70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3016 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3016  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  252  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1743  hypothetical protein  64.1 
 
 		 123 aa  155  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.685132  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3297  protein of unknown function DUF779  68.22 
 
 		 119 aa  155  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2727  hypothetical protein  63.79 
 
 		 126 aa  155  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3513  hypothetical protein  63.79 
 
 		 128 aa  152  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0598577  normal  0.262419 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3146  protein of unknown function DUF779  67.29 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0598  hypothetical protein  63.48 
 
 		 127 aa  148  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0241572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1007  hypothetical protein  60.68 
 
 		 123 aa  148  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2871  protein of unknown function DUF779  61.95 
 
 		 126 aa  147  7e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.996732  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5651  hypothetical protein  58.12 
 
 		 124 aa  145  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.21953  hitchhiker  0.00918042 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3232  hypothetical protein  56.03 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106365  normal  0.37909 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1158  hypothetical protein  57.76 
 
 		 130 aa  143  8.000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1692  protein of unknown function DUF779  56.03 
 
 		 133 aa  140  5e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3676  hypothetical protein  58.62 
 
 		 136 aa  140  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0218676  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0009  hypothetical protein  58.04 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860087  normal  0.0144121 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7560  protein of unknown function DUF779  56.52 
 
 		 121 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6812  hypothetical protein  55.56 
 
 		 121 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178282  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2915  hypothetical protein  55.17 
 
 		 129 aa  136  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4151  protein of unknown function DUF779  54.7 
 
 		 120 aa  134  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.213784 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2851  hypothetical protein  54.31 
 
 		 124 aa  134  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1324  protein of unknown function DUF779  53.98 
 
 		 123 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4442  hypothetical protein  55.36 
 
 		 131 aa  133  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.958078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0023  protein of unknown function DUF779  56.25 
 
 		 131 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.722181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1888  hypothetical protein  57.01 
 
 		 126 aa  129  9e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0110  protein of unknown function DUF779  52.99 
 
 		 141 aa  126  8.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0186278  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1191  hypothetical protein  57.14 
 
 		 108 aa  126  9.000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.996913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2335  protein of unknown function DUF779  53.57 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0142786  normal  0.683952 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0073  protein of unknown function DUF779  50.43 
 
 		 121 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.466603 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1090  protein of unknown function DUF779  52.07 
 
 		 124 aa  124  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.92121  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1994  hypothetical protein  50 
 
 		 124 aa  124  5e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00400004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0702  hypothetical protein  52.73 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.575226  normal  0.0343834 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3507  protein of unknown function DUF779  53.04 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0151  hypothetical protein  52.63 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.10554 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1780  protein of unknown function DUF779  49.19 
 
 		 148 aa  121  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00396827  normal  0.10554 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1613  hypothetical protein  55.24 
 
 		 108 aa  121  4e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3416  protein of unknown function DUF779  50.88 
 
 		 146 aa  120  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3221  hypothetical protein  50 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.728273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3545  protein of unknown function DUF779  50 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0335617  normal  0.308833 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3802  protein of unknown function DUF779  51.3 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.46071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2105  hypothetical protein  48.72 
 
 		 122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3179  hypothetical protein  52.29 
 
 		 125 aa  118  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1742  hypothetical protein  55.05 
 
 		 120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.582598  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0791  hypothetical protein  50 
 
 		 161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.320423  normal  0.850639 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1845  hypothetical protein  52.38 
 
 		 108 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.724228 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0628  hypothetical protein  48.7 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113219  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0641  hypothetical protein  48.7 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0621  hypothetical protein  48.7 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2259  hypothetical protein  50.93 
 
 		 126 aa  113  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4884  protein of unknown function DUF779  47.11 
 
 		 129 aa  113  8.999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0196  hypothetical protein  53.27 
 
 		 110 aa  112  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0204  hypothetical protein  53.27 
 
 		 110 aa  112  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0273  hypothetical protein  52.34 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4526  protein of unknown function DUF779  45.69 
 
 		 154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.163674 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21460  hypothetical protein  48.74 
 
 		 145 aa  110  5e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0914  protein of unknown function DUF779  50 
 
 		 130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.327144  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0313  protein of unknown function DUF779  49.12 
 
 		 115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13400  hypothetical protein  46.77 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0793172  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1783  hypothetical protein  44.07 
 
 		 125 aa  107  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2368  hypothetical protein  52.38 
 
 		 118 aa  105  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.777752 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10466  hypothetical protein  52.53 
 
 		 163 aa  104  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0122  hypothetical protein  49.02 
 
 		 158 aa  102  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.940827  normal  0.229372 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0956  hypothetical protein  45.45 
 
 		 132 aa  102  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.387626 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0894  hypothetical protein  43.86 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.750468  normal  0.376283 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28640  hypothetical protein  42.61 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3086  hypothetical protein  42.61 
 
 		 135 aa  99  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24910  hypothetical protein  44.7 
 
 		 186 aa  98.6  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2786  protein of unknown function DUF779  42.24 
 
 		 135 aa  96.7  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0104363 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2966  hypothetical protein  38.14 
 
 		 124 aa  89  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.807327  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3271  protein of unknown function DUF779  41.44 
 
 		 119 aa  87.8  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.849625  normal  0.131748 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4061  protein of unknown function DUF779  38.05 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>