52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0083 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0083    100 
 
 		 231 bp  458  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0907531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0086  ABC transporter related  93.15 
 
 		 696 bp  315  2.9999999999999996e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0522946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4228  ABC transporter related  100 
 
 		 690 bp  81.8  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  0.619304 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6488  ABC transporter related protein  93.18 
 
 		 741 bp  63.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1471  ABC transporter related  88.33 
 
 		 699 bp  63.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1841  ABC transporter related  80.74 
 
 		 681 bp  61.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.656554  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0230  ABC transporter related  90 
 
 		 699 bp  60  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000298 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3711  ABC transporter related  91.3 
 
 		 708 bp  60  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.587902 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3299  ABC transporter related  92.86 
 
 		 693 bp  60  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0482255  normal  0.440753 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0222  ABC transporter related  90 
 
 		 699 bp  60  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4094  ABC transporter related  88.68 
 
 		 681 bp  58  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  84.72 
 
 		 663 bp  56  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0284  ABC transporter related  89.36 
 
 		 699 bp  54  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257552  hitchhiker  0.00000395766 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4468  ABC transporter related  100 
 
 		 777 bp  54  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0303  ABC transporter related  89.36 
 
 		 699 bp  54  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0537962  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2803  ABC transporter related  89.36 
 
 		 699 bp  54  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0893633  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3881  ABC transporter related  94.29 
 
 		 690 bp  54  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.770849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3410  ABC transporter, ATPase subunit  92.31 
 
 		 720 bp  54  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.072759  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2507  ABC transporter related  92.11 
 
 		 696 bp  52  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3684  ABC transporter related  100 
 
 		 2145 bp  52  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2827  ABC transporter related  92.11 
 
 		 732 bp  52  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0066  ABC transporter related  96.67 
 
 		 711 bp  52  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3699  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  100 
 
 		 693 bp  52  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752092 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4708  excinuclease ABC subunit A  96.67 
 
 		 3072 bp  52  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.879248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0206  ABC transporter related  88 
 
 		 699 bp  52  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.922054  unclonable  0.000000000007713 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  96.67 
 
 		 1440 bp  52  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4268  ABC transporter-related protein  96.67 
 
 		 717 bp  52  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2835  ABC transporter related  96.55 
 
 		 738 bp  50.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204247 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5234  ABC transporter ATP-binding protein  86.79 
 
 		 714 bp  50.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3826  ABC transporter related  88.89 
 
 		 678 bp  50.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4026  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 1860 bp  48.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000236263 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0399  ABC transporter related  90 
 
 		 3273 bp  48.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.961547 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1077  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  96.43 
 
 		 735 bp  48.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0335181  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2824  ABC transporter related protein  93.75 
 
 		 1716 bp  48.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.866997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2359  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  96.43 
 
 		 780 bp  48.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.504714 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0675  ABC efflux pump, fused inner membrane and ATPase subunits  93.75 
 
 		 1722 bp  48.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.018058  normal  0.847795 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0694  ABC transporter related  93.75 
 
 		 738 bp  48.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0382  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  100 
 
 		 1779 bp  48.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.260963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1382  polar amino acid ABC transporter ATPase  93.75 
 
 		 804 bp  48.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282532  normal  0.874451 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0180  ABC transporter related  85.71 
 
 		 696 bp  48.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0585319 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0236  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  89.74 
 
 		 2853 bp  46.1  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  84.13 
 
 		 750 bp  46.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3192  ABC transporter related  100 
 
 		 2106 bp  46.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678636  normal  0.719321 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4893  ABC transporter related  96.3 
 
 		 1101 bp  46.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1349  ABC transporter related  96.3 
 
 		 1827 bp  46.1  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1687  ABC transporter related  100 
 
 		 711 bp  46.1  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4759  ABC transporter related  91.43 
 
 		 831 bp  46.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0961  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  100 
 
 		 729 bp  46.1  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00749478  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  96.3 
 
 		 2130 bp  46.1  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1404  ABC transporter related  100 
 
 		 801 bp  46.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3459  ABC transporter related protein  89.74 
 
 		 777 bp  46.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0870635 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1836  ABC transporter related  100 
 
 		 711 bp  46.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.48298  normal  0.513308 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>