40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4489 on replicon NC_008758
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008758  Pnap_4489  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 145 aa  277  3e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.485283  normal  0.0949598 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4491  copper-translocating P-type ATPase  76.83 
 
 		 889 aa  127  7.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.217728 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1143  heavy metal transport/detoxification protein  77.03 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00252134  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1144  heavy metal translocating P-type ATPase  66.3 
 
 		 851 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0307276  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1513  heavy metal translocating P-type ATPase  44.62 
 
 		 817 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4524  copper-translocating P-type ATPase  44.62 
 
 		 823 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5330  heavy metal translocating P-type ATPase  39.39 
 
 		 814 aa  52.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.8477 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1713  heavy metal translocating P-type ATPase  39.39 
 
 		 814 aa  52.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 803 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  39.58 
 
 		 805 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0911  Heavy metal transport/detoxification protein  38 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 797 aa  44.7  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  39.58 
 
 		 805 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  39.58 
 
 		 805 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  39.58 
 
 		 805 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  39.58 
 
 		 806 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4847  copper-translocating P-type ATPase  40.74 
 
 		 818 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.24461 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  39.58 
 
 		 805 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  39.58 
 
 		 805 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  39.58 
 
 		 805 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0711  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  38.3 
 
 		 812 aa  43.9  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.139476  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  39.58 
 
 		 806 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1042  copper-translocating P-type ATPase  35.29 
 
 		 813 aa  43.5  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  45.45 
 
 		 786 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  32.35 
 
 		 894 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24480  copper chaperone  39.29 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 806 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  35.82 
 
 		 750 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  34.69 
 
 		 799 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2923  heavy metal translocating P-type ATPase  30 
 
 		 795 aa  41.6  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000167439  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  31.25 
 
 		 889 aa  41.6  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  36.96 
 
 		 818 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4364  copper-translocating P-type ATPase  31.73 
 
 		 811 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.750997  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  31.25 
 
 		 889 aa  41.2  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0024  heavy metal translocating P-type ATPase  41.18 
 
 		 757 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2696  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 792 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.276003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2460  heavy metal translocating P-type ATPase  29.85 
 
 		 836 aa  40.8  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00836136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0021  copper ion binding protein  38.18 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00208737  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  32 
 
 		 954 aa  40.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 796 aa  40.4  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>