31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0347 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0142  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  302  1.0000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432771  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4035  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  302  1.0000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.21997  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3635  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  302  1.0000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.046317 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1239  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  302  1.0000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0187368  normal  0.565368 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0411  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  302  1.0000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000404723 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0347  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  302  1.0000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100555  hitchhiker  0.00295944 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1825  hypothetical protein  86.13 
 
 
138 aa  228  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.651269 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2084  hypothetical protein  86.13 
 
 
138 aa  228  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.661206  normal  0.071134 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5259  transposase  30.97 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00757713  normal  0.158269 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5112  transposase  30.97 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483905 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3299  transposase  30.97 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.161029  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3019  transposase  30.97 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.935123  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1767  transposase  30.97 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.676201 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1182  transposase  30.97 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0634  transposase  30.97 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000359175  normal  0.423888 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0591  transposase  30.97 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.2665  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4172  ISSpo6, transposase orf A  33.62 
 
 
120 aa  48.9  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.311615  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5177  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.97 
 
 
262 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169691  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0093  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.21 
 
 
314 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2468  transposase  28.7 
 
 
120 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8592  ISSpo6, transposase orf A  38.05 
 
 
127 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6905  putative insertion sequence transposase protein  35.4 
 
 
126 aa  47  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5336  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.25 
 
 
318 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.904971  normal  0.192286 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1044  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.68 
 
 
315 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2724  Transposase IS630  33.59 
 
 
314 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.35712  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3698  putative insertion sequence transposase protein  33.62 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2836  transposase IS630  33.91 
 
 
315 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455996  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2359  transposase IS630  33.91 
 
 
315 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234253  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2582  transposase  34.68 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2585  transposase  35 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4704  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  32.52 
 
 
136 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0171761  normal  0.931612 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>