38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1825 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1825  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  280  5.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.651269 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2084  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  280  5.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.661206  normal  0.071134 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0142  hypothetical protein  86.13 
 
 		 152 aa  218  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0347  hypothetical protein  86.13 
 
 		 152 aa  218  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100555  hitchhiker  0.00295944 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0411  hypothetical protein  86.13 
 
 		 152 aa  218  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000404723 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1239  hypothetical protein  86.13 
 
 		 152 aa  218  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0187368  normal  0.565368 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3635  hypothetical protein  86.13 
 
 		 152 aa  218  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.046317 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4035  hypothetical protein  86.13 
 
 		 152 aa  218  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.21997  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0591  transposase  32.74 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.2665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0634  transposase  32.74 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000359175  normal  0.423888 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1182  transposase  32.74 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1767  transposase  32.74 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.676201 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3019  transposase  32.74 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.935123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3299  transposase  32.74 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.161029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5112  transposase  32.74 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483905 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5259  transposase  32.74 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00757713  normal  0.158269 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5177  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.74 
 
 		 262 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2468  transposase  29.57 
 
 		 120 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1044  Transposase and inactivated derivatives-like protein  37.39 
 
 		 315 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5336  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.56 
 
 		 318 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.904971  normal  0.192286 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4172  ISSpo6, transposase orf A  35.34 
 
 		 120 aa  48.9  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.311615  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8592  ISSpo6, transposase orf A  38.05 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0479  hypothetical protein  32.2 
 
 		 319 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.149422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2582  transposase  34.68 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0093  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.46 
 
 		 314 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4538  ISSpo6, transposase orf A  34.68 
 
 		 123 aa  42.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4478  ISSpo6, transposase orf A  34.68 
 
 		 123 aa  42.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.966348  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2585  transposase  35 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0578  hypothetical protein  35.04 
 
 		 317 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0815  hypothetical protein  35.04 
 
 		 317 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4691  hypothetical protein  35.34 
 
 		 318 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3697  hypothetical protein  35.34 
 
 		 318 aa  41.6  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6905  putative insertion sequence transposase protein  33.63 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2724  Transposase IS630  32.74 
 
 		 314 aa  41.2  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.35712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2836  transposase IS630  33.04 
 
 		 315 aa  41.2  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2359  transposase IS630  33.04 
 
 		 315 aa  41.2  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3830  transposase  33.9 
 
 		 314 aa  40.4  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3006  transposase  33.9 
 
 		 314 aa  40.4  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0864202 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>