109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1789 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1789  ABC-type transport system ipermease component  100 
 
 		 267 aa  527  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.047158 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2659  ABC-type transport system ipermease component  84.27 
 
 		 267 aa  413  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0263164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2592  ABC-type transport system ipermease component  61.19 
 
 		 269 aa  318  5e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.338315  normal  0.186973 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1216  protein of unknown function DUF140  61.19 
 
 		 269 aa  318  5e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1817  ABC-type transport system ipermease component  59.54 
 
 		 266 aa  309  2e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.677101  normal  0.663369 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0554  ABC-type transport system ipermease component  59.61 
 
 		 287 aa  305  5.0000000000000004e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2917  ABC-type transport system ipermease component  55.47 
 
 		 267 aa  282  5.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.68083  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0012  ABC-type transport system ipermease component  57.66 
 
 		 249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000582511 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1224  ABC-type transport system ipermease component  51.7 
 
 		 266 aa  229  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0980  ABC-type transport system ipermease component  32.05 
 
 		 264 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0674411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0238  hypothetical protein  32.14 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3388  protein of unknown function DUF140  23.72 
 
 		 296 aa  53.9  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.159467 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  26.57 
 
 		 382 aa  53.1  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0738  protein of unknown function DUF140  36.46 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1899  hypothetical protein  35 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  31.68 
 
 		 413 aa  50.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1886  protein of unknown function DUF140  31.62 
 
 		 328 aa  49.7  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0490  protein of unknown function DUF140  28.07 
 
 		 257 aa  49.3  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2785  hypothetical protein  31.91 
 
 		 260 aa  49.3  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00892683  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0385  protein of unknown function DUF140  37.11 
 
 		 260 aa  48.9  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4446  hypothetical protein  30.66 
 
 		 265 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57870  ABC transporter permease  33.81 
 
 		 265 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1014  hypothetical protein  32.61 
 
 		 260 aa  48.5  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5027  ABC transporter permease  33.81 
 
 		 265 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1965  protein of unknown function DUF140  30.56 
 
 		 270 aa  48.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2252  protein of unknown function DUF140  31.01 
 
 		 264 aa  48.1  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.497149  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0904  hypothetical protein  28.83 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0873  hypothetical protein  28.83 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4140  hypothetical protein  30.66 
 
 		 265 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3513  ABC transporter, inner membrane subunit  32.61 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2219  hypothetical protein  32.85 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2708  hypothetical protein  36.36 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1433  stas domain-containing protein  24.72 
 
 		 368 aa  47.8  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102521  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0092  MTA/SAH nucleosidase  32.97 
 
 		 368 aa  47.8  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0905172  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5535  hypothetical protein  32.61 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0394  hypothetical protein  32.61 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4535  hypothetical protein  29.79 
 
 		 258 aa  47.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2692  hypothetical protein  31.88 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327255  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0415  hypothetical protein  31.88 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177362  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0318  hypothetical protein  32.61 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.256439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0798  protein of unknown function DUF140  26.92 
 
 		 378 aa  47.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.737521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0648  ABC transporter, permease protein, putative  26.92 
 
 		 378 aa  47.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3121  hypothetical protein  28.36 
 
 		 258 aa  46.6  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1155  protein of unknown function DUF140  31.16 
 
 		 260 aa  46.2  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0333  hypothetical protein  31.88 
 
 		 255 aa  45.8  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3393  hypothetical protein  30.43 
 
 		 259 aa  46.2  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0342  hypothetical protein  31.88 
 
 		 255 aa  45.8  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610119 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2769  hypothetical protein  31.88 
 
 		 255 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3258  hypothetical protein  30.88 
 
 		 258 aa  45.8  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1871  protein of unknown function DUF140  38.46 
 
 		 264 aa  45.8  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106887 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12860  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, permease component  30.28 
 
 		 265 aa  45.8  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0037  hypothetical protein  26.07 
 
 		 382 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151467  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0864  hypothetical protein  29.63 
 
 		 265 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1612  hypothetical protein  29.17 
 
 		 384 aa  45.4  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  33.58 
 
 		 372 aa  45.8  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  25.73 
 
 		 375 aa  45.8  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1968  hypothetical protein  37.66 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0480  putative ABC transport system permease protein  31.01 
 
 		 264 aa  45.4  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.192748  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5204  hypothetical protein  37.18 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.217332 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1554  hypothetical protein  37.18 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0877  hypothetical protein  30.28 
 
 		 265 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.544199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  34.34 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2961  hypothetical protein  31.16 
 
 		 255 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3401  hypothetical protein  30 
 
 		 263 aa  44.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0481  hypothetical protein  34.07 
 
 		 368 aa  44.3  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4619  hypothetical protein  37.18 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4707  hypothetical protein  37.18 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  34.41 
 
 		 383 aa  44.3  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2886  ABC-type transporter inner membrane protein  28.79 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.201575  normal  0.797194 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1197  hypothetical protein  25.97 
 
 		 382 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5002  hypothetical protein  37.18 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  29.67 
 
 		 377 aa  44.3  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1030  hypothetical protein  25.84 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2748  hypothetical protein  28.17 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0282  hypothetical protein  30.53 
 
 		 260 aa  43.5  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  30.83 
 
 		 258 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0097  hypothetical protein  29.37 
 
 		 265 aa  43.5  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.180124  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  31.87 
 
 		 365 aa  43.5  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  29.67 
 
 		 377 aa  43.9  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0096  protein of unknown function DUF140  29.38 
 
 		 262 aa  43.5  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000150492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  30.83 
 
 		 258 aa  43.5  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0663  hypothetical protein  27.91 
 
 		 264 aa  43.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.680896  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0289  protein of unknown function DUF140  29.77 
 
 		 260 aa  43.1  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.16381  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0491  protein of unknown function DUF140  30.77 
 
 		 377 aa  43.5  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13825  normal  0.0614386 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1737  protein of unknown function DUF140  29.46 
 
 		 264 aa  43.5  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0701  hypothetical protein  32.26 
 
 		 261 aa  43.1  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1074  hypothetical protein  26.12 
 
 		 393 aa  43.1  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3239  protein of unknown function DUF140  31.88 
 
 		 255 aa  43.1  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205423  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2892  protein of unknown function DUF140  31.88 
 
 		 255 aa  43.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0442  putative ABC transport system permease protein  38.33 
 
 		 256 aa  42.7  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0373  hypothetical protein  27.1 
 
 		 379 aa  42.7  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1577  hypothetical protein  35.71 
 
 		 268 aa  42.7  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2812  hypothetical protein  28.85 
 
 		 374 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221535  normal  0.381774 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3649  protein of unknown function DUF140  30.53 
 
 		 260 aa  42.7  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0959  hypothetical protein  34.09 
 
 		 266 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2950  hypothetical protein  28.85 
 
 		 374 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0402  hypothetical protein  34.12 
 
 		 258 aa  42.7  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.738566  normal  0.849154 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0998  hypothetical protein  34.09 
 
 		 265 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0966  hypothetical protein  34.09 
 
 		 265 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4256  hypothetical protein  34.09 
 
 		 265 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>