More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1878 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2602  GTP-binding protein, HSR1-related  88.42 
 
 		 386 aa  655    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415025  normal  0.601696 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1878  GTP-binding protein, HSR1-related  100 
 
 		 383 aa  770    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.932644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2301  small GTP-binding protein domain-containing protein  79.23 
 
 		 382 aa  529  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.772558  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5013  GTP-binding proten HflX  75.82 
 
 		 404 aa  527  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0596854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0074  GTP-binding protein, HSR1-related  75.47 
 
 		 387 aa  521  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.352568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1430  GTP-binding protein  73.87 
 
 		 390 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.224081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2193  GTP-binding proten HflX  72.37 
 
 		 389 aa  497  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1176  small GTP-binding protein  74.73 
 
 		 392 aa  496  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.668458  normal  0.446741 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1096  GTP-binding proten HflX  74.46 
 
 		 392 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2862  GTP-binding proten HflX  66.22 
 
 		 412 aa  445  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1990  putative GTP-binding protein  66.67 
 
 		 414 aa  437  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.0213321 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1339  GTP-binding protein HflX  59.1 
 
 		 387 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2349  GTP-binding protein HflX  59.1 
 
 		 392 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2240  GTP-binding protein HflX  58.54 
 
 		 392 aa  402  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224831  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1828  GTP-binding protein HflX  59.1 
 
 		 387 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1469  GTP-binding proten HflX  58.82 
 
 		 396 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.339069 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1100  GTP-binding protein HflX  59.1 
 
 		 387 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2183  GTP-binding proten HflX  59.1 
 
 		 387 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2221  GTP-binding proten HflX  58.82 
 
 		 387 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0068  GTP-binding protein HflX  59.1 
 
 		 387 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0515568  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5107  small GTP-binding protein  58.66 
 
 		 396 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1744  small GTP-binding protein  58.66 
 
 		 396 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1806  small GTP-binding protein  58.66 
 
 		 395 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1830  GTP-binding proten HflX  58.66 
 
 		 395 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1414  GTP-binding proten HflX  57.98 
 
 		 414 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000434774 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1717  GTP-binding proten HflX  58.66 
 
 		 396 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658318  normal  0.277641 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2535  GTP-binding proten HflX  56.86 
 
 		 404 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955087  hitchhiker  0.0000726108 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1600  small GTP-binding protein  56.86 
 
 		 404 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0793347  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3384  GTP-binding proten HflX  58.52 
 
 		 385 aa  376  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1221  hypothetical protein  58.27 
 
 		 417 aa  372  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00041238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1065  GTP-binding proten HflX  58.06 
 
 		 417 aa  371  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1157  GTP-binding proten HflX  58.06 
 
 		 417 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2100  small GTP-binding protein domain-containing protein  59.57 
 
 		 411 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.621356  normal  0.0850913 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2080  small GTP-binding protein domain-containing protein  59.22 
 
 		 414 aa  364  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455149  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2979  GTP-binding protein, HSR1-related  54.08 
 
 		 384 aa  354  2e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.908653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0602  GTP-binding protein HflX  54.03 
 
 		 389 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.406819 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  53.74 
 
 		 417 aa  341  1e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1588  small GTP-binding protein domain-containing protein  55.83 
 
 		 375 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000278278 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  52.23 
 
 		 435 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0446  small GTP-binding protein domain-containing protein  55.18 
 
 		 394 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  52.25 
 
 		 436 aa  335  5e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  51.94 
 
 		 429 aa  334  1e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  51.8 
 
 		 428 aa  334  2e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  50.84 
 
 		 432 aa  333  4e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2589  GTP-binding protein, HSR1-related  51.8 
 
 		 382 aa  332  6e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  51.25 
 
 		 433 aa  331  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  51.25 
 
 		 433 aa  330  2e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  50.28 
 
 		 435 aa  330  3e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  50.56 
 
 		 431 aa  330  3e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  51.52 
 
 		 433 aa  328  7e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  51.52 
 
 		 433 aa  328  7e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  51.52 
 
 		 433 aa  328  7e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1278  GTP-binding protein, HSR1-related  51.8 
 
 		 439 aa  328  8e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.424036  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  49.47 
 
 		 430 aa  328  9e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  51.38 
 
 		 441 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  50.53 
 
 		 429 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0493  putative GTPase HflX  51.4 
 
 		 433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0353897  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  50.28 
 
 		 435 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  50.55 
 
 		 429 aa  327  3e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  51.4 
 
 		 432 aa  326  4.0000000000000003e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  49.74 
 
 		 429 aa  325  7e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0069  GTP-binding protein  52.01 
 
 		 450 aa  324  1e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  50.43 
 
 		 440 aa  323  4e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  49.86 
 
 		 426 aa  322  7e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  50.56 
 
 		 426 aa  322  8e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  50.14 
 
 		 432 aa  322  8e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0057  GTP-binding proten HflX  51.44 
 
 		 450 aa  322  9.000000000000001e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.583436  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  50.56 
 
 		 426 aa  322  9.000000000000001e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  52.03 
 
 		 433 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  48.48 
 
 		 436 aa  321  9.999999999999999e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  51.78 
 
 		 426 aa  321  9.999999999999999e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  50.55 
 
 		 429 aa  321  9.999999999999999e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0599  GTP-binding protein, HSR1-related  51.69 
 
 		 435 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00843062  hitchhiker  0.00021975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3431  GTP-binding protein, HSR1-related  51.69 
 
 		 435 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253406  normal  0.0436905 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  51.78 
 
 		 426 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  51.78 
 
 		 426 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  51.78 
 
 		 426 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  51.78 
 
 		 426 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  51.78 
 
 		 426 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4169  GTP-binding proten HflX  51.12 
 
 		 432 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00885496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  51.78 
 
 		 426 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  51.78 
 
 		 426 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0798  GTP-binding protein, HSR1-related  50.28 
 
 		 432 aa  320  3e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968624 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  51.78 
 
 		 426 aa  319  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  50.42 
 
 		 426 aa  319  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0598  GTP-binding protein, HSR1-related  51.12 
 
 		 435 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.472321  hitchhiker  0.00000215533 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  50.42 
 
 		 426 aa  319  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  50.42 
 
 		 426 aa  319  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  50.42 
 
 		 426 aa  319  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  50.42 
 
 		 426 aa  319  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0604  GTP-binding protein HflX  51.12 
 
 		 435 aa  318  7e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0940  GTP-binding proten HflX  52.39 
 
 		 454 aa  316  4e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1048  GTP-binding protein  52.39 
 
 		 454 aa  316  4e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0356  putative GTPase HflX  49.17 
 
 		 426 aa  315  6e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.152366  hitchhiker  0.00466267 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0326  GTP-binding protein HflX  48.28 
 
 		 428 aa  315  9.999999999999999e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3279  GTP-binding protein, HSR1-related  50.28 
 
 		 435 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00360977  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  50.14 
 
 		 414 aa  314  1.9999999999999998e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3892  GTP-binding proten HflX  50.28 
 
 		 435 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.030857  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  50.14 
 
 		 414 aa  313  2.9999999999999996e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2776  putative GTPase HflX  49.59 
 
 		 439 aa  313  2.9999999999999996e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>