74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4509 on replicon NC_008758
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008758  Pnap_4509  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  273  5e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2462  arsenical pump membrane protein  68.42 
 
 		 427 aa  79.3  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.406949  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2193  arsenical pump membrane protein  63.49 
 
 		 427 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3798  arsenical pump membrane protein  64.06 
 
 		 426 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1489  arsenical pump membrane protein  63.49 
 
 		 428 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0227279  normal  0.489913 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1682  arsenical pump membrane protein  63.49 
 
 		 426 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.843584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0717  arsenical pump membrane protein  71.93 
 
 		 429 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0284123 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2137  arsenical pump membrane protein  61.9 
 
 		 428 aa  77.8  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4256  arsenical pump membrane protein  68.42 
 
 		 429 aa  77.4  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.215961 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4851  arsenical pump membrane protein  64.91 
 
 		 429 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0214  arsenical pump membrane protein  64.91 
 
 		 429 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.656406 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3819  arsenical pump membrane protein  64.91 
 
 		 429 aa  77  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3985  arsenical pump membrane protein  64.91 
 
 		 429 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03304  hypothetical protein  64.91 
 
 		 429 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.970777  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3704  arsenical pump membrane protein  64.91 
 
 		 429 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03351  arsenite/antimonite transporter  64.91 
 
 		 429 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.809643  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0212  arsenical pump membrane protein  64.91 
 
 		 429 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2399  arsenical pump membrane protein  68.42 
 
 		 427 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980673 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2390  arsenical pump membrane protein  64.91 
 
 		 429 aa  77  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3794  arsenical pump membrane protein  64.91 
 
 		 429 aa  77  0.00000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.146507 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3282  arsenical pump membrane protein  64.91 
 
 		 429 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2963  ArsB protein  70.18 
 
 		 427 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3035  arsenical pump membrane protein  66.67 
 
 		 427 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3829  arsenical pump membrane protein  65.52 
 
 		 427 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00505974  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2717  arsenite efflux transporter  66.67 
 
 		 427 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1715  arsenical pump membrane protein  63.93 
 
 		 427 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35110  ArsB protein  68.42 
 
 		 427 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1215  arsenical pump membrane protein  65.52 
 
 		 427 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3416  arsenical pump membrane protein  63.79 
 
 		 429 aa  73.6  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256733  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3078  arsenical pump membrane protein  63.16 
 
 		 427 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2547  arsenical pump membrane protein  59.65 
 
 		 433 aa  72.4  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.545416  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2344  arsenical pump membrane protein  63.79 
 
 		 427 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116158  hitchhiker  0.00889141 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1929  arsenite efflux transporter  61.9 
 
 		 427 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110099  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4380  arsenical pump membrane protein  58.73 
 
 		 428 aa  71.6  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0309  arsenical pump membrane protein  60.34 
 
 		 430 aa  69.7  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0945  arsenical pump membrane protein  62.07 
 
 		 429 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0698937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2520  arsenical pump membrane protein  60.34 
 
 		 429 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2769  arsenical pump membrane protein  52.38 
 
 		 435 aa  67.4  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1861  arsenical pump membrane protein  53.45 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1826  arsenical pump membrane protein  53.45 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0210  arsenical pump membrane protein  53.45 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1487  arsenical pump membrane protein  58.62 
 
 		 430 aa  65.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2430  arsenical pump membrane protein  53.45 
 
 		 429 aa  63.9  0.0000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1503  arsenical pump membrane protein  57.89 
 
 		 429 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0955  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  52.63 
 
 		 434 aa  63.5  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2813  arsenical pump membrane protein  48.65 
 
 		 438 aa  62  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0536  Arsenical pump membrane protein  54.39 
 
 		 430 aa  62.4  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1463  arsenical pump membrane protein  44.59 
 
 		 434 aa  61.2  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00625  arsenical membrane pump  45.95 
 
 		 434 aa  60.5  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.132136  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0427  arsenical pump membrane protein  46.03 
 
 		 433 aa  58.9  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1139  arsenical pump membrane protein  53.23 
 
 		 434 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1380  arsenical pump membrane protein  54.1 
 
 		 431 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798173  normal  0.0485201 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2479  arsenical pump membrane protein  50 
 
 		 436 aa  54.3  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1911  arsenical pump membrane protein  50.85 
 
 		 431 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2858  arsenical pump membrane protein  50 
 
 		 436 aa  54.3  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.449643  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0695  arsenical pump membrane protein  51.72 
 
 		 430 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.892424 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1857  Arsenical pump membrane protein  47.37 
 
 		 438 aa  53.1  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0932  Arsenical pump membrane protein  41.38 
 
 		 432 aa  50.8  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104253  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2535  Arsenical pump membrane protein  41.03 
 
 		 434 aa  50.4  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0313  arsenical pump membrane protein  41.38 
 
 		 417 aa  50.1  0.000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1590  arsenical pump membrane protein  38.6 
 
 		 239 aa  47  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0458  Arsenical pump membrane protein  34.48 
 
 		 419 aa  45.4  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000462165  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1656  arsenical pump membrane protein  37.93 
 
 		 421 aa  43.9  0.0008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4003  bile acid:sodium symporter  48.72 
 
 		 339 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.656396  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1853  arsenical-resistance protein  62.07 
 
 		 354 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00716983  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3395  bile acid:sodium symporter  64.52 
 
 		 351 aa  41.6  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.893949  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3959  arsenical-resistance protein  56.25 
 
 		 337 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2589  arsenical-resistance protein  58.62 
 
 		 350 aa  41.2  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.441195 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3833  arsenical-resistance protein  56.25 
 
 		 337 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2201  Arsenical pump membrane protein  40.35 
 
 		 433 aa  40.8  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.171032  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0534  arsenical pump membrane protein, putative  62.96 
 
 		 339 aa  40.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03336  arsenical pump membrane protein, putative  56.25 
 
 		 351 aa  40.4  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0533  bile acid:sodium symporter  62.96 
 
 		 339 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3498  bile acid:sodium symporter  62.96 
 
 		 339 aa  40  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>