More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2918 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2918  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  100 
 
 		 154 aa  310  4.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.354064 
 
 
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NC_007948  Bpro_2886  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  84.42 
 
 		 154 aa  264  4e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.209302 
 
 
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NC_008752  Aave_2231  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  77.92 
 
 		 154 aa  239  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.27566  hitchhiker  0.00111605 
 
 
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NC_010002  Daci_2467  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  74.68 
 
 		 156 aa  235  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.208797  normal  0.358191 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2257  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  77.27 
 
 		 154 aa  233  6e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_2767  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  76.62 
 
 		 154 aa  233  7e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.661839 
 
 
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NC_008786  Veis_4792  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  76.62 
 
 		 154 aa  219  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00226063  normal  0.0320166 
 
 
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NC_007908  Rfer_2669  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  74.03 
 
 		 157 aa  216  7e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010524  Lcho_2936  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  69.48 
 
 		 154 aa  209  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_008825  Mpe_A2948  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  68.75 
 
 		 160 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0699745  normal  0.671031 
 
 
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NC_010551  BamMC406_0826  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  64.38 
 
 		 171 aa  191  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2146  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  64.38 
 
 		 173 aa  191  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A0763  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  64.38 
 
 		 173 aa  191  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A2596  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  64.38 
 
 		 173 aa  191  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3103  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  64.38 
 
 		 173 aa  191  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_3017  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  64.38 
 
 		 173 aa  191  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I1530  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  64.38 
 
 		 173 aa  191  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.353019  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_2017  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  64.38 
 
 		 173 aa  191  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.618331  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_3070  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  64.38 
 
 		 173 aa  191  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008390  Bamb_0817  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  64.38 
 
 		 171 aa  191  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_0918  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  64.38 
 
 		 171 aa  191  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.151763  normal  1 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4057  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  64.38 
 
 		 172 aa  191  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008060  Bcen_0477  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  64.38 
 
 		 171 aa  191  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0956  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  64.38 
 
 		 171 aa  191  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.902185  n/a   
 
 
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NC_007951  Bxe_A0892  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  63.7 
 
 		 168 aa  190  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010681  Bphyt_3102  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  63.7 
 
 		 168 aa  190  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010084  Bmul_2441  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  64.38 
 
 		 172 aa  190  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.215685  normal  1 
 
 
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NC_010622  Bphy_0618  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  63.7 
 
 		 172 aa  190  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012791  Vapar_3111  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  69.03 
 
 		 156 aa  186  9e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.246776  n/a   
 
 
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NC_007973  Rmet_2694  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  61.64 
 
 		 169 aa  186  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.75084  normal  0.844066 
 
 
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NC_007347  Reut_A0769  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  60.27 
 
 		 167 aa  181  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010682  Rpic_0661  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  61.64 
 
 		 166 aa  178  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0953896 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_0705  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  61.64 
 
 		 166 aa  178  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.714575  normal  0.92031 
 
 
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NC_003295  RSc0712  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  60.67 
 
 		 164 aa  177  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.636239  normal  1 
 
 
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NC_009379  Pnuc_0265  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  57.04 
 
 		 170 aa  156  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010531  Pnec_0291  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  55.63 
 
 		 171 aa  155  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011662  Tmz1t_3918  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  58.39 
 
 		 167 aa  154  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.263673  n/a   
 
 
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NC_007614  Nmul_A0011  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  55.63 
 
 		 160 aa  154  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007404  Tbd_2191  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  56.43 
 
 		 155 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.204142  hitchhiker  0.00000492523 
 
 
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NC_007947  Mfla_0492  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  54.05 
 
 		 149 aa  149  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.252301  normal  1 
 
 
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NC_007298  Daro_3738  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  47.3 
 
 		 160 aa  140  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.183103 
 
 
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NC_013158  Huta_2028  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  43.75 
 
 		 158 aa  120  9e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_2285  riboflavin synthase  42.66 
 
 		 174 aa  117  6e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0439709 
 
 
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NC_007204  Psyc_2069  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  42.66 
 
 		 173 aa  117  7e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007969  Pcryo_2392  riboflavin synthase  42.66 
 
