17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4474 on replicon NC_008758
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008758  Pnap_4474    100 
 
 		 413 bp  819    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0414937  hitchhiker  3.91435e-17 
 
 
-
 
NC_003296  RS01673  putative integrase/recombinase protein  88.52 
 
 		 1701 bp  65.9  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4514  Tyrosine-based site-specific recombinase  79.86 
 
 		 1680 bp  56  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197712  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  92.11 
 
 		 1728 bp  52  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5529  phage integrase  85.96 
 
 		 1674 bp  50.1  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95616 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1426  phage integrase family protein  96.55 
 
 		 1206 bp  50.1  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6456  phage integrase  91.67 
 
 		 1692 bp  48.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1740  integrase family protein  81.61 
 
 		 1680 bp  46.1  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407368 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  91.43 
 
 		 1743 bp  46.1  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  84.75 
 
 		 1737 bp  46.1  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  89.74 
 
 		 1698 bp  46.1  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  89.74 
 
 		 1698 bp  46.1  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  89.74 
 
 		 1698 bp  46.1  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6864  phage integrase family protein  89.74 
 
 		 1692 bp  46.1  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728791  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  84.75 
 
 		 1737 bp  46.1  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  84.75 
 
 		 1737 bp  46.1  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  89.74 
 
 		 1698 bp  46.1  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>