase  60 
 
 
833 aa  50.4  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  62.22 
 
 
746 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1849  heavy metal translocating P-type ATPase  60 
 
 
762 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191422  hitchhiker  0.000000000440646 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2710  heavy metal translocating P-type ATPase  57.78 
 
 
835 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.3034  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5378  heavy metal translocating P-type ATPase  60 
 
 
761 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.269135 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2229  copper-translocating P-type ATPase  57.78 
 
 
787 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.76869  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0446  heavy metal translocating P-type ATPase  53.33 
 
 
826 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0708  heavy metal translocating P-type ATPase  61.9 
 
 
736 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  58.54 
 
 
837 aa  49.7  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4547  heavy metal translocating P-type ATPase  53.33 
 
 
798 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291191  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3074  heavy metal translocating P-type ATPase  57.78 
 
 
845 aa  48.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  51.11 
 
 
758 aa  47.8  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  51.11 
 
 
759 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  51.11 
 
 
759 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  54.76 
 
 
831 aa  47.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  54.76 
 
 
786 aa  47  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  54.76 
 
 
837 aa  47  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1587  copper/silver efflux P-type ATPase  57.78 
 
 
814 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.602341  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1513  heavy metal translocating P-type ATPase  60 
 
 
817 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2599  heavy metal translocating P-type ATPase  59.52 
 
 
836 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.283973 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0148  heavy metal translocating P-type ATPase  65.71 
 
 
730 aa  46.2  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4609  heavy metal translocating P-type ATPase  58.14 
 
 
786 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1212  cation transport ATPase  55.26 
 
 
902 aa  47  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3533  heavy metal translocating P-type ATPase  58.14 
 
 
786 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1777  heavy metal translocating P-type ATPase  55.56 
 
 
814 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0428003 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4524  copper-translocating P-type ATPase  60 
 
 
823 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3877  copper-translocating P-type ATPase  54.76 
 
 
760 aa  46.2  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00336349  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4394  heavy metal translocating P-type ATPase  55.56 
 
 
715 aa  45.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880078  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  52.38 
 
 
894 aa  46.2  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11723  heavy-metal transporting P-type ATPase  54.76 
 
 
835 aa  45.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0439709  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  52.38 
 
 
826 aa  44.7  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1570  heavy metal translocating P-type ATPase  53.66 
 
 
747 aa  44.7  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.706467  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4491  copper-translocating P-type ATPase  60 
 
 
889 aa  44.3  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.217728 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2214  heavy metal translocating P-type ATPase  48.89 
 
 
846 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563688  normal  0.39359 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1729  heavy metal translocating P-type ATPase  48.89 
 
 
658 aa  44.3  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.263205  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  48.89 
 
 
818 aa  43.9  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0713  heavy metal translocating P-type ATPase  53.33 
 
 
872 aa  43.9  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0185288 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11368  heavy-metal transporting P-type ATPase  54.76 
 
 
824 aa  43.5  0.0009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2356  hypothetical protein  53.49 
 
 
736 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1397  hypothetical protein  53.49 
 
 
735 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  46.67 
 
 
889 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  46.67 
 
 
889 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2020  heavy metal translocating P-type ATPase  54.76 
 
 
809 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2696  copper-translocating P-type ATPase  55.56 
 
 
792 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.276003  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0986  heavy metal translocating P-type ATPase  57.14 
 
 
810 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1596  hypothetical protein  51.16 
 
 
735 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2890  copper-translocating P-type ATPase  56.1 
 
 
813 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1223  heavy metal translocating P-type ATPase  51.11 
 
 
721 aa  42.7  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1129  heavy metal translocating P-type ATPase  56.1 
 
 
840 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.979362 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1233  heavy metal translocating P-type ATPase  48.84 
 
 
622 aa  42.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.518664  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1233  hypothetical protein  52.38 
 
 
810 aa  42  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6644  copper-translocating P-type ATPase  46.67 
 
 
753 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.935468  normal  0.257295 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0385  copper-transporter ATPase CopA  46.67 
 
 
744 aa  41.6  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4364  copper-translocating P-type ATPase  57.78 
 
 
811 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.750997  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  52.38 
 
 
827 aa  41.2  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1572  heavy metal translocating P-type ATPase  55 
 
 
856 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  48.78 
 
 
753 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0521  heavy metal translocating P-type ATPase  51.22 
 
 
807 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1505  copper-translocating P-type ATPase  48.89 
 
 
744 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1408  copper-translocating P-type ATPase  46.67 
 
 
744 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.659936  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1499  copper-translocating P-type ATPase  48.89 
 
 
744 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1535  copper-translocating P-type ATPase  48.89 
 
 
744 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.639562  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2679  heavy metal translocating P-type ATPase  53.66 
 
 
857 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.668216 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2846  copper-translocating P-type ATPase  48.89 
 
 
744 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.515584  hitchhiker  0.000113532 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  51.11 
 
 
867 aa  41.2  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3006  copper-translocating P-type ATPase  46.67 
 
 
850 aa  40.8  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40662  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0191  heavy metal translocating P-type ATPase  52.38 
 
 
837 aa  40.8  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.562672  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 
837 aa  40.8  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  51.28 
 
 
752 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0882  cation transport ATPase  42.22 
 
 
732 aa  40.4  0.008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.703668  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1713  heavy metal translocating P-type ATPase  51.11 
 
 
814 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291358  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1876  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 
789 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5330  heavy metal translocating P-type ATPase  51.11 
 
 
814 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.8477 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0125  putative copper-translocating P-type ATPase  55.56 
 
 
813 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0531  copper-translocating P-type ATPase  46.67 
 
 
723 aa  40.4  0.009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0398615  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1042  copper-translocating P-type ATPase  55.56 
 
 
813 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00355  Cation transport ATPase  52.38 
 
 
782 aa  40.4  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6890  copper-translocating P-type ATPase  44.44 
 
 
754 aa  40.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 
905 aa  40  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2307  copper-translocating P-type ATPase  51.16 
 
 
783 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>