 		 173 aa  117  7e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.842822 
 
 
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NC_009253  Dred_2090  riboflavin synthase  42.11 
 
 		 154 aa  115  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0406951  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_0023  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  45.07 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_0388  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  43.24 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009486  Tpet_1110  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  43.57 
 
 		 165 aa  111  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002936  DET1187  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  40.52 
 
 		 155 aa  110  5e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000148603  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_0125  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  40 
 
 		 155 aa  110  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_006369  lpl1189  riboflavin synthase beta chain (6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase)  40.43 
 
 		 155 aa  110  5e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010730  SYO3AOP1_1285  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  40.54 
 
 		 154 aa  110  5e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000128176  n/a   
 
 
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NC_011901  Tgr7_1562  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  44.2 
 
 		 159 aa  110  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010483  TRQ2_0996  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  43.57 
 
 		 165 aa  110  6e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013552  DhcVS_970  riboflavin synthase beta chain  40.52 
 
 		 155 aa  110  6e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000302902  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_08560  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  39.86 
 
 		 156 aa  110  7.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_2180  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  42.36 
 
 		 155 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119846  n/a   
 
 
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NC_006368  lpp1183  riboflavin synthase beta chain (6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase)  40.43 
 
 		 155 aa  110  9e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_0998  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  40.79 
 
 		 155 aa  110  9e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007484  Noc_0802  riboflavin synthase  42.86 
 
 		 165 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.594455  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0561  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  40.69 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.65265  n/a   
 
 
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NC_009012  Cthe_0107  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  42.75 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009616  Tmel_0042  riboflavin synthase  47.45 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008309  HS_0830  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  45.26 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00102781  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_3089  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  42.14 
 
 		 157 aa  108  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.907983  n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_2236  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  42.57 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1820  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  40.67 
 
 		 154 aa  107  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0939  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  41.67 
 
 		 155 aa  107  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.612665  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1855  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  40.67 
 
 		 154 aa  107  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.757526  n/a   
 
 
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NC_011898  Ccel_2003  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  42.55 
 
 		 155 aa  107  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000249817  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_1216  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  39.46 
 
 		 155 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2297  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  40.52 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0192693  hitchhiker  0.0000020886 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2811  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  40.14 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00692439  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1979  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  44.22 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0918  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  41.22 
 
 		 155 aa  104  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000116109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1681  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  42.75 
 
 		 161 aa  104  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.429573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10020  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  38.93 
 
 		 155 aa  104  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.808007  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2898  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  42.34 
 
 		 155 aa  103  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566854  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1296  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  38.67 
 
 		 155 aa  103  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0069164  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1448  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  38.1 
 
 		 154 aa  103  9e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.173466  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1381  riboflavin synthase  37.75 
 
 		 154 aa  102  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1423  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  37.41 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0934099  normal  0.116 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1229  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  38.89 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455759 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2446  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  45.11 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.470917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1099  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  39.46 
 
 		 180 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000581145  normal  0.593751 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2781  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  38.46 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18331  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  36.81 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.345404  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1866  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  39.42 
 
 		 163 aa  102  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.390191  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3021  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  38.89 
 
 		 155 aa  101  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.551106  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3466  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  39.46 
 
 		 158 aa  101  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1099  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  39.46 
 
 		 158 aa  101  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000368267  normal  0.587736 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1165  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  39.46 
 
 		 158 aa  101  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  normal  0.121232 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2811  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  39.86 
 
 		 154 aa  101  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_3284  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  42.86 
 
 		 158 aa  100  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1038  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  38.78 
 
 		 158 aa  100  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000146191  n/a   
 
 
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NC_011663  Sbal223_1214  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  39.46 
 
 		 159 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912271  normal  0.250843 
 
 
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NC_009997  Sbal195_3300  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  39.46 
 
 		 159 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000566422  decreased coverage  0.000108776 
 
 
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NC_009052  Sbal_3157  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  39.46 
 
 		 159 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000573174  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4223  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  39.16 
 
 		 153 aa  100  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.729764  n/a   
 
 
